LOC110503987 (LOC106613003)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110503987
gene name LOC106613003
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048588.1
NCBI id CM023242.2
chromosome length 45930806
location 20950918 ~ 20961641 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021582701.2
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Function

NR:

description
uncharacterized protein LOC109909702 isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021582701.2 True 8015 mRNA 0.44 7 20950918 20961641

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110503985 NA coding downstream 9414 20934474 ~ 20941504 (-)
LOC110503976 NA coding downstream 198744 20724908 ~ 20752174 (-)
LOC110503975 LOC106613012 coding downstream 226188 20697761 ~ 20724730 (-)
LOC110503972 LOC106613013 coding downstream 274288 20666881 ~ 20676630 (-)
LOC110503970 LOC106613014 coding downstream 398770 20483265 ~ 20552148 (-)
LOC110503988 LOC106613001 coding upstream 68143 21029784 ~ 21064377 (-)
LOC110503989 LOC106613000 coding upstream 106005 21067646 ~ 21081164 (-)
LOC110503992 LOC106612997 coding upstream 127094 21088735 ~ 21111304 (-)
LOC110503990 LOC106612996 coding upstream 150430 21112071 ~ 21117277 (-)
LOC118944112 LOC106612996 coding upstream 155468 21117109 ~ 21126584 (-)
G1912454 NA non-coding downstream 701 20948535 ~ 20950217 (-)
G1912439 NA non-coding downstream 3751 20945023 ~ 20947167 (-)
G1912462 NA non-coding downstream 24509 20926170 ~ 20926409 (-)
G1912385 NA non-coding downstream 115515 20812821 ~ 20835403 (-)
G1912469 NA non-coding upstream 6806 20968447 ~ 20970558 (-)
G1912483 NA non-coding upstream 45526 21007167 ~ 21007641 (-)
G1912496 NA non-coding upstream 104389 21066030 ~ 21066341 (-)
G1913254 NA non-coding upstream 124184 21085825 ~ 21086059 (-)
G1913296 NA non-coding upstream 210002 21171643 ~ 21175302 (-)
G1911862 NA other downstream 489481 20460668 ~ 20461437 (-)
G1910996 NA other downstream 1259405 19691066 ~ 19691513 (-)
G1910651 NA other downstream 1459310 19490717 ~ 19491608 (-)
G1910539 NA other downstream 1617693 19332841 ~ 19333225 (-)
G1910398 NA other downstream 1788760 19160449 ~ 19162158 (-)
G1912470 NA other upstream 11038 20972679 ~ 20976236 (-)
G1913665 NA other upstream 901947 21863588 ~ 21864274 (-)
G1913663 NA other upstream 909612 21871253 ~ 21872149 (-)
G1915836 NA other upstream 2790202 23751843 ~ 23752463 (-)
LOC110504083 NA other upstream 5201824 26163462 ~ 26165289 (-)

Expression


Co-expression Network