G1911721


Basic Information

Item Value
gene id G1911721
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048588.1
NCBI id CM023242.2
chromosome length 45930806
location 20227628 ~ 20229328 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2186314
AatttagaatttgttcttaactgacttgcctagttaaataaaggttaaataaaatacattcaaattaaaataaaaaaacgtacTGTTTCACTCTGCTATAGTCtataatgtcctgttccactatgctataggctatcatgtcctgttccactatgctataggctatCATGTCCTGTTCTactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctataggctatcatgtcctgttccactatgctataggcaataatgtcctgttccactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctataggctataatgacctgttccactatgctataggCTGTAATGTCTtgttccactatgctataggctatcatgtcctgttccactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctataggCCATAATGGcctgttccactatgctatagtctataatgtcctgttccactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctataggctatcatgtcctgttccactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctataggctatcatgtcctgttccactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctataggctataatgACCTGTTTcactatgctataggctataatgTCCTATTTCACTATGCTATAGTCTATAATGTCCTGTTTCACTATGCTATAGGCCATAATGGcctgttccactatgctatagacaataatgtcctgttccactatgctataggctatactgtcctgttccactatgatataggctataatgtcctgttccactatACTATAGACAATAATGTCCTGTTCTACTATGCTAtatgctataggctataatgaccctatgctataggctataatgaccttatgctataggctataatggcctgttccactatgctataggctataatgtcctgttccactatgctatagtctataatgtcctgttccactatg

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106612129

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2186314 True 1198 lncRNA 0.38 2 20227628 20229328

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110503959 ncam1 coding downstream 167725 19941892 ~ 20059903 (-)
LOC101268962 LOC106581153 coding downstream 286316 19911119 ~ 19941312 (-)
LOC118944068 LOC106581084 coding downstream 317827 19907159 ~ 19909801 (-)
LOC110503955 LOC106613029 coding downstream 322858 19897004 ~ 19904770 (-)
pih1d2 pih1d2 coding downstream 330735 19894090 ~ 19896893 (-)
LOC110503963 LOC106613022 coding upstream 49664 20278992 ~ 20324314 (-)
LOC110503964 LOC106613021 coding upstream 100665 20315054 ~ 20405167 (-)
LOC110503968 NA coding upstream 226008 20455336 ~ 20458492 (-)
LOC110503970 LOC106613014 coding upstream 253937 20483265 ~ 20552148 (-)
LOC110503972 LOC106613013 coding upstream 437553 20666881 ~ 20676630 (-)
G1911321 NA non-coding downstream 131179 20096220 ~ 20096449 (-)
G1911307 NA non-coding downstream 140795 20086625 ~ 20086833 (-)
G1911069 NA non-coding downstream 415800 19811544 ~ 19811828 (-)
G1910997 NA non-coding downstream 534283 19693105 ~ 19693345 (-)
G1911744 NA non-coding upstream 30049 20259377 ~ 20264263 (-)
G1911844 NA non-coding upstream 198895 20428223 ~ 20428569 (-)
G1911842 NA non-coding upstream 219012 20448340 ~ 20448804 (-)
G1911841 NA non-coding upstream 220155 20449483 ~ 20450649 (-)
G1910996 NA other downstream 536115 19691066 ~ 19691513 (-)
G1910651 NA other downstream 736020 19490717 ~ 19491608 (-)
G1910539 NA other downstream 894403 19332841 ~ 19333225 (-)
G1910398 NA other downstream 1065470 19160449 ~ 19162158 (-)
LOC110503944 LOC106612932 other downstream 1254398 18968062 ~ 19185772 (-)
G1911862 NA other upstream 231340 20460668 ~ 20461437 (-)
G1912470 NA other upstream 743351 20972679 ~ 20976236 (-)
G1913665 NA other upstream 1634260 21863588 ~ 21864274 (-)
G1913663 NA other upstream 1641925 21871253 ~ 21872149 (-)
G1915836 NA other upstream 3522515 23751843 ~ 23752463 (-)

Expression


Co-expression Network