G1927540


Basic Information

Item Value
gene id G1927540
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048588.1
NCBI id CM023242.2
chromosome length 45930806
location 35379902 ~ 35381869 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2204157
CACGAGACAAAAGCGGTCCTCCAAAAAATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGCACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGCACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGCACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGCACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGCACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGCACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACAACACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTAATACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGCACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGCACCACATCATTGTGTACTACATCACATATGTTCAGATATGTGTACCACATCATTGCGTCCTCGCTCGGTGGGCGattcttgctagctgtcactc

Function

NR:

description
keratin-associated protein 10-8-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2204157 True 1968 TUCP 0.35 1 35379902 35381869

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110503239 LOC106613303 coding upstream 48219 35309975 ~ 35331683 (+)
LOC110503233 LOC106581478 coding upstream 380402 34990271 ~ 34999500 (+)
LOC110503229 LOC106613265 coding upstream 494016 34872699 ~ 34885886 (+)
LOC110503420 LOC106613261 coding upstream 713603 34661742 ~ 34666299 (+)
LOC110503419 LOC106581479 coding upstream 731729 34640176 ~ 34648173 (+)
LOC110503247 LOC106613308 coding downstream 659687 36041556 ~ 36065654 (+)
LOC110503248 LOC106613310 coding downstream 733018 36114887 ~ 36120364 (+)
LOC110503428 LOC106581496 coding downstream 742953 36124822 ~ 36126220 (+)
LOC110503249 LOC106613309 coding downstream 763155 36145024 ~ 36150522 (+)
wdr53 wdr53 coding downstream 781474 36163343 ~ 36166464 (+)
G1927533 NA non-coding upstream 22978 35356713 ~ 35356924 (+)
G1927530 NA non-coding upstream 29853 35349232 ~ 35350049 (+)
G1927524 NA non-coding upstream 44472 35335077 ~ 35335430 (+)
G1927523 NA non-coding upstream 44868 35334799 ~ 35335034 (+)
G1927490 NA non-coding upstream 46752 35332680 ~ 35333150 (+)
G1927541 NA non-coding downstream 723 35382592 ~ 35386937 (+)
G1927551 NA non-coding downstream 26835 35408704 ~ 35411261 (+)
G1927563 NA non-coding downstream 48538 35430407 ~ 35430863 (+)
G1927576 arhgef26 non-coding downstream 77606 35459475 ~ 35460252 (+)
G1927578 NA non-coding downstream 83468 35465337 ~ 35465644 (+)
LOC110503217 LOC106613270 other upstream 742779 34501674 ~ 34638201 (+)
G1926351 NA other upstream 1298167 34079223 ~ 34082461 (+)
G1925870 NA other upstream 1631649 33742659 ~ 33748253 (+)
G1925778 NA other upstream 1837970 33541189 ~ 33541932 (+)
G1925777 NA other upstream 1839421 33539938 ~ 33540481 (+)
G1928169 NA other downstream 759360 36141229 ~ 36170471 (+)
G1928170 NA other downstream 784757 36166626 ~ 36169329 (+)
G1928430 NA other downstream 1280005 36661874 ~ 36662497 (+)
LOC110503264 LOC106581527 other downstream 1676137 36985873 ~ 37079320 (+)
urb1 urb1 other downstream 1791737 37125695 ~ 37191160 (+)

Expression


Co-expression Network