LOC118944133


Basic Information

Item Value
gene id LOC118944133
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048589.1
NCBI id CM023243.3
chromosome length 47542702
location 38497981 ~ 38499513 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036962228.1
cccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccacccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccaccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccacccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccacccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccacccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccacccccccccccccctcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccctcccccccccctcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccctcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036962228.1 True 1533 mRNA 0.99 1 38497981 38499513

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110504248 LOC106592147 coding downstream 57507 38388826 ~ 38440474 (-)
LOC110504246 LOC106611364 coding downstream 582095 37907969 ~ 37915886 (-)
gcfc2 gcf coding downstream 705604 37774491 ~ 37792377 (-)
pfn4 pfn4 coding downstream 727492 37766006 ~ 37770489 (-)
LOC118944331 LOC106611362 coding downstream 733007 37744412 ~ 37788096 (-)
LOC118944132 NA coding upstream 83 38467126 ~ 38523197 (-)
LOC110505895 nrxn3 coding upstream 133925 38629768 ~ 39248183 (-)
LOC110505899 LOC106611374 coding upstream 924952 39424465 ~ 39427601 (-)
LOC110505906 LOC106603387 coding upstream 1468374 39967887 ~ 39980053 (-)
LOC110505909 cd93 coding upstream 1488322 39987835 ~ 39990813 (-)
G1981354 NA non-coding downstream 17996 38477364 ~ 38479985 (-)
G1981349 NA non-coding downstream 28774 38468783 ~ 38469207 (-)
G1981338 NA non-coding downstream 48855 38448923 ~ 38449126 (-)
G1980739 NA non-coding downstream 52154 38377225 ~ 38445827 (-)
G1980760 NA non-coding downstream 59575 38437413 ~ 38438406 (-)
G1981363 NA non-coding upstream 23987 38523500 ~ 38523724 (-)
G1981372 NA non-coding upstream 33077 38532590 ~ 38532937 (-)
G1981381 NA non-coding upstream 56671 38556184 ~ 38556579 (-)
G1981392 NA non-coding upstream 81336 38580849 ~ 38581066 (-)
G1981394 NA non-coding upstream 83050 38582563 ~ 38582788 (-)
G1980619 LOC106611366 other downstream 293818 38203441 ~ 38204163 (-)
G1979813 NA other downstream 1159099 37337746 ~ 37338882 (-)
G1979607 NA other downstream 1532262 36965174 ~ 36965719 (-)
LOC110504237 LOC106611328 other downstream 2150926 36325431 ~ 36370245 (-)
G1979142 NA other downstream 2281751 36211946 ~ 36216230 (-)
G1981678 NA other upstream 536774 39036287 ~ 39038944 (-)
G1981964 NA other upstream 1057107 39556620 ~ 39569809 (-)
G1982029 NA other upstream 1120352 39619865 ~ 39620209 (-)
G1982657 emilin1 other upstream 1352670 39852183 ~ 39858120 (-)
G1982679 NA other upstream 1385573 39885086 ~ 39905809 (-)

Expression


Co-expression Network