LOC118944132


Basic Information

Item Value
gene id LOC118944132
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048589.1
NCBI id CM023243.3
chromosome length 47542702
location 38467126 ~ 38523197 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>LOC118944132
cccccctcccccccccccccccccccccccccccccacccccccccccacacccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccgcccccccccccccccccccccacccccccccccccccccccccccccccccccccccccacacccccccccccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccccgcccccccccccccccccccctgccccccccccccccccccccccccccccccccccacccccccccccccccccccccccccccccacccccccccccccccccccccccccccccgccccccccccccccccccccccccccccctccccccgccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccctccccccccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccacccccccacccccccccccccccccccccccccccccccccccccccacccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccgccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccgcccccccccccccacccccccccccccccccccccccccccccgcccccccccccccccacccccccccccccccccccccccccccccccccctccccccaacccccccccccccccccccccccgcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccgcccccccccccccccccccccccccccccccccctcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccacccccccccccccccccccccccccacccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccaccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc
>TU2265040
cccccccccccccccaaacccccccccccccccccccaccccccgcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccgcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
LOC118944132 False 1499 mRNA 0.98 2 38499596 38501309
TU2265040 True 287 lncRNA 0.99 3 38467126 38523197

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118944133 NA coding downstream 83 38497981 ~ 38499513 (-)
LOC110504248 LOC106592147 coding downstream 59122 38388826 ~ 38440474 (-)
LOC110504246 LOC106611364 coding downstream 583710 37907969 ~ 37915886 (-)
gcfc2 gcf coding downstream 707219 37774491 ~ 37792377 (-)
pfn4 pfn4 coding downstream 729107 37766006 ~ 37770489 (-)
LOC110505895 nrxn3 coding upstream 132129 38629768 ~ 39248183 (-)
LOC110505899 LOC106611374 coding upstream 923156 39424465 ~ 39427601 (-)
LOC110505906 LOC106603387 coding upstream 1466578 39967887 ~ 39980053 (-)
LOC110505909 cd93 coding upstream 1486526 39987835 ~ 39990813 (-)
LOC118944315 NA coding upstream 1636117 40137426 ~ 40140566 (-)
G1981354 NA non-coding downstream 19611 38477364 ~ 38479985 (-)
G1981349 NA non-coding downstream 30389 38468783 ~ 38469207 (-)
G1981338 NA non-coding downstream 50470 38448923 ~ 38449126 (-)
G1980739 NA non-coding downstream 53769 38377225 ~ 38445827 (-)
G1980760 NA non-coding downstream 61190 38437413 ~ 38438406 (-)
G1981363 NA non-coding upstream 22191 38523500 ~ 38523724 (-)
G1981372 NA non-coding upstream 31281 38532590 ~ 38532937 (-)
G1981381 NA non-coding upstream 54875 38556184 ~ 38556579 (-)
G1981392 NA non-coding upstream 79540 38580849 ~ 38581066 (-)
G1981394 NA non-coding upstream 81254 38582563 ~ 38582788 (-)
G1980619 LOC106611366 other downstream 295433 38203441 ~ 38204163 (-)
G1979813 NA other downstream 1160714 37337746 ~ 37338882 (-)
G1979607 NA other downstream 1533877 36965174 ~ 36965719 (-)
LOC110504237 LOC106611328 other downstream 2152541 36325431 ~ 36370245 (-)
G1979142 NA other downstream 2283366 36211946 ~ 36216230 (-)
G1981678 NA other upstream 534978 39036287 ~ 39038944 (-)
G1981964 NA other upstream 1055311 39556620 ~ 39569809 (-)
G1982029 NA other upstream 1118556 39619865 ~ 39620209 (-)
G1982657 emilin1 other upstream 1350874 39852183 ~ 39858120 (-)
G1982679 NA other upstream 1383777 39885086 ~ 39905809 (-)
LOC118944331 LOC106611362 coding downstream 702152 37744412 ~ 37788096 (-)
G1980707 NA non-coding downstream 90198 38376529 ~ 38376928 (-)
G1980697 NA non-coding downstream 98184 38368676 ~ 38368942 (-)

Expression


Co-expression Network