G1971889


Basic Information

Item Value
gene id G1971889
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048589.1
NCBI id CM023243.3
chromosome length 47542702
location 30029278 ~ 30031807 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2254280
ACAAAAGACTCCAGCTATGAAGCTTAGTTCTAATTGTGCCTACTATAAGTGTCCTGTCTGGCTGGTCCTGGATATTGAGTCAGTGTGGCTTTAGTGGAGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGAATGAGTGTCTGGGTATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGTATGGGTGTCTGGATATTGAGTAAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTTGAAGTTGTGTGTGAGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGAGTGTTTGGATATCGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTTGATATTGTGTAAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTTGAAGTTGTGTGTGAGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGAATGGATGTCTTGATATTGTGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTTGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGATATAGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGTTGCTCATCTATTCCCTTTAACATTCACTACTGTTGCCCAAGTCCTAGTACTacgtcataagtagtgcactacatagggaatagggtgccatttgggacacagactagTCCCTCCCCCGCATTGCATCTAGGGCTGGTGATTTATGGGCACAGAGGGCTGCAAGGAAGGACAGTTAACGCACTAGGCTGGAAATTGATGAGTTGGCTCGGATGCTCTGGTCTCTTGACACAGTGCAGTAACTGTTACAGCTGCTGGAGGATGGGCTACTACTGTAATTACGCCTGCCAGGCCTTttggccctggtcagaagtaagTATATgaaataaggtgccatttaggatgcacagTGCACTAGCCTGAGCCTCCGTCTCTCACTGCTGAGGATGGAATAGGGCTCCTAGACTATTCCACACAGGATAGATGACAGAGTAGATACTAGCTACAAACGACCAGAACATTACAATAGATTTGGCTGTGATGTTTGGGTTCAGTCACCAGCACAACAGTCAAGGTCATTTGGGCGATAGTAGATTCTTTGTTTTATTTCTCTGACTGAATTAGCCTTGTGATGAATGGATTTAATAAAACACG
>TU2254281
ACAAAAGACTCCAGCTATGAAGCTTAGTTCTAATTGTGCCTACTATAAGTGTCCTGTCTGGCTGGTCCTGGATATTGAGTCAGTGTGGCTTTAGTGGAGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGAATGAGTGTCTGGGTATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGTATGGGTGTCTGGATATTGAGTAAGTGTTGAAGGTGTGTAAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGTGGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTTGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTTAAGGTGTGTGTGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGAGTGTTTGGATATCGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTTGATATTGTGTAAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTTGAAGTTGTGTGTGAGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGAGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGAGGAATGGATGTCTTGATATTGTGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTTGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGATATAGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGATATTGAGTCAGTGTTGAAGGTGTGTGTGAGGAATGGGTGTCTGGTTGCTCATCTATTCCCTTTAACATTCACTACTGTTGCCCAAGTCCTAGTACTacgtcataagtagtgcactacatagggaatagggtgccatttgggacacagactagTCCCTCCCCCGCATTGCATCTAGGGCTGGTGATTTATGGGCACAGAGGGCTGCAAGGAAGGACAGTTAACGCACTAGGCTGGAAATTGATGAGTTGGCTCGGATGCTCTGGTCTCTTGACACAGTGCAGTAACTGTTACAGCTGCTGGAGGATGGGCTACTACTGTAATTACGCCTGCCAGGCCTTttggccctggtcagaagtaagTATATgaaataaggtgccatttaggatgcacagTGCACTAGCCTGAGCCTCCGTCTCTCACTGCTGAGGATGGAATAGGGCTCCTAGACTATTCCACACAGGATAGATGACAGAGTAGATACTAGCTACAAACGACCAGAACATTACAATAGATTTGGCTGTGATGTTTGGGTTCAGTCACCAGCACAACAGTCAAGGTCATTTGGGCGATAGTAGATTCTTTGTTTTATTTCTCTGACTGAATTAGCCTTGTGATGAATGGATTTAATAAAACACG

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106590458, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2254280 False 1475 lncRNA 0.45 8 30029278 30031807
TU2254281 True 1651 lncRNA 0.45 8 30029278 30031807

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110505772 NA coding upstream 88108 29940079 ~ 29941170 (+)
LOC110505767 LOC106611206 coding upstream 122878 29888717 ~ 29906400 (+)
LOC110505766 LOC106611201 coding upstream 142919 29859648 ~ 29886359 (+)
LOC110505764 LOC106611199 coding upstream 504202 29522690 ~ 29525076 (+)
LOC110505763 ehd4 coding upstream 577656 29408807 ~ 29451622 (+)
LOC110505775 LOC106611224 coding downstream 60648 30092455 ~ 30330735 (+)
LOC110505776 LOC106611225 coding downstream 304728 30336535 ~ 30846679 (+)
LOC110505785 LOC106611232 coding downstream 960492 30992299 ~ 31000393 (+)
LOC110505784 LOC106611231 coding downstream 968709 31000516 ~ 31040820 (+)
LOC118944303 LOC106611235 coding downstream 1048872 31080679 ~ 31082541 (+)
G1971879 NA non-coding upstream 32359 29995972 ~ 29996919 (+)
G1971831 LOC100380626 non-coding upstream 80853 29947592 ~ 29948425 (+)
G1971833 NA non-coding upstream 86128 29942143 ~ 29943150 (+)
G1971840 NA non-coding upstream 89630 29939360 ~ 29939648 (+)
G1971652 NA non-coding upstream 182858 29808077 ~ 29846420 (+)
G1971858 NA non-coding downstream 46312 30078119 ~ 30078514 (+)
G1971900 NA non-coding downstream 52717 30084524 ~ 30086043 (+)
G1971918 NA non-coding downstream 72753 30104560 ~ 30112578 (+)
G1971961 NA non-coding downstream 138861 30170668 ~ 30179444 (+)
G1971986 NA non-coding downstream 177386 30209193 ~ 30209559 (+)
G1971104 NA other upstream 550895 29474120 ~ 29478383 (+)
G1970001 NA other upstream 1615359 28413600 ~ 28413919 (+)
LOC110505721 ccdc88c other upstream 2940962 26988390 ~ 27099710 (+)
G1967965 NA other upstream 3373942 26654905 ~ 26655336 (+)
G1967032 NA other upstream 4195957 25831576 ~ 25833321 (+)
G1972242 NA other downstream 598521 30630328 ~ 30632667 (+)
G1972244 NA other downstream 605247 30637054 ~ 30655039 (+)
G1972245 NA other downstream 627597 30659404 ~ 30679995 (+)
G1972252 NA other downstream 663426 30695233 ~ 30696314 (+)

Expression


Co-expression Network