G1972245


Basic Information

Item Value
gene id G1972245
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048589.1
NCBI id CM023243.3
chromosome length 47542702
location 30659404 ~ 30679995 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2254663
cccccatgtcgccacctgtctccttctgtctcccccatgtctccacctgtctccctctgttttccccatttcaccacctgtctccctctgtctcccccatgttaccacctgtctccatctgtctcccccatgtcaccacttgtctcccccatgtcaccacctgtctcccccatgttaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcgccacctgtctccctccttctcccccatgtcgccacctgtctccctccttctcccccatgtcgccacctgtctccctttgtctccccatgtcaacacctgtctcccccatttcaccacttgtctccctcattctcccccatgtcaccgcctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctcattcTACCCaatttcaccacctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctatctcccccatgtcaccacctgtctccctccttctcccccatgtcgccacctgtctccctctgtctaccccatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcactatctatctccctctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctactgtcttccccatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcaccacctctcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcaccacttgtctccctccttctcccccatgtcgccacctgtctccctctgtctcccccatgtcaccacctgtcaccctctgtctcccccatgtcactatctatctccctctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctactgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcaccaactctcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctccttctcccccatgtcaccacctgtttccctccttctccccaatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcaccacctgtttccctccttctccccaatgtcaccacctgtctccctctgtctccctccttgtcaccacctgtctccctccttgtcaccacctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctgtttcccccatgtcaccacttgtctccccatgtcaccacctgtctctctctgtctcccccatgtacccacctgcctcccccatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcactatctgtctccctctgtctcccccatgtcgccacctgtctcctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcgccacctgtctccctccttctcccccatgtcgccacatGTCTCCcaccttctcccccatgtcaccacctgtctccctccttctcccccatgttgCCACTTGTCTCCctttgtctcccccatgtcactacctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcactacctgtctccctcattctcccccatgtcaacacctgtctccctctgtctccccatttcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcatcacctgtctccctctgtctccccatgtcaccacctgtctccctctttctcccccatgtcaccacctgtctcccccatgtctccatctgtctcccccatgtcaccacctatctccctccttctcccccatgtcaccacctgtctccctccttctcccccatgtcaccacctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcagcacctgtctccctctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctgtctccctccttgtcaccacctgtctccctccttgtcaccgcctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctatctcccccatgtcaccacctgtctccctccttctcccccatgtcgccacctgtctccctctgtctcccccatgtcaccacctgtctccctctgtctcccccatgtcactatctatctccctctttctcccccatgtcaccacctgtctccctactgtcttccccatgtcaccacctgtctccctc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2254663 True 2252 TUCP 0.59 3 30659404 30679995

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110505775 LOC106611224 coding upstream 328669 30092455 ~ 30330735 (+)
LOC110505773 LOC106611209 coding upstream 582110 30007361 ~ 30077294 (+)
LOC110505772 NA coding upstream 718234 29940079 ~ 29941170 (+)
LOC110505767 LOC106611206 coding upstream 753004 29888717 ~ 29906400 (+)
LOC110505766 LOC106611201 coding upstream 773045 29859648 ~ 29886359 (+)
LOC110505785 LOC106611232 coding downstream 312304 30992299 ~ 31000393 (+)
LOC110505784 LOC106611231 coding downstream 320521 31000516 ~ 31040820 (+)
LOC118944303 LOC106611235 coding downstream 400684 31080679 ~ 31082541 (+)
LOC110505788 LOC106611236 coding downstream 423289 31103284 ~ 31109026 (+)
LOC110505789 LOC106611239 coding downstream 534828 31214823 ~ 31220599 (+)
G1972236 NA non-coding upstream 45427 30613660 ~ 30613977 (+)
G1972230 NA non-coding upstream 50758 30607840 ~ 30608646 (+)
G1972227 NA non-coding upstream 54052 30605111 ~ 30605352 (+)
G1972215 NA non-coding upstream 71692 30587414 ~ 30587712 (+)
G1972211 NA non-coding upstream 74921 30584266 ~ 30584483 (+)
G1972249 NA non-coding downstream 10523 30690518 ~ 30690802 (+)
G1972266 NA non-coding downstream 32599 30712594 ~ 30712849 (+)
G1972270 NA non-coding downstream 43707 30723702 ~ 30723990 (+)
G1972272 NA non-coding downstream 44785 30724780 ~ 30724981 (+)
G1972287 NA non-coding downstream 73337 30753332 ~ 30753610 (+)
G1972244 NA other upstream 4365 30637054 ~ 30655039 (+)
G1972242 NA other upstream 26737 30630328 ~ 30632667 (+)
G1971104 NA other upstream 1181021 29474120 ~ 29478383 (+)
G1970001 NA other upstream 2245485 28413600 ~ 28413919 (+)
G1972252 NA other downstream 15238 30695233 ~ 30696314 (+)
G1973126 NA other downstream 477523 31157518 ~ 31157736 (+)
G1973193 NA other downstream 523620 31203615 ~ 31203991 (+)
G1973369 NA other downstream 707483 31387478 ~ 31387736 (+)
G1973635 NA other downstream 1038529 31718524 ~ 31718968 (+)

Expression


Co-expression Network