G1978821


Basic Information

Item Value
gene id G1978821
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048589.1
NCBI id CM023243.3
chromosome length 47542702
location 35595125 ~ 35598255 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2262115
cctggtcacacctccatccttagtgcccggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggccacacctccatccctagtcagacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctctatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgtctggtcacacctccatccttagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccttagtgcccggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatcccaagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctctatccctagtgtctggtcacacctccatccccagtgtctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggccacacctccatccctagtcagacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctctatccctagtgtctggtcacacctccatccttagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatctctagtgcctggtcacacctccatccttaGTGTCTAGTCACACCtctatccctagtgcctggccacacctccatccctagtcagacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctctatccctagtgtctggtcacacctccatccttagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccttagtgtctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatctctagtgcctggtcacacctccatccttaGTGTCTAGTCACACCTCTATCCCTAGTGCCCGGTCACACCtctatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgcctagTCACACCTCAATCcttagtgtctggtcacacctccatccttagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctctatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccattcctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcaaaCCTCCAtctctagtgcctggtcacacctccatccttagtgcccggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctctatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctctatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggccacacctccatccctagtcagacctccatccctagtgcctggccacacctccatccctagtcagacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctctatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgtctggtcacacctccatccttagtgcctggtcacacctccatccttagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccttagtgcccggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccttaGTGCCCGGTCACACCtctatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcttggtcacacctccatcccaagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccccagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggccacacctccatccctagtcagacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctctatccctagtgtctggtcacacctccatccttagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccttagtgtctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatctctagtgcctggtcacacctccatccttagtgtctggtcacacctctaTCCCTAGTGCCCGGTCACACCtctatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccttagtgtctggtcacacctccatccttagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctctatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccattcctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggtcaaaCCTCCAtctctagtgcctggtcacacctccatccttagtgcccggtcacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatctctagtgcctggccacacctccatccctagtcagacctccatccctagtgccttgtcaaacctccatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgtctggtcacacctccatccctagtgtctggtcacacccccatcgctagtgcctggtcacacctccatccctagtgcctggccacacctccatccctagtgcctggtcacacctccatctctagtgcctgg

Function

NR:

description
PREDICTED: extensin-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2262115 True 3131 lncRNA 0.58 1 35595125 35598255

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118944372 NA coding downstream 91316 35501929 ~ 35503809 (-)
LOC110505834 LOC106611287 coding downstream 192704 35399388 ~ 35402421 (-)
LOC110505831 LOC106611283 coding downstream 453420 35116484 ~ 35141705 (-)
LOC110505829 LOC106611279 coding downstream 594681 34970065 ~ 35000444 (-)
LOC118944135 NA coding downstream 633842 34959801 ~ 34961283 (-)
LOC118944362 NA coding upstream 26411 35624666 ~ 35691185 (-)
LOC110505835 LOC106611306 coding upstream 236048 35834303 ~ 35848927 (-)
LOC118944267 NA coding upstream 431889 36030144 ~ 36031263 (-)
LOC110504236 LOC106611337 coding upstream 433502 36031757 ~ 36093649 (-)
LOC110504237 LOC106611328 coding upstream 727176 36325431 ~ 36370245 (-)
G1978820 NA non-coding downstream 52 35594410 ~ 35595073 (-)
G1978819 NA non-coding downstream 2370 35591448 ~ 35592755 (-)
G1978818 NA non-coding downstream 5348 35588515 ~ 35589777 (-)
G1978817 NA non-coding downstream 10131 35584773 ~ 35584994 (-)
G1978815 NA non-coding downstream 11466 35583274 ~ 35583659 (-)
G1978823 NA non-coding upstream 6828 35605083 ~ 35605447 (-)
G1978827 NA non-coding upstream 13244 35611499 ~ 35611718 (-)
G1978877 NA non-coding upstream 80712 35678967 ~ 35679211 (-)
G1978882 NA non-coding upstream 89736 35687991 ~ 35688209 (-)
G1978885 NA non-coding upstream 95579 35693834 ~ 35694076 (-)
G1977346 NA other downstream 494147 35027100 ~ 35100978 (-)
G1977392 NA other downstream 538199 35053050 ~ 35056926 (-)
G1977226 NA other downstream 718944 34875385 ~ 34876181 (-)
G1977046 NA other downstream 1116567 34477620 ~ 34478809 (-)
G1979142 NA other upstream 613691 36211946 ~ 36216230 (-)
G1979607 NA other upstream 1366919 36965174 ~ 36965719 (-)
G1979813 NA other upstream 1739491 37337746 ~ 37338882 (-)
G1980619 LOC106611366 other upstream 2605186 38203441 ~ 38204163 (-)

Expression


Co-expression Network