G1984581


Basic Information

Item Value
gene id G1984581
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048589.1
NCBI id CM023243.3
chromosome length 47542702
location 42964604 ~ 42975274 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2268998
aaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatggcacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatggcacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacacgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagc
>TU2268994
gtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacacgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatggcacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatggcacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacccagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttatccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacacgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttatccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacacgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacat
>TU2268996
gtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacacgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatggcacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatggcacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacccagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttatccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacacgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttatccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacacgacacagagtacaaggtgtgggatgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacagagtacaaggtgtgggatgttagccctctacatgacacat

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106608344 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2268998 False 436 lncRNA 0.50 3 42964604 42974160
TU2268994 False 998 TUCP 0.50 3 42967416 42975274
TU2268996 True 998 TUCP 0.50 3 42967416 42975274

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110504345 LOC106611472 coding upstream 76460 42868981 ~ 42888144 (+)
trip11 trip11 coding upstream 109335 42797481 ~ 42855269 (+)
golga5 golga5 coding upstream 174633 42768443 ~ 42789971 (+)
LOC110504284 LOC106611474 coding upstream 197254 42750509 ~ 42767350 (+)
LOC110505990 LOC106611473 coding upstream 217539 42739235 ~ 42747065 (+)
vti1b vti1b coding downstream 85848 43060008 ~ 43073929 (+)
LOC110506001 rbm25 coding downstream 136452 43110612 ~ 43152565 (+)
LOC110505947 LOC106591369 coding downstream 401934 43376094 ~ 43395316 (+)
plekhd1 plekhd1 coding downstream 436795 43410955 ~ 43436311 (+)
LOC118944278 LOC106591229 coding downstream 495535 43469695 ~ 43470614 (+)
G1984580 NA non-coding upstream 3503 42960784 ~ 42961101 (+)
G1984578 NA non-coding upstream 5049 42953625 ~ 42959555 (+)
G1984577 NA non-coding upstream 18068 42946279 ~ 42946536 (+)
G1984575 NA non-coding upstream 26435 42937466 ~ 42938169 (+)
G1984569 NA non-coding upstream 54526 42908897 ~ 42910078 (+)
G1984582 NA non-coding downstream 4174 42978334 ~ 42978665 (+)
G1984583 NA non-coding downstream 4923 42979083 ~ 42979285 (+)
G1984586 NA non-coding downstream 8614 42982774 ~ 42983480 (+)
G1984592 NA non-coding downstream 43325 43017485 ~ 43018313 (+)
G1984596 NA non-coding downstream 59452 43033612 ~ 43034355 (+)
LOC110505989 NA other upstream 236655 42722700 ~ 42728639 (+)
cn112 cn112 other upstream 510781 42419107 ~ 42454007 (+)
G1983836 NA other upstream 701890 42262227 ~ 42262714 (+)
G1983777 NA other upstream 731700 42232240 ~ 42232904 (+)
G1983721 NA other upstream 860708 42063025 ~ 42103896 (+)
G1984431 NA other downstream 68521 43042681 ~ 43043318 (+)
G1984764 NA other downstream 497396 43471556 ~ 43472009 (+)
G1984797 NA other downstream 599883 43574043 ~ 43574613 (+)
G1984803 NA other downstream 639388 43613548 ~ 43635501 (+)
G1984807 NA other downstream 653832 43627992 ~ 43628808 (+)

Expression


Co-expression Network