LOC110527008 (pex16)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110527008
gene name pex16
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048590.1
NCBI id CM023244.2
chromosome length 51113553
location 50744617 ~ 50803181 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>TU2331745
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Function

symbol description
pex16 Predicted to be involved in peroxisome organization. Predicted to be located in membrane and peroxisome. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in peroxisomal membrane. Human ortholog(s) of this gene implicated in peroxisomal biogenesis disorder and peroxisome biogenesis disorder 8A. Orthologous to human PEX16 (peroxisomal biogenesis factor 16).

NR:

description
PREDICTED: peroxisomal membrane protein PEX16-like, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036964508.1 False 4767 mRNA 0.47 10 50791518 50803181
XR_005039903.1 False 4916 mRNA 0.47 11 50791523 50803181
XM_036964507.1 False 4868 mRNA 0.47 11 50791537 50803181
TU2331748 False 933 lncRNA 0.38 2 50744617 50801846
TU2331745 False 1435 TUCP 0.50 6 50797298 50801241
TU2331746 True 1392 TUCP 0.50 7 50797298 50801241

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC118944475 NA coding upstream 192114 50544080 ~ 50599404 (+)
LOC110506997 LOC106562470 coding upstream 326697 50463625 ~ 50464821 (+)
LOC110506995 LOC106562863 coding upstream 344737 50440567 ~ 50446781 (+)
LOC110506216 traf6 coding upstream 419775 50360511 ~ 50373096 (+)
LOC118936604 LOC106562554 coding downstream 31029 50834210 ~ 50855631 (+)
LOC110512921 LOC106562604 coding downstream 71727 50874908 ~ 50884663 (+)
LOC110518959 LOC106587739 coding downstream 97995 50901176 ~ 50996758 (+)
LOC110519415 tmod3 coding downstream 253943 51057124 ~ 51100470 (+)
G2038239 s22ai non-coding upstream 10836 50779187 ~ 50780682 (+)
G2038236 NA non-coding upstream 30582 50760310 ~ 50760936 (+)
G2038233 NA non-coding upstream 31066 50757179 ~ 50760452 (+)
G2038235 NA non-coding upstream 31616 50757792 ~ 50759902 (+)
G2038232 NA non-coding upstream 32485 50756864 ~ 50759033 (+)
G2038255 NA non-coding downstream 17280 50820461 ~ 50821088 (+)
G2038264 NA non-coding downstream 57917 50861098 ~ 50861368 (+)
G2038283 NA non-coding downstream 120684 50923865 ~ 50926423 (+)
G2038286 NA non-coding downstream 129327 50932508 ~ 50933041 (+)
G2038287 NA non-coding downstream 129432 50932613 ~ 50933127 (+)
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Expression


Co-expression Network