G1994112


Basic Information

Item Value
gene id G1994112
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048590.1
NCBI id CM023244.2
chromosome length 51113553
location 7475355 ~ 7477201 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2282159
ccctacctcagagtactatcaaccctaaccctaaccctacctcagattactatcaaccctaactctacctcagagtactatcaacccaACCTCTACttcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaaccccacctcagagtactatcaacccaacctctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaacctctacctcagagtactatcaacccaacctctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaacctctacctcagagtactatcaacccaacctctacctcagagtactatcaacccaacctctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaacctctacctcagagtactatcaacc
>TU2282161
atcaaccctaaccctaaccctaaccctagctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaaacctacctcagagtactatcaaccctaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaacctctacctcagagtactatcaaccctaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaaccctaaccctacctcagattactatcaaccctaactctacctcagagtactatcaacccaACCTCTACttcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaaccccacctcagagtactatcaacccaacctctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaacctctacctcagagtactatcaacccaacctctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaacctctacctcagagtactatcaacccaacctctacctcagagtactatcaacccaacctctacctcagagtactatcaaccctaaccctacctcagagtactatcaaccctaacctctacctcagagtactatcaacc

Function

NR:

description
PREDICTED: extensin-1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2282159 False 537 lncRNA 0.46 2 7475355 7476184
TU2282161 True 741 lncRNA 0.46 3 7475355 7477201

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118944525 NA coding downstream 8735 7465120 ~ 7466620 (-)
LOC110526832 LOC106587935 coding downstream 35752 7406157 ~ 7439603 (-)
LOC110527022 LOC106587927 coding downstream 295676 7175082 ~ 7179679 (-)
LOC110507001 LOC106587953 coding downstream 388404 7068612 ~ 7086951 (-)
LOC110506999 LOC105026498 coding downstream 413804 7048931 ~ 7061551 (-)
LOC110526835 LOC105026486 coding upstream 80810 7558011 ~ 7564844 (-)
LOC110526838 LOC106587956 coding upstream 89415 7566616 ~ 7572156 (-)
LOC110526837 LOC106592039 coding upstream 102196 7579397 ~ 7596912 (-)
LOC118944548 NA coding upstream 119953 7597154 ~ 7602431 (-)
LOC118936603 LOC106587968 coding upstream 170197 7647283 ~ 7665132 (-)
G1994111 NA non-coding downstream 7584 7467065 ~ 7467771 (-)
G1994098 NA non-coding downstream 21454 7446801 ~ 7453901 (-)
G1994084 NA non-coding downstream 69887 7405203 ~ 7405468 (-)
G1994082 NA non-coding downstream 74635 7400236 ~ 7400720 (-)
G1994077 NA non-coding downstream 84952 7390186 ~ 7390403 (-)
G1994115 NA non-coding upstream 6872 7484073 ~ 7488409 (-)
G1994116 NA non-coding upstream 7053 7484254 ~ 7485915 (-)
G1994117 NA non-coding upstream 11624 7488825 ~ 7490190 (-)
G1994119 NA non-coding upstream 24720 7501921 ~ 7502416 (-)
G1994110 NA non-coding upstream 75450 7552651 ~ 7553010 (-)
G1994075 NA other downstream 85787 7389245 ~ 7389568 (-)
LOC118936596 LOC106591161 other downstream 1031126 6391414 ~ 6444276 (-)
G1992485 NA other downstream 1486582 5986431 ~ 5988773 (-)
G1992375 NA other downstream 1766671 5708268 ~ 5708684 (-)
G1991846 NA other downstream 2215573 5257722 ~ 5259782 (-)
LOC110526845 LOC106592787 other upstream 272094 7744309 ~ 7751407 (-)
LOC118944558 LOC106595801 other upstream 326643 7802643 ~ 7809933 (-)
LOC110515105 LOC106593850 other upstream 393981 7863456 ~ 7873075 (-)
LOC118944463 LOC106562776 other upstream 623119 8096974 ~ 8105982 (-)

Expression


Co-expression Network