G1994204


Basic Information

Item Value
gene id G1994204
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048590.1
NCBI id CM023244.2
chromosome length 51113553
location 7860030 ~ 7861483 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2282299
ATAGCCTACATTATACCACTGCAGCCCATGTCTGTAAAACTGGGCTTCTGCTTCTTATACCTCTGGAAACAACCACAGGGTCATGTCATGGAATTTGTAAGTTATTTCATTTGTCTGTTTTTATTTTCAGGACAAAAAACTATGAATGTCTATGGTATTAGTTTTGTATCTCCTTTTTGTGGAGCTGATTGTTTTAAGCGTTTAGCTTTGCTAAAAAGAACAGcaaggagcactcagttctattccagaacacacgtaaagaacaccaaggagcactcagttctattccagaacacacgtaaagaacaccaaggagcactcagttctattccagaacCCAAGTAAAGAACACCAAGGAATTATTTTCCAGAAACCAGCTAAAGACAAACTATTGAGAGCCAATACTCATTCTGACTGGTCTGAATGTTCACTTAAAATAAATATTCCCTGGTATTAGTTTCTACCACTATTTAACAACACATGTATCTTATTGTGTGGTTAAATCAGACCCAGTTCTGattgttattttgttgtgttgAGCGAGAGCTCCCTTGGTGGGCTTCAAGCTCCCCTGATATCAGCGCTACTGTATTAATGTGATGTGACTGAGCTGAAGGCCTGAGCTTGCCTTGCCTCACGTGGGATCCTTTGTCTTCGATGCCAGGTCCATGGACGTTATCGGCcgcgttcccctgctcagacattGCTGGACTCAACCAATGGTTGAGTGCCACTTCATTGACTGTGCTGTCGGGCACCAGACCGATATAACATGATGTGGTTATCTGATCGGTTAAACACCTATCCAGGCGTCGTAAGATCTGGAATGCATCAGCAACATCTGGCCAGAGGAACACACTCATATATAAAATGACAGGCCTCTGAGATACACTACCATGGCAACCTTAATTCATACTGTCAGGCAGCCAAAGTTGACTAATCACAGCAGCTTCCTCCTTTCCTATGTTTGACAAGGAATGTGTGTGATTGGCTGTAGAGGAGAAAGGTGGTGTTGTGGGCGTGCCTTAGATGGGTTTTCGAATAGAACTCACCTGGGCTGCGTTCAGCAGGGCAAGACGTTGTGGAATTGTGTCAGCTCTGTTCATAGCATTTCTCTCTGCAGTGTTCAGTGTATTACAACCTGCTGAACGCAGCCCTGCTGAAGTTAGACTTCTGTAGACTGCATTTTAATCATCACTCTCTTATCATTTGTATTGCATGAATGTTGCACATTTTATGTTCTGGAAATAATCTGGGATTCACAGATTATTTAttaaaaacaacattaaaacTGACGTCGTCTAACACTTTCTATAATTTACATTTTGAAATGTATTAGACACTGATCTGAGAAGGTTTCATATTTTGACTTgaagcattcggaaagtattaagacccctttATTTTCCCC
>TU2282303
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>TU2282306
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>TU2282300
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>TU2282304
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Function

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2282299 False 1411 lncRNA 0.42 2 7860030 7861483
TU2282303 False 1368 lncRNA 0.41 2 7860030 7861483
TU2282306 False 1368 lncRNA 0.41 3 7860030 7861483
TU2282300 False 1281 lncRNA 0.42 2 7860160 7861483
TU2282304 True 1238 lncRNA 0.42 2 7860160 7861483

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118944558 LOC106595801 coding downstream 50097 7802643 ~ 7809933 (-)
LOC110526845 LOC106592787 coding downstream 108623 7744309 ~ 7751407 (-)
LOC118936603 LOC106587968 coding downstream 195547 7647283 ~ 7665132 (-)
LOC118944548 NA coding downstream 257599 7597154 ~ 7602431 (-)
LOC110526837 LOC106592039 coding downstream 263118 7579397 ~ 7596912 (-)
LOC110515105 LOC106593850 coding upstream 1973 7863456 ~ 7873075 (-)
LOC118944444 LOC106587932 coding upstream 18779 7880262 ~ 7881911 (-)
LOC110514892 NA coding upstream 39612 7900918 ~ 7901646 (-)
LOC118944417 LOC106587940 coding upstream 65119 7926602 ~ 7937829 (-)
LOC118944418 NA coding upstream 67149 7928632 ~ 7930101 (-)
G1994245 NA non-coding downstream 968 7858745 ~ 7859062 (-)
G1994250 NA non-coding downstream 16852 7842883 ~ 7843178 (-)
G1994234 NA non-coding downstream 38224 7821189 ~ 7821806 (-)
G1994205 NA non-coding downstream 63431 7793526 ~ 7796599 (-)
G1994247 NA non-coding upstream 26271 7887754 ~ 7912364 (-)
G1994268 NA non-coding upstream 47474 7908957 ~ 7909501 (-)
G1994243 NA non-coding upstream 51464 7912947 ~ 7924229 (-)
G1994075 NA other downstream 470462 7389245 ~ 7389568 (-)
LOC118936596 LOC106591161 other downstream 1415801 6391414 ~ 6444276 (-)
LOC118944463 LOC106562776 other upstream 238837 8096974 ~ 8105982 (-)
LOC110527031 LOC106587988 other upstream 828561 8564300 ~ 8805872 (-)
LOC110516734 LOC107593117 other upstream 1231597 9090166 ~ 9108249 (-)
G1994674 NA other upstream 1315555 9177038 ~ 9180705 (-)

Expression


Co-expression Network