XLOC_000392 (mxra5a)



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_000392
gene name mxra5a
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 33322174 ~ 33334732 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00000666
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>TCONS_00000667
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>TCONS_00000668
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Function


symbol description
mxra5a Orthologous to human MXRA5 (matrix remodeling associated 5).

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-090312-22 Orthologous to human MXRA5 (matrix remodeling associated 5).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000074815

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00000667 False 10252 mRNA 0.39 6 33322555 33334732
TCONS_00000668 True 2831 mRNA 0.44 2 33328857 33332061

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_000390 BX322647.1 coding upstream 105456 33215241 ~ 33216718 (+)
XLOC_000389 zgc:174320 coding upstream 528530 32791920 ~ 32793644 (+)
XLOC_000388 CU915272.1 coding upstream 615947 32706109 ~ 32706227 (+)
XLOC_000387 nlgn4xa coding upstream 628224 32521469 ~ 32693950 (+)
XLOC_000393 dhrsx coding downstream 48912 33383644 ~ 33487375 (+)
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XLOC_000395 chmp2bb coding downstream 223823 33558555 ~ 33569245 (+)
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XLOC_000381 NA non-coding upstream 1309796 32011880 ~ 32012378 (+)
XLOC_000400 CU915566.1 non-coding downstream 400286 33735018 ~ 33735134 (+)
XLOC_000401 CT573012.1 non-coding downstream 632425 33967157 ~ 33967273 (+)
XLOC_000403 dre-mir-734 non-coding downstream 788148 34122880 ~ 34122972 (+)
XLOC_000407 CR848003.1 non-coding downstream 1065508 34400240 ~ 34400354 (+)

Expression



Co-expression Network