G2031225


Basic Information

Item Value
gene id G2031225
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048590.1
NCBI id CM023244.2
chromosome length 51113553
location 42343282 ~ 42346725 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2323351
gcatagagttgtatggttttaactttgcaatcatctatttttgtttgacatacattgtAACGTGAAAGATCTGAGTCTCAGTGTCACTCTGTTGCAGTGGAATGACCCGTGTGTCGGAGATCCATTTTGCCCTCTGATAGACCAGGGGAATGGTCGGCATATTGTTTACACCTATGCAATCCTCTCAAATCTACGTAAGTACACTGCCTCGAGGCCGTGGGTAGGGTTTGATTTGGGAATCAGGGCCAGAGTAAGGGGGACAGCCAACTTCCCAGTCCAAACATGATCTTCTTAGATGGGATCCATCGTTGCCAAGGCCAGCAGTTCTCCCATATGCCTACAGGGGGCgatctctgcttctctcctgaGGGGCGCTTTGCACTGCATCGTCACCTCCCTTCTATTAAAAAGTGTGGGGGGAGGCTAATAAAAATGGTCCACACCAACCTGTCATGTCACTAAGCTCCTAGACACACTGGGGGTGCTGTATTTAGACTCACCCAGCAAAGTACACACTCCAGGAAGACGGACTTTGGAGCCAGTGGGATATATACCAAATACTCCACCCACCCTGCACTTTCAGTAGGTACACTGCAGCTGGGTGTTCTGCAATGCTatgacagtacacacacacacgtctcatgAGCTGCTTTCCCCAGATGACAGCGGCTTTATTACACATTTCCATGTAAAGCTGTgtgtccctcctccccctgtactgTATTGGGGCTTAGCAGCATGGGCCATATGGAGTTGGAACAGCCACACATGCCTTCCCCTGCCCTTCTCCCATTCCCTTTCTCTcagtctctatccctctctccctttctctcagtctctatccctctctccctttctctcagtctctatccctctctccctttctctcagtctctattcatctctccctttccgtctcccttcatctctccctttccgtctcccttcatctctccctctgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcagctctcccttcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccatctccattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctattcagctctcccttcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctattcagctctcccttcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctctctttccgtctatattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcaactctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccatctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctattcagctctcccttcatctctccctttgtctctattcatctctccctgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcaactctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccatctctattcatctctccctttctgtctctattcatctctccctttctgtctattcagctctcccttcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttctgtctctattcatctctcccctTGTCtgtattcatctctccct
>TU2323352
gcatagagttgtatggttttaactttgcaatcatctatttttgtttgacatacattgtAACGTGAAAGATCTGAGTCTCAGTGTCACTCTGTTGCAGTGGAATGACCCGTGTGTCGGAGATCCATTTTGCCCTCTGATAGACCAGGGGAATGGTCGGCATATTGTTTACACCTATGCAATCCTCTCAAATCTACGTAAGTACACTGCCTCGAGGCCGTGGGTAGGGTTTGATTTGGGAATCAGGGCCAGAGTAAGGGGGACAGCCAACTTCCCAGTCCAAACATGATCTTCTTAGATGGGATCCATCGTTGCCAAGGCCAGCAGTTCTCCCATATGCCTACAGGGGGCgatctctgcttctctcctgaGGGGCGCTTTGCACTGCATCGTCACCTCCCTTCTATTAAAAAGTGTGGGGGGAGGCTAATAAAAATGGTCCACACCAACCTGTCATGTCACTAAGCTCCTAGACACACTGGGGGTGCTGTATTTAGACTCACCCAGCAAAGTACACACTCCAGGAAGACGGACTTTGGAGCCAGTGGGATATATACCAAATACTCCACCCACCCTGCACTTTCAGTAGGTACACTGCAGCTGGGTGTTCTGCAATGCTatgacagtacacacacacacgtctcatgAGCTGCTTTCCCCAGATGACAGCGGCTTTATTACACATTTCCATGTAAAGCTGTgtgtccctcctccccctgtactgTATTGGGGCTTAGCAGCATGGGCCATATGGAGTTGGAACAGCCACACATGCCTTCCCCTGCCCTTCTCCCATTCCCTTTCTCTcagtctctatccctctctccctttctctcagtctctatccctctctccctttctctcagtctctatccctctctccctttctctcagtctctattcatctctccctttccgtctcccttcatctctccctttccgtctcccttcatctctccctctgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcagctctcccttcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccatctccattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctattcagctctcccttcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctattcagctctcccttcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctctctttccgtctatattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccatctctattcatctctccctttctgtctctattcatctctccctttctgtctattcagctctcccttcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttctgtctctattcatctctcccctTGTCtgtattcatctctccct
>TU2323354
gcatagagttgtatggttttaactttgcaatcatctatttttgtttgacatacattgtAACGTGAAAGATCTGAGTCTCAGTGTCACTCTGTTGCAGTGGAATGACCCGTGTGTCGGAGATCCATTTTGCCCTCTGATAGACCAGGGGAATGGTCGGCATATTGTTTACACCTATGCAATCCTCTCAAATCTACGTAAGTACACTGCCTCGAGGCCGTGGGTAGGGTTTGATTTGGGAATCAGGGCCAGAGTAAGGGGGACAGCCAACTTCCCAGTCCAAACATGATCTTCTTAGATGGGATCCATCGTTGCCAAGGCCAGCAGTTCTCCCATATGCCTACAGGGGGCgatctctgcttctctcctgaGGGGCGCTTTGCACTGCATCGTCACCTCCCTTCTATTAAAAAGTGTGGGGGGAGGCTAATAAAAATGGTCCACACCAACCTGTCATGTCACTAAGCTCCTAGACACACTGGGGGTGCTGTATTTAGACTCACCCAGCAAAGTACACACTCCAGGAAGACGGACTTTGGAGCCAGTGGGATATATACCAAATACTCCACCCACCCTGCACTTTCAGTAGGTACACTGCAGCTGGGTGTTCTGCAATGCTatgacagtacacacacacacgtctcatgAGCTGCTTTCCCCAGATGACAGCGGCTTTATTACACATTTCCATGTAAAGCTGTgtgtccctcctccccctgtactgTATTGGGGCTTAGCAGCATGGGCCATATGGAGTTGGAACAGCCACACATGCCTTCCCCTGCCCTTCTCCCATTCCCTTTCTCTcagtctctatccctctctccctttctctcagtctctatccctctctccctttctctcagtctctatccctctctccctttctctcagtctctattcatctctccctttccgtctcccttcatctctccctttccgtctcccttcatctctccctctgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcagctctcccttcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccatctccattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcaactctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccatctctattcatctctccctttctgtctctattcatctctccctttctgtctattcagctctcccttcatctctccctttgtctctattcatctctccctgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttctgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttctgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctctttccgtctctattcatctctctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctctttccgtctctattcatctctccctttccgtctctattcatctctccctttctgtctctattcatctctcccctTGTCtgtattcatctctccct

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106596709 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2323351 False 2538 TUCP 0.47 3 42343282 42346725
TU2323352 False 2014 TUCP 0.47 3 42343282 42346725
TU2323354 True 2080 TUCP 0.47 2 42343282 42346725

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118944568 LOC106562433 coding downstream 125780 42214901 ~ 42217502 (-)
LOC110506841 cart coding downstream 194416 42147360 ~ 42148871 (-)
LOC118944459 tubgcp4 coding downstream 205278 42118421 ~ 42138004 (-)
LOC110506147 bend2 coding downstream 272810 42067732 ~ 42070472 (-)
LOC110506148 LOC106587747 coding downstream 286714 41986285 ~ 42056568 (-)
LOC110506162 serinc4 coding upstream 115856 42462581 ~ 42509613 (-)
LOC110506854 mfap1 coding upstream 165555 42512280 ~ 42516373 (-)
LOC110526670 NA coding upstream 177856 42524581 ~ 42526465 (-)
LOC110518657 LOC106587629 coding upstream 201624 42548349 ~ 42551080 (-)
LOC110526673 LOC106562627 coding upstream 204487 42551212 ~ 42554509 (-)
G2031201 LOC106562619 non-coding downstream 54972 42286656 ~ 42288310 (-)
G2031083 NA non-coding downstream 122905 42219505 ~ 42220377 (-)
G2031002 NA non-coding downstream 243792 42097148 ~ 42099490 (-)
G2031029 NA non-coding downstream 248291 42094633 ~ 42094991 (-)
G2031017 NA non-coding downstream 281722 42060878 ~ 42061560 (-)
G2031260 NA non-coding upstream 23977 42370702 ~ 42372438 (-)
G2031271 NA non-coding upstream 51064 42397789 ~ 42399014 (-)
G2031273 NA non-coding upstream 54005 42400730 ~ 42401075 (-)
G2031279 NA non-coding upstream 67563 42414288 ~ 42414597 (-)
G2031280 NA non-coding upstream 69821 42416546 ~ 42416840 (-)
LOC110515873 LOC106562546 other downstream 775369 41461857 ~ 41567947 (-)
G2030291 NA other downstream 1131430 41211477 ~ 41211852 (-)
G2030156 NA other downstream 1436089 40906623 ~ 40907193 (-)
G2031259 NA other upstream 21529 42368254 ~ 42369909 (-)
G2031286 LOC106562727 other upstream 112532 42459257 ~ 42461315 (-)
G2031343 NA other upstream 211072 42557797 ~ 42558903 (-)
LOC110513924 rasl12 other upstream 269519 42616181 ~ 42958849 (-)
G2031974 NA other upstream 837911 43184636 ~ 43185724 (-)

Expression


Co-expression Network