G2037833


Basic Information

Item Value
gene id G2037833
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048590.1
NCBI id CM023244.2
chromosome length 51113553
location 50320922 ~ 50323439 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2331264
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>TU2331259
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>TU2331260
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>TU2331252
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>TU2331253
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>TU2331266
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Function

NR:

description
PREDICTED: tetratricopeptide repeat protein 17-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2331264 False 2173 TUCP 0.44 4 50320922 50323439
TU2331259 False 1434 lncRNA 0.41 3 50321128 50323439
TU2331260 False 1922 TUCP 0.43 3 50321128 50323439
TU2331261 False 1536 lncRNA 0.41 3 50321128 50323439
TU2331262 False 1532 lncRNA 0.42 4 50321128 50323439
TU2331267 False 1482 lncRNA 0.40 5 50321128 50323439
TU2331252 False 1812 lncRNA 0.45 2 50321424 50323439
TU2331253 False 1655 lncRNA 0.44 3 50321424 50323439
TU2331266 True 1761 lncRNA 0.44 2 50321424 50323439

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110506980 LOC106593359 coding upstream 169405 50109946 ~ 50151723 (+)
LOC110526794 apip coding upstream 272541 50041108 ~ 50048587 (+)
LOC118944446 LOC106587903 coding upstream 300583 50008794 ~ 50020545 (+)
LOC110514611 LOC106593737 coding upstream 334675 49969549 ~ 49986453 (+)
LOC110517837 LOC106562510 coding upstream 355621 49949158 ~ 49965507 (+)
LOC110506984 LOC106562578 coding downstream 20542 50343981 ~ 50349532 (+)
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LOC110506995 LOC106562863 coding downstream 117128 50440567 ~ 50446781 (+)
LOC110506997 LOC106562470 coding downstream 140186 50463625 ~ 50464821 (+)
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G2037839 NA non-coding downstream 10431 50333870 ~ 50334181 (+)
G2037387 NA other upstream 410612 49909056 ~ 49910516 (+)
G2036925 LOC106563534 other upstream 918116 49401400 ~ 49403012 (+)
G2036906 NA other upstream 964584 49356195 ~ 49356544 (+)
G2036631 NA other upstream 1024767 49295152 ~ 49296361 (+)
G2036456 NA other upstream 1479415 48840981 ~ 48841713 (+)
G2037834 LOC106562711 other downstream 4881 50328320 ~ 50329070 (+)
LOC110527008 pex16 other downstream 473859 50744617 ~ 50803181 (+)
G2038302 NA other downstream 677312 51000751 ~ 51003835 (+)
G2038305 NA other downstream 682193 51005632 ~ 51006168 (+)

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