LOC118944644


Basic Information

Item Value
gene id LOC118944644
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 23777989 ~ 23787190 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036964645.1
AACATCACATAATTCAACATCTACCTCAGTGATGGATGAAATTACCAAGTATGTTTCAAAAATCCCAAGTGAAACATCACTGCCTGTAACCAGTCAGATGTCAATGAGTACCACTGTTTCTTCAACTCCAACAGCAAATACCAATCAATCCATAGAAAGTATAGCTTCCACTACATCAAACGTTTATTCAAGTGATGTCACCACAACTACATCAACATCAGCAACCACTACAAGCAATGCCACCACAACTTCCAcctcaacagtcacttcaagtgatgtcAATTCTCCCTCAACTACATCAGCAGTAACTTCAACTGTGACCACCATTCCCTCTACGCCAACAGTCACAAGTGATACCCCCAGTCCCGCAACAGTCACTCAAAGGAATGCCTACACTCCCTCTACTATGTATACAGACTCTTCAAATGATGCCACCACTccatcaacagtcacttcaagtgatgccaccactcCCTCAACTACATTGACAGTCACAAGTGATTCCATCACTTGCTCTAATACATCAACATTGGCAGTcccttcaagtgatgccaccactcCCTCAACAGTCACTTTTCCCTCCACTACATCAGCAGTAACATCAACTGTGGCCAACATCCCTTCTACTACTTCGAAAGTCACCTCAAGTGATGCCACCAATCCCTCAACTATGTctacagtcacttcaagtgatccCGCAACTCCCACTAATTCATTGACAGTCACAAGTGATGTCACAACTCCCTCAACTACATCAATAGTCACTTCAAGTGATCCCAAAACTCTGACTTCTACATTGACAGTCAAAAGTGATGCCACCACTCGGTCTACTATGTCTACAGTCATTTCAAGTGATCCCACAACTTCCACTACTACATTGACAGTCACTAGTGATGCCATCATTCGCTCTGCTATATCGACATTGACAGTCCCTTTAATAAGTGATgccacctctccctctaccatGTATACAGTTACTTTAAGTGGCAACACATCAACACCtacttcaagtgatgccaccccTCCCTCAACAGTCACTTCAACTCATGTAACTTCTCCCTCAACTATGTCTACAGTCACTTCAATTGATACCACCCCTACTACATCAACAGTCACAAATGATGCCCTCACTCGCTCTACTACATTGATATCAAAATTACATTCAAGTGATGCCACTAATACCTCAACAGTCACTTCAAATGATGCCAGCAGTCCCTCAACTATGTcgacagtcacttcaagtgataaCAAAACTCCCTCAatagtcacttcaagtgatgccactACTCCCTTGACTATGTtgacagtcacttcaagtgatgccaccactccctcaacagtcacttcaagtgatccCTCAACTCCCACCACTACATCGACATTGACAGTCTCTTCAAAGGATGCCACCACTCtttcaacagtcacttcaagtgatgctaCATCAACACACACTTCAAGTAATGCCACCACTCCCTCACCCAAATCAACAGTGTCTTCAAGTAATGCCACCACTCCCTCACCCAAATCAACAGTGTATTCAAGTAATGCCACCACTCCCTCACCCAAATCAACAGTGTCTTCAAGTAATGCCACCACTCCCTCACCCAAATCAACAGTGTCTTCAAGTAATGCCACCACTCCCTCACCCAAATCAACAGTGTCTTCAAGTAATGCCACCACTTCCTCACCCAAATCAACAGTGTCTTCAAGTAATGCCACCACTCCCTCACCCAAATCAACAGTGTCTTCAAGTGATTCCACCAATCCCTCAACTACGTCAACAGTCACAAGTGATGCCATCACTCATTCTACTAAATCGACATTGACAGTCCTTTCAAGTGATGCCATCACTCcctcaacagtcacttcaagtaaTGCCACCACTACGACAttaacagtcacttcaagtgatagTACATCAACACCCACTTCAATTGATGCCACCACTCCCTCAACAGCATCCCCAGTCATTCAAAGTAATACCATTACTCCCTCAGCTACATCGACATTCACTTCAAgtcataccaccaccaccactacatcgaCAGTAACATCAACTGTGGCCACCACTCCCTCAActacatcaacagtcacttcaagggATGCCAACACTCCCTTAACAGTCTCTTCATGTGATGTCACTACTCCCTCAACTACATCAatagtcacttcaagtgatgccaccactaCTCCATCAACAACAGCAGTCACTTCAAGCATTGCCACCGCTCCTTCAACattcacttcaagtgatgccaccactgCTACACCAACAGTAGCTTCAACTGCAGCCACCATTCCCTCAActacatcaacagtcacttcagATGATACTACATCAACAcccacttcaagtgatgccaccactcCCTCAACTGCATCGACAGTCACTTCAGATGATACTACATCAACAcccacttcaagtgatgccaccactcCCTCAACTGCATCGACATCAACTTCAAATGATGCCACAACTACTACACTGACATTAACAGTCATTTCAAGCGATTCCACCACTCCCTCATCTACATCAATAGTCACTTCTCGTGATGCCACAGCTACTACATCAACATCAGCattcacttcaagtgatgccacctcTCCCTCGACATCAATATTTACTTCAATTGATGCCACCTCTCCCTCGACATCAACAGTCACTTTAAGTGATGCCACCTCTCCCTCAACTACATTGACTTTCACTTCAAGtgttaccaccactactacaccaacAGAAATATTAACTGTGGCCACAATTCCTTCAACTACATtgacagtcacttcaagtgatgacACTACTGCTTCAACAGTCACTCCAAGTGATGCCACCAATCCCTCAACTACATCAACATCAACTTCAAGAGATGCCACCACTACTACATCGACATTAACAGTCACTTCAATTCATAACACCACTATTACATCAACATCAGCAGTCACTTCAAGCAATGCCACCGCTCCTTCAAAATTAGCTTCAAGTCATGCCACCGCTACAACATCAATTTCAGTAGTCTCTTCAAGTGATGTAACCACTCCCTCAACAGTCCCTCCAAGTGATGCCACCAATCCCTCAACTGCATCGACATCAACTTCAAGAGATGCCACCACTACTACATCGACATTAACAGTCATTTCAAGCGATTTCACCACTCCCTCAGAAACCACTTCAAGTCAtgccaccactactacatcaACATCAGCAGTCACTTCAAGCGATAACACTGTTCCTTCAACATTTACTTCAAGTGGTGCCACCGCTACTACATCAGCATCAGCATTCAGTTCAAGTGATGCCATCTCTCCCTCGACATCAACAGTctcttcaagtgatgccaccagtACTATATCAACATCAGCAGTctcttcaagtgatgccaccaatCCCTCAACTGCATCGACATCAACTTCAAATGATGCCACCACTCCCTCATCTACATCAGCAGTCACTTCAAGCAATAACACTGTTCCTTCAACATTCACTTCAAGTGGTGCCACCGCTACTACATCAACATCAGCATTCAGTTCAAGTGATGCCATCTCTCCCTCGACATCAACAGTCACTTTAAGTGATGGCAGCACTCCCTCAACAGTctcttcaagtgatgccaccactcCCTCAACTGCATCGACATCAACTTCAAATGATGCCACCACTCCCTCATCTACATCAGCAGTAACTTCAAGCGATAACACTGTTCCGTCAACATTCACTTCAAGTGGTGCCAAAGCTACTACATCAACTTCAGCattcacttcaagtgatgccacctcTCCCTTAACATCAATATTCACTACAAGTGATGGCACCTCTCTCTCGACATCAATATTTACTTCAATTGATGCCACCACTCCCCCAACAGTagcttcaagtgatgccaccgcTACTACATCAACATCAGCAGTctcttcaagtgatgccaccactcCCTCGACATCAATATTCACCTCGAATAATGCCACCTCTCACTCAACTACATTGACAGTCACTTCAGACGATACTACATCAACAcccacttcaagtgatgccaccacaCCCTCAAGTACATTGACAGTCAGTTCCAGTTTTGCCACCACTCTGTCAACAGTCACTTCAGGTGATGCCACCTCTTCCTCAACTACATCAACGGTCACTTCAGGTGAtgccaccactactacaccaagAGTAACTTCAAATGCTGCCATCATTCCCTCAACTACATCAACACCCACTTCAAGTGATACCACCACTCCCTCAAGTACATCGACAGTCAGTTCCAGTTTTGCCACCACTCTGTCAATAGTCACTTCAGGTGATGCCACCTCTTCCTCAACTACATCAACTTTAACTTCAAGTGATACCACGACTACTACACCGACAGTAACATTAACTGTGGACAGAATTCCCTCAACTACGTCGACAGTCAGgtcaagtgatgccaccactgcctcaacagtcacttcaagtcaTGATACCAATGTTACATCAACATCAGCAGTAACTTCAAGCGATGCCACCGTTCCTTCAAAATTTGCTTCAAGTGATGTCAACTCTTCTAAATCATCATCAGCAGTCACTTCAAGCAATAACACCGTTCCTTCAACATTCACTTCAAGTAGTGCCACCACTCCCTCAAGAACATcgacagtcacttcaagtgatgccacctcTTCCTCAACAACATCGACTTTAACTTCAAGTGATATCACCACTACTACACCGACAGTAACTTCAACATTGGCCAACATTCTCTCAACTACATcgacagtcacttcaagtgatgccactACACCCTCAACATTCACTTCAAGTGGTGCCACCGCTACCACATCAACATCAatagtcacttcaagtgatgccacaGCTACTACATCAACATCAGCAGTCACTTCAAGCGATATCACTGTTCCTTCAACATTTACTTCAAGTGGTGCCACCGCTACTACATCAGCATTCAGTTCAATCTCTCCCTCGACATCAACAGTCACTTTAAATGATGTCACCACTCCTTCAACAGTctcttcaagtgatgccaccgcTACTACATCAACATCAGCAGTCTCTTCAAGTGATGCCAATCCGTCAACTGCATTGACATCaacttcaagtgatgccacctcTCACTCAACTACATCGATAGTCACTTCAGACGATACTACATCAACAACCACTTCAAATGTTGCCATCACTCCCTCAACTACACTGATAGTAACTTCAGAAAATGCCACATGGACACCCACTTCAGGTGATGCAACCTCTTCCTCAACTACATCAACATTCACTTCAAGTGGTGCCACCACTCCCTCAACAGTagcttcaagtgatgccaccgcTACTGCATCAACATCAGCAGTctcttcaagtgatgccaccactcCTTCTACAGTCACTTCAAGCAATCCCACCACTCcctcaacagtcacttcaagtgatgccacctcTCCTTCTACATTCACTTCAAGCAATCCCACCACTCcctcaacagtcacttcaagtgatgccaccactcCCTCATCTACATCAaaagtcacttcaagtgatgccacaGCTACTACATCAACATCAGCAGTCACTTCAAGCGATATCACTGTTCCTTCAACATTTACTTCAAGTGGTGCCACCGCTACTACATCAGCATTCAGTTCATATGATGCCACCTCTCCCTCGACATCAATATTCACTTCAATTGATGCCACCTCTCCTTCTACATTCACTTCAAGCAATCCCACCACTCcctcaacagtcacttcaagtgatgccacctcTCCCTCGACATCAATcttcacttcaagtgatgccacctcTCACTCAACTACATTGATAGTCACTTCAGACGATACTACATCAACAACCACTTCAAATGTTGCCACCACTGcctcaacagtcacttcaagtcaTGATACCAATGTTACATCAACATCAGCAGTAACTTCAAGCGATGCCACCGCTCCTTCAAAATTTGCTTCAAGTGATGTCAACTCTTCTAAATCATCATCAGCAGTCACTTCAAGCAATAACACCGTTCCTTCAACattcacttcaagtgatgccacctcTTCCTCACCAACATCGACTTTAACTTCAAGTGATATCACCACTACTACACCGACAGTAACTTCAACATTGGCCAACATTCTCTCAACTACATcgacagtcacttcaagtgatgccactACACCCTCAACATTCACTTCAAGTGGTGCCACCGCTACCACATCAACATCAGCattcacttcaagtgatgccaccactcCCTCAACATCAATATTCACTTCAAGTAATGGCACCTCTCCCTCGACATCAATattcacttcaagtgatgccaccaatCCCTCAACTGCAACGACATCAACTTCAAATGATGCCACCACTACTACACTGACATTAACAGTCATTTCAAGCGATTCCACCACTCCCTCAAAAgccacttcaagtgatgccaccactcCCTCATCTACATCAatagtcacttcaagtgatgccacaGCTACTACATCAACATCAGCAGTCACTTCAAGCGATATCACTGTTCCTTCAACATTTACTTCAAGTGGTGCCACCGCTACTACATCAGCATTCAGTTCAATCTCTCCCTCGACATCAACAGTCACTTTAAATGATGTCACCACTCCCTCAACAGTctcttcaagtgatgccaccgcTACTACATCAACATCAGCAGTCTCTTCAAGTGATGCCAATCCGTCAACTGCATTGACATCAACTTCAAATGATGCCACCTCTCCCTCGACATCAATcttcacttcaagtgatgccacctcTCACTCAACTACATCGATAGTCACTTCAGACGATACTACATCAACAACCACTTCAAATGTTGCCATCACTCCCTCAACTACACTGATAGTAACTTCAGAAAATGCCACATGGACACCCACTTCAGGTGATGCAACCTCTTCCTCAACTACATCAACATTCACTTCAAGTGGTGCCACCGCTACTGCATCAACATCAGCAGTCTCTTTAAGTGATGCCACCACTCCTTCTACAGTCACTTCAAGCAATCCCACCACTCcctcaacagtcacttcaagtgatgccacctcTCCTTCTACATTCACTTCAAGCAATCCCACCACTCcctcaacagtcacttcaagtgatgccaccactcCCTCATCTACATCAatagtcacttcaagtgatgccacaGCTACTACATCAACATCAGCAGTCACTTCAAGCGATATCACTGTTCCTTCAACATTTACTTCAAGTGGTGCCACCGCTACTACATCAGCATTCAGTTCAAATTATGCAAACTCTCCCTCGACATCAATATTCACTTCAATTGATGCCACCTCTCCTTCTACATTCACTTCAAGCAATCCCACCACTccatcaacagtcacttcaagtgatgccacctcTCCCTCGACATCAATcttcacttcaagtgatgccacctcTCACTCAACTACATCGATAGTCACTTCAGACGATACTACATCAACAACCACTTCAAATGTTGCCACCACTGcctcaacagtcacttcaagtgatgccatcACTCCCTCAACTACACTGATAGTAACTTCAGAAAATGCCACATGGACACCCACTTCAGGTGATGCAACCTCTTCCTCAACTACATCAACATTCACTTCAAGTGGTGCCACCACTCCCTTAACAGTaacttcaagtgatgccacctcTCCCTCAACTACATTGACTTTCACTTCAAGTGTTACCTCCACTACTACACCGACAGAAATATTAACTGTGGCCACAATTCCTTCAACTACATtgacagtcacttcaagtgatgacACTACTGCTTCAACAGTCACTCCAAGTGATGCCACCAATCCCTCAACTACATCAACATCAACTTCAAGAGATGCCACCACTACTACATCGACATTAACAGTCATTTCGAGCGATTCCACCACTCCCTCAGAAACCACTTCAAGTCAtgccaccactactacatcaACATCAGCAGTCACTTCAAGCGATAACACTGTTCCTTCAACATTTACTTCAAGTGGTGCCACCGCTACTACATCAGCATCAGCATTCAGTTCAATTGATGCCATCTCTCCCTCGACATCAACAGTctcttcaagtgatgccaccgcTACAATATCAACATCAGCAGTctcttcaagtgatgccaccaatCCCTCAACTGCATCGACATCAACTCCAAGTGATGCCACCAATCCCTCAACTACATCAACATTCACTTCAAGTGGTGCCACCGCTACTACATCAACATCAGCATTCAGTTCAAGTGATGCCATCTCTCCCTCGACATCAACAGTCACTTTAAGTGATGGCAGCACTCCCTCAACAGTctcttcaagtgatgccacctcTCCCTTAACATCAATATTCACTACAAGTGATGGCACCTCTCTCTCGACATCAATATTTACTTCAATTGATGCCAGCACTCCCTCAACAGTagcttcaagtgatgccaccgcTACTACATCAACATCAGCAGTctcttcaagtgatgccaccactcCCTCGACATCAATATTCACTTCAAATAATGCCACCTCTCACTCAACTACATCGACAGTCACTTCAGACGATACTACATCAACAtccacttcaagtgatgccaccacaCCCTCAAGTACATTGACAGTCAGTTCAAGTGTTGCCAGCACTCtgtcaacagtcacttcaagtgatgccaccacttTCTCAACTACATCAACGGTCACTTCAGGTGATGCCACCACTCCCTCAAGTACATCGACAATCAGTTCCAGTTTTGCCACCACTCTGTCAACAGTCACTTCAGGTGATGTCACTTCTTCCTCAACTACatcaaccaccactactacaccgaCAGTAACATTAACTGTGGACAGAATTCCCTCAACTACGTCGACAGTCAGGTCAAGTAATGCCACCACTGCCTCAAGAGTCACTTCAAGTCATGATACCAATGTTACATCAACATCAGCAGTAACTTCAAGCGATGCCACCGTTCCTTCAACATTCACTTCAAGTGGTGCCACCACTCCCTCAAGAACATtgacagtcacttcaagtgatgtcACCTCTTCCTCAACAACTTCGACTTTAACTTCAAGTGATATCAACACTACTACACCGACAGTAACTTCAACATTGGCCAACATTTTCTCGACTACATcgacagtcacttcaagtgatgccactACACCCTCAACATTCACTTCAAGTGGTGCCACCGCTACCACATCAACATCAGCA

Function

NR:

description
hypothetical protein EH28_18632

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036964645.1 True 9202 mRNA 0.45 1 23777989 23787190

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110507139 LOC106581136 coding downstream 27 23761486 ~ 23777962 (-)
LOC110507812 LOC106581137 coding downstream 36650 23737154 ~ 23741339 (-)
trnap-agg-156 NA coding downstream 70481 23707437 ~ 23707508 (-)
picalmb LOC106581143 coding downstream 208778 23547573 ~ 23569211 (-)
sytl2b LOC106581144 coding downstream 231623 23524663 ~ 23546366 (-)
LOC118944716 NA coding upstream 23207 23810397 ~ 23813666 (-)
LOC110507820 LOC106581132 coding upstream 50092 23837282 ~ 23869548 (-)
LOC110507821 LOC106581130 coding upstream 88145 23875335 ~ 23885622 (-)
vmp1 tmm49 coding upstream 103088 23890278 ~ 23907734 (-)
LOC110507825 LOC106612995 coding upstream 163603 23950793 ~ 23962065 (-)
G2066101 NA non-coding downstream 6008 23769143 ~ 23771981 (-)
G2065422 NA non-coding downstream 81823 23692593 ~ 23696166 (-)
G2065311 NA non-coding downstream 275145 23501921 ~ 23502844 (-)
G2065241 NA non-coding downstream 362513 23415110 ~ 23415476 (-)
G2066157 NA non-coding upstream 122809 23909999 ~ 23910208 (-)
G2066175 NA non-coding upstream 149650 23936840 ~ 23938765 (-)
G2066171 NA non-coding upstream 156322 23943512 ~ 23943865 (-)
G2066336 NA non-coding upstream 392042 24179232 ~ 24179834 (-)
G2066383 NA non-coding upstream 459872 24247062 ~ 24247264 (-)
G2066096 LOC106581136 other downstream 12510 23763699 ~ 23765479 (-)
G2065425 NA other downstream 72024 23703163 ~ 23705965 (-)
zbtb16b LOC106581153 other downstream 969883 22780311 ~ 22808183 (-)
LOC110507789 LOC106581159 other downstream 1059883 22712654 ~ 22718153 (-)
LOC110507126 kiaa0100 other downstream 2473861 21295518 ~ 21311437 (-)
G2066126 LOC106581133 other upstream 20548 23807738 ~ 23808909 (-)
pcp4b NA other upstream 348987 24136177 ~ 24181998 (-)
G2068043 NA other upstream 2031449 25818639 ~ 25834101 (-)
G2068676 NA other upstream 2537940 26325130 ~ 26325479 (-)
LOC110507885 LOC106581250 other upstream 3562783 27333102 ~ 27404380 (-)

Expression


Co-expression Network