LOC118944677


Basic Information

Item Value
gene id LOC118944677
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 30607829 ~ 30609111 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036964994.1
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>XM_036964993.1
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>TU2370534
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>TU2370535
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>TU2370533
TAGGTCTGCTTTGGTGTTGTTTGTTACTACGGTTAGGTCTGCTTTGGTGTTGTTTGTTACTACGGTTAGGTCTGCTTTGGTGTTTGTTACTACGGTTAGGTCTGCTTTGGTGTTGTTTGTTACTACGGGTAGGTCTGCTTTGGTGTTGTTTGATACTACGGTTAGGTCTGCTTTGGTGTTGTTTGTTACTACGGTTAGGTCTGCTTTGGTGTTGTTTGTTACTACGGTTAGGTCTGCTTTGGTGTTGTTTGTTACTACAGTTAGGTCTGCTTTGGTGTTGTTTGTTACTACGGTTAGGTCTGCTTTGGTGGTGTTTGTTACTACGGTTAGGTCTGCTTTGGTGTTGTTTGTTACTACGGTTAGGTCTGCTTTGGTGTTGTTTG

Function

NR:

description
PREDICTED: titin-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036964994.1 False 1250 mRNA 0.46 2 30607829 30609111
XM_036964993.1 False 1245 mRNA 0.46 2 30607837 30609111
TU2370534 False 223 lncRNA 0.42 2 30607977 30608727
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TU2370533 True 383 lncRNA 0.43 2 30608279 30608727

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110507928 acsl3 coding downstream 635776 29936903 ~ 29972053 (-)
LOC110507932 kcne4 coding downstream 674840 29931627 ~ 29932989 (-)
LOC110507916 LOC106591944 coding downstream 723333 29880654 ~ 29884496 (-)
LOC110507919 LOC106580690 coding downstream 746900 29854457 ~ 29860929 (-)
LOC110507935 LOC106581306 coding upstream 74343 30683454 ~ 30724465 (-)
LOC118944654 LOC106613133 coding upstream 130669 30739780 ~ 30743661 (-)
LOC110507154 clstn2 coding upstream 141964 30751075 ~ 31200797 (-)
LOC110507962 LOC106613113 coding upstream 723165 31332276 ~ 31358483 (-)
LOC110507961 LOC106581358 coding upstream 1022436 31631547 ~ 31633359 (-)
G2073164 NA non-coding downstream 35846 30571416 ~ 30571983 (-)
G2073160 NA non-coding downstream 41630 30565662 ~ 30566199 (-)
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zgc:165508 LOC106613118 other downstream 956362 29626155 ~ 29651489 (-)
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G2077936 NA other upstream 4826483 35435594 ~ 35436257 (-)

Expression


Co-expression Network