G2071589


Basic Information

Item Value
gene id G2071589
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 29313247 ~ 29340074 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2368715
agacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagactttgagatggatagacagagtttgagatggatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatcgacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatcgacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaatagacagagtttgaaatagatagacagtgtgagatagatagacagtttgagatagatagacagagtttgagatgggtagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagactttgagatggatagacagagtttgagatggatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatcgacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatagacagagcttgagatagaTAGCCAGAGATTGAGATGGATAGGCAGAGTTTgaaatagacagagtttgaaatagacagagtttaaaatagacagagtttgagatggacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagcttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagacagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgaaatagatagaccgtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagtgtgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagagtttgaaatagatagacagtttgagatagatatacagtttgagatagatagacagagtttgagatgggtagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagactttgagatggatagacagagtttgagatggatagacagagtttcagatagacagacagactttgagatggatagacagagattgagatggatcgacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatagacagagtttgagatggatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatagacagagcttgagatagaTAGCCAGAGATTGAGATGGATAGGCAGAGTTTgaaatagacagagtttgaaatagacagagtttaaaatagacagagtttgagatggacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagcttgagatggatatacagagtttgagacagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagacagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagacagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgaaatagatagaccgtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagtgtgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagagtttgaaatagatagacagtttgagatagatatacagtttgagatagatagacagagtttgagatgggtagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagactttgagatggatagacagagtttgagatggatagacagagtttcagatagacagacagactttgagatggatagacagagattgagatggatcgacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatagacagagtttgagatggatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatagacagagcttgagatagaTAGCCAGAGATTGAGATGGATAGGCAGAGTTTgaaatagacagagtttgaaatagacagagtttaaaatagacagagtttgagatggacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagcttgagatggatatacagagtttgagacagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagacagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagacagatagacagagtttgagatagatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatcgacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagacagatagacagagcttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatggatagacaagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagacagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagaaagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatggatagacaagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagtgtgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagtgtgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttaaaatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagaaagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatagacatagtttgaaatagatagaccgtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagtgtgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagagtttgaaatagatagacagtttgagatagatatacagtttgagatagatagacagagtttgagatgggtagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagactttgagatggatagacagagtttgagatggatagacagagtttcagatagacagacagactttgagatggatagacagagattgagatggatcgacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatagacagagtttgagatggatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatagacagagcttgagatagaTAGCCAGAGATTGAGATGGATAGGCAGAGTTTgaaatagacagagtttgaaatagacagagtttaaaatagacagagtttgagatggacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagtgtgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagtgtgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttaaaatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagaaagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaatagatagacagagtttaagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagtgtgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttaaaatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagaaagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatagacatagtttgaaatagatagaccgtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagtgtgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagggtttgagatagatagacagagtttgagacagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagacagatagacagagtttgagatagatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatagacagagcttgagatagaTAGCCAGAGATTGAGATGGATAGGCAGAGTTTgaaatagacagagtttgaaatagacagagtttaaaatagacagagtttgagatggacagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagacagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagacagatagacagagtttgagatagatagacagagtttcagatagatagacagagattgagatggatcgacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagacagatagacagagcttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagacagagcttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatggatagacaagagtttgaaatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatggatagaccgtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagattgagatggatagacagagcttgagatagaTAGCCAGAGATTGAGATGGATAggcagagtttgagatagatagccagagattgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatatacagagtttgagatggataggcagagtttgaaatagacagagtttgaaatagacagagtttaaaatagacagagtttgagatggatagacaatagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagggtttgagatagatagacagagttagagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatggatagacagtttgagatagatagacagagtttgagatagacagtttgagatagatagacagagtttgagttagatagacagagtttgaaattGATAGACAgggtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaattGATAGACAgggtttgagatagatagacagaacttgagatggatagacagagtttgaaatagagtttgagatagatagacagagttagagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaatagacagagtttgaaatagacagatagacagagttagagatagatagacagagtttgagatggatagacagagtttgaaattGATAGAGAgggtttgagatagatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaattGATAGACAgggtttgagatagatagacagaacttgagatggatagacagagtttgaaatagagtttgagatagatagacagagttagagatggatagacagagtttgagatagatagacagagtttgaaatagacagatagacagagttagagatagatagacagagtttgagatggatagacagagatgaagggagagagggatggagggatgaagggagagagggaaggagggatcaagggagagagggaaggagggatgaagggagagaggaaaggagggatgaagggagagagggatgaagggagagagggagagagggatgaaggatgagagggatgagggatgaagggagagagggatggagggatgaagggagagagggatggagggatgaagggagagagggaaggagggatgaagggagagagggatggcaggatgaagggagagagggatgaagggagagagggaaggagggatgaagggagagagggatggagggatgaagggagagaggga

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106604086 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2368715 True 9948 lncRNA 0.37 5 29313247 29340074

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110507265 NA coding downstream 27834 29277995 ~ 29285413 (-)
LOC110507151 LOC106581293 coding downstream 61702 29217865 ~ 29251545 (-)
LOC110507150 LOC106581286 coding downstream 127170 29180624 ~ 29186077 (-)
LOC110507915 LOC106581294 coding downstream 146685 29107795 ~ 29166562 (-)
LOC110507149 LOC106581284 coding downstream 309040 28971334 ~ 29004207 (-)
zgc:165508 LOC106613118 coding upstream 289364 29626155 ~ 29651489 (-)
alp3 LOC106580686 coding upstream 318243 29658317 ~ 29672478 (-)
LOC110507923 NA coding upstream 343685 29683759 ~ 29756087 (-)
LOC110507921 psmd2 coding upstream 416496 29756570 ~ 29777646 (-)
LOC110507919 LOC106580690 coding upstream 514383 29854457 ~ 29860929 (-)
G2071588 NA non-coding downstream 3063 29309792 ~ 29310184 (-)
G2071506 NA non-coding downstream 32549 29176635 ~ 29280698 (-)
G2071557 NA non-coding downstream 38803 29267597 ~ 29274444 (-)
G2071487 NA non-coding downstream 171209 29140223 ~ 29142038 (-)
G2071590 LOC106581290 non-coding upstream 3248 29343322 ~ 29343833 (-)
G2071592 LOC106581290 non-coding upstream 4844 29344918 ~ 29345157 (-)
G2071594 NA non-coding upstream 8602 29348676 ~ 29348998 (-)
G2071595 NA non-coding upstream 9319 29349393 ~ 29349622 (-)
G2071596 NA non-coding upstream 12068 29352142 ~ 29353281 (-)
G2071247 LOC106581281 other downstream 370519 28941354 ~ 28942728 (-)
G2070744 NA other downstream 788697 28523946 ~ 28524550 (-)
G2070530 NA other downstream 1140705 28170838 ~ 28172542 (-)
LOC118944653 LOC106581256 other downstream 1423889 27872709 ~ 27889358 (-)
LOC118944698 LOC106581256 other downstream 1443152 27866010 ~ 27871529 (-)
G2072288 LOC100196662 other upstream 490028 29822517 ~ 29833885 (-)
G2072732 NA other upstream 1055701 30395775 ~ 30396680 (-)
G2074300 NA other upstream 2687554 32027628 ~ 32027967 (-)
G2076236 NA other upstream 3538715 32878789 ~ 32880888 (-)

Expression


Co-expression Network