G2084808


Basic Information

Item Value
gene id G2084808
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 42933657 ~ 42942465 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2384017
atatatatatgccaattatgtgatggtCTGACCGCATTCTGttccctatcaacactttttaaacttttgatgccagagagaatgacataagaaagtaatcaagacaactagcttgattaagcctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcccccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcaataggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaaatcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaaatcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggctattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggattttaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccattgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcttccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtctggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaagatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaagatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaaTATATTAAacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatacctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaagtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaaccatctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaagtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaagtCAGGGTATTTAATCCTCCACATATCCACTAGCACCATCATATCCATGATATTCCTGATTTCCTTTAAGTGCATGATGGTtttagtttgtagtgtgatttcatttacggtccatagaggtatttaaaaCCG
>TU2384021
atatatatatgccaattatgtgatggtCTGACCGCATTCTGttccctatcaacactttttaaacttttgatgccagagagaatgacataagaaagtaatcaagacaactagcttgattaagcctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcttccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatacctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaagtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaagtCAGGGTATTTAATCCTCCACATATCCACTAGCACCATCATATCCATGATATTCCTGATTTCCTTTAAGTGCATGATGGTtttagtttgtagtgtgatttcatttacggtccatagaggtatttaaaaCCG
>TU2384023
atatatatatgccaattatgtgatggtCTGACCGCATTCTGttccctatcaacactttttaaacttttgatgccagagagaatgacataagaaagtaatcaagacaactagcttgattaagcctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcttccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaaatcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaaatcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggattttaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaatcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccattgtatatctcactaggtcaggatattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccattgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcttccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaagatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaagatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccaagtatatctcactaggtcaggatattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaagatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatacctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggattttaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccattgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcttccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtctggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaagatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaagatattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaaTATATTAAacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatacctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatacctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactagatcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaagtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaaccatctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaagtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcaggatattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatctctcactaggtcagggtattaaacctccatgtatatctcactaggtcagggtattaaacctcctccatgtatatctcactaagtCAGGGTATTTAATCCTCCACATATCCACTAGCACCATCATATCCATGATATTCCTGATTTCCTTTAAGTGCATGATGGTtttagtttgtagtgtgatttcatttacggtccatagaggtatttaaaaCCG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2384017 False 4261 lncRNA 0.41 3 42933657 42942465
TU2384021 False 1467 lncRNA 0.40 5 42933657 42942465
TU2384023 True 5542 lncRNA 0.41 5 42933657 42942465

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118944772 LOC106581517 coding downstream 283756 42647144 ~ 42649901 (-)
LOC110508058 LOC106581494 coding downstream 369077 42561570 ~ 42564580 (-)
neu4 LOC106581489 coding downstream 393317 42516527 ~ 42540340 (-)
aadac LOC106613299 coding downstream 648112 42262030 ~ 42285545 (-)
LOC110508063 LOC106581498 coding downstream 826493 41926917 ~ 42107164 (-)
LOC110519585 LOC106581519 coding upstream 353346 43295811 ~ 43529347 (-)
LOC110508094 tnfaip1 coding upstream 593090 43535555 ~ 43549204 (-)
tmem97 tmem97 coding upstream 614111 43556576 ~ 43558533 (-)
LOC110508089 LOC106581526 coding upstream 794605 43737070 ~ 43762876 (-)
LOC110508088 LOC106581525 coding upstream 826775 43769240 ~ 43783275 (-)
G2084798 NA non-coding downstream 15103 42916704 ~ 42918554 (-)
G2084787 NA non-coding downstream 43246 42888049 ~ 42890411 (-)
G2084783 NA non-coding downstream 51670 42881635 ~ 42881987 (-)
G2084753 NA non-coding downstream 113823 42819623 ~ 42819834 (-)
G2084690 NA non-coding downstream 116279 42816953 ~ 42817378 (-)
G2084813 NA non-coding upstream 7268 42949733 ~ 43022942 (-)
G2084818 NA non-coding upstream 16515 42958980 ~ 42964591 (-)
G2084849 NA non-coding upstream 76970 43019435 ~ 43019880 (-)
G2084844 NA non-coding upstream 140553 43083018 ~ 43085645 (-)
G2084867 NA non-coding upstream 143851 43086316 ~ 43086618 (-)
G2084740 LOC106613316 other downstream 148622 42784627 ~ 42785035 (-)
LOC118944786 LOC106581464 other downstream 1252965 41573411 ~ 41680789 (-)
G2083443 NA other downstream 1509617 41423539 ~ 41424040 (-)
LOC110508045 LOC106581475 other downstream 1958450 40967894 ~ 40977862 (-)
LOC110507273 LOC106581487 other downstream 2052420 40878111 ~ 40883459 (-)
G2085726 NA other upstream 969695 43912160 ~ 43912680 (-)
G2086783 NA other upstream 1978444 44920909 ~ 44921312 (-)
G2087090 LOC106593344 other upstream 2587891 45530356 ~ 45530780 (-)
G2087288 NA other upstream 2854605 45797070 ~ 45798330 (-)
ndufc2 nduc2 other upstream 4030116 46972581 ~ 46975116 (-)

Expression


Co-expression Network