LOC110508679 (LOC106599305)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110508679
gene name LOC106599305
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048592.1
NCBI id CM023246.2
chromosome length 43716683
location 19205372 ~ 19209070 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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Function


NR:

description
probable G-protein coupled receptor 141

GO: NA

KEGG:

id description
K08429 GPR141; G protein-coupled receptor 141

RNA


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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110508675 LOC106599295 coding upstream 193731 18986697 ~ 19011641 (+)
LOC110508672 NA coding upstream 339958 18849186 ~ 18865414 (+)
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LOC110508668 LOC106599284 coding upstream 481201 18673302 ~ 18724171 (+)
LOC110508667 LOC106599281 coding upstream 546812 18579463 ~ 18658560 (+)
LOC110508681 LOC106599307 coding downstream 8411 19217481 ~ 19322102 (+)
LOC110508686 LOC106599593 coding downstream 162939 19372009 ~ 19374568 (+)
LOC110508689 LOC106599321 coding downstream 230555 19439625 ~ 19458620 (+)
LOC118944897 NA coding downstream 241788 19450858 ~ 19450910 (+)
LOC110508179 LOC106599327 coding downstream 321973 19531043 ~ 19542347 (+)
G2113656 NA non-coding upstream 49 19205088 ~ 19205323 (+)
G2113648 NA non-coding upstream 7831 19193827 ~ 19197541 (+)
G2113646 NA non-coding upstream 13082 19191937 ~ 19192290 (+)
G2113593 NA non-coding upstream 103922 19101230 ~ 19101450 (+)
G2113580 NA non-coding upstream 127022 19078098 ~ 19078350 (+)
G2113660 NA non-coding downstream 7803 19216873 ~ 19217073 (+)
G2113705 NA non-coding downstream 71407 19280477 ~ 19283775 (+)
G2113661 NA non-coding downstream 104381 19313451 ~ 19324707 (+)
G2113726 NA non-coding downstream 117900 19326970 ~ 19327219 (+)
G2113728 NA non-coding downstream 120529 19329599 ~ 19329930 (+)
G2113578 NA other upstream 128954 19076077 ~ 19076418 (+)
G2113059 NA other upstream 536876 18667115 ~ 18668496 (+)
G2112127 NA other upstream 1301448 17903198 ~ 17903924 (+)
G2111491 NA other upstream 1449791 17754937 ~ 17755581 (+)
G2111457 NA other upstream 1496743 17708256 ~ 17708629 (+)
LOC110508695 LOC106599333 other downstream 414398 19623468 ~ 19636825 (+)
G2115369 NA other downstream 1232663 20441733 ~ 20442169 (+)
LOC110508722 LOC106569260 other downstream 1631500 20840508 ~ 20842019 (+)
G2116347 NA other downstream 2165425 21374495 ~ 21375078 (+)
smg7 smg7 other downstream 3871346 23056778 ~ 23087821 (+)

Expression



Co-expression Network