LOC110508221 (LOC106598877)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110508221
gene name LOC106598877
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048592.1
NCBI id CM023246.2
chromosome length 43716683
location 31594783 ~ 31643462 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036966074.1
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XM_036966079.1 False 10298 mRNA 0.49 49 31594783 31643462
XM_036966080.1 False 10292 mRNA 0.49 48 31594783 31643462
XM_036966081.1 False 10289 mRNA 0.49 49 31594783 31643462
XM_036966082.1 False 10289 mRNA 0.49 49 31594783 31643462
XM_036966083.1 False 10280 mRNA 0.49 49 31594783 31643462
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XM_036966086.1 False 10247 mRNA 0.49 49 31594783 31643462
XM_036966087.1 False 10241 mRNA 0.49 48 31594783 31643462
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XM_036966090.1 False 10208 mRNA 0.49 48 31594783 31643462
XM_036966091.1 False 10193 mRNA 0.49 48 31594783 31643462
XM_036966092.1 False 10181 mRNA 0.49 48 31594783 31643462
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XM_036966097.1 False 10199 mRNA 0.49 47 31594783 31643462
XM_036966098.1 False 10262 mRNA 0.49 49 31594783 31643462
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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trnav-cac-87 NA coding upstream 32801 31561910 ~ 31561982 (+)
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LOC110508961 LOC106598901 coding upstream 89905 31490899 ~ 31504889 (+)
LOC110508967 LOC106598876 coding downstream 21352 31664814 ~ 31678561 (+)
LOC118944877 NA coding downstream 128343 31771805 ~ 31776040 (+)
LOC110508969 LOC106598864 coding downstream 150961 31794423 ~ 31804053 (+)
LOC110508971 LOC100195537 coding downstream 226916 31870378 ~ 31874729 (+)
LOC110508972 LOC106598853 coding downstream 236695 31880157 ~ 31921755 (+)
G2128093 NA non-coding upstream 79571 31514987 ~ 31515212 (+)
G2128091 LOC106598900 non-coding upstream 83644 31508880 ~ 31511139 (+)
G2128059 LOC106598894 non-coding upstream 146709 31447371 ~ 31448074 (+)
G2128043 LOC106598907 non-coding upstream 199017 31395514 ~ 31395766 (+)
G2128161 NA non-coding downstream 37844 31681306 ~ 31730859 (+)
G2128165 nilt2 non-coding downstream 43240 31686702 ~ 31715339 (+)
G2128175 NA non-coding downstream 60724 31704186 ~ 31704474 (+)
G2128177 NA non-coding downstream 62497 31705959 ~ 31709556 (+)
G2128179 NA non-coding downstream 67354 31710816 ~ 31711354 (+)
G2127299 LOC106598972 other upstream 953540 30640687 ~ 30641243 (+)
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G2126497 NA other upstream 1383150 30210247 ~ 30211633 (+)
G2125614 LOC106599059 other upstream 2271399 29320743 ~ 29323384 (+)
LOC110508880 NA other upstream 2320332 29270737 ~ 29274454 (+)
G2128189 NA other downstream 95850 31739312 ~ 31740070 (+)
G2128614 NA other downstream 301702 31945164 ~ 31948898 (+)
LOC110508984 NA other downstream 410214 32053231 ~ 32055655 (+)
G2128753 NA other downstream 625856 32269318 ~ 32274380 (+)
pfn2l LOC106598797 other downstream 987827 32631289 ~ 32700844 (+)
G2128139 NA non-coding upstream 22658 31617966 ~ 31618350 (+)
G2128138 NA non-coding upstream 23337 31616686 ~ 31617671 (+)

Expression

LOC110508221(LOC106598877) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 100.
End of interactive chart.

LOC110508221(LOC106598877) Expression in each Bioproject

Bar chart with 19 bars.
LOC110508221(LOC106598877) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 3000.
End of interactive chart.

Co-expression Network