G2096461


Basic Information

Item Value
gene id G2096461
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048592.1
NCBI id CM023246.2
chromosome length 43716683
location 3861807 ~ 3873627 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2398067
caCAAattgtatggactgtagatggactaaagtatggactgtagatggactgcggtATGGAATGTAGATGGActgaggtatggactgtagatggaccaacgtatgaactgtagatggactgcggtatggactgtagatggactgtggtatggactgtagatggactaacgtatggactgtagatggactgtggtatggactgtagatggactaatgtatggactgtagatggactgcggtatggactgtagatggactaacgtatggactgtagatggactgctgtatggactgtagatggactgtagatggactgctgtatggactgtagatggactgctgtATAGACTGTAGATGGACTGGGGTATGGACTGTAGAAGGACTAACGTATGggctgtagatggactgtggtatggactgtagatggactgctgtatggactgtagatagactgtagatggactgttgaatggactgtagatggactgctgtatggactgtagatggactgcggtatggactgtagatggactaacgcatggactgtagatggactgcggtatggactgtagatggactgctgtatggactgtagatggactgtagatggactgctgtatggactgtagatggactaacgtatggactgtagatggactgtagatggactgctgtatggactgtagatggactaacgtatggactgtagatggactgcggtatggactgtagatggactaacgtatggactgtagatggactgtagatggactgctgtatggactgtagatagactgtagatggactgtggtacgaactgtgtagactgtagctggactgtggtatgaactgtagaTGCACTGTAGATACACTGTGGTATGAACTGTGtagactgtagctggactgtggtatgaactgtagatggactaacgtatggactgtagatggactgtagatggactgctgtACGGACTGTAGAtagactgtagatggactgtggtacgAACTGTGTAGACTGGagctggactgtggtatgaactgtagaTGCACTGTAGATACACTGTGGTATGAACTGTGtagactgtagctggactgtggtatgaactgtagatggactgtggtatgaactgtagatggactgtggtatgaactgtaAATGGACTGTAGCTgaactgtggtatggactgtggatggactgtggtatggactgtagatggactgctgtatggactgcagctggactgtggtatgaactgtagatggactgtggtatgaactgtagatggactgtggtatggtctgtagctggactgtggtatgaaaTGTAAATGGACTGTggctggactgtggtatgaactgtagatggactgtggtatgaactgtagatggactgtggtatgaactgtaaatggactgtagctggactgtggtatggactgtagatggactgcggtatggactgtagatggactgctgtatggactgtagatggactgtggtatgaactgtgTAGACTGaagctggactgtggtatgaactgtagatggactgtagatggactgtggtatgaactgtggagactgtagctggactgtggtatggactgcagctggactgtggtatggactgtagatggactgcagatggactgtagatggactgtggtatgaaaTGTAGATGGACGgtagctggactgtggtatgaacggcagatggactgtggtatgaactgtgtagactgtagctggactgtggtatgaactgtagatggactgtggtatgaactgaaaatggactgtagctggactgtggtatgaactgtagatggactgtagctggactgtggtatgaactgtgtagactgtagctggactgtggtatgaactgtagatggactgtggtatgaactgaaaatggactgtagctggactgtggtatgaatTGTAGAtggactgtagctggactgtggtatggactgtagatggactgtggtatgaactgtgtagactgtagctggactgtggtatggactgtagctggactgtggtatgaactgtagatggactgtcgatggactgtggtatggactgtagatggactgtagatggactgtggtattaactgtgtagactgtagctggactgtggtatggactgtagctGGACTGCGGTATGGACTGTAGTTGGACAGTAGAttgactgtggtatggactgtagatgtactgtggtatggactgtagatggactgtggtatggactgtagatgaactgcggtatggactgtagatggactgtttTATTAACTGTGtagactgtagctggactgtggtatggactgtagctggactgtggtatgaactgtgGTATGGACTcctgtatggactgtagatggactgcggtatggactgtggtatggactgtagatggattgctgtatggactgtagatggactgtggtatggcctgtagatggactgtggtatggactgtagatggactgctgtttggactgtagatggactgtagtATGGACTTTAGATGGACTGTGGtttggactgtggtatggactgtagatggactgctgtttggactgtagatggactgtagatggactgtggtatggactgtagatggactgtagatggactgtggcatggactgtagatggactgtggtatggactgctgtatggactgtagatggactgcggtatggactgtggtatggactgtagatggactgtggtatggactgttgTATGGACCGTAGATGGACTGTGGTTTGGACtttggtatggactgtagatggactgtggtatggactgtagctggactgtggaATGAACTATAGATtgactgtagctggactgtggtatgaactgtagCAGGACTGTGGTAAGGgctgtagatggactgtagatggactgtagatggactgtggtatgaactgtgtagactgtagatggactgtggtatgaactgtgtagactgtagctggactgtggtatgaactgtagctggactgtggtatggactgtagatggactgtggtatgaaccGTAGAtggactgtagctggactgtggtatgaactgtagatggactgtagatggactatGGTATTAACCGTGtagactgtagctggactgtggtatgaactgtagatggactgtagatTGACTGTCGTATGAACTGTGTAGACTGTAGCTGGCctgtggtatgaactgtagaTGCACTGTAGATGGACTGTTGATGGACTGTAGaaggactgtagatggactgtggtataaactgtagctggactgtggtatggactgtagctggactgtggtatgaactgtagatggactgtagatggactgtagatggactgtagctggactgtggtatggactgtagatggactgcggtatggactgtggtatggactgtagatggactgaggtatggcctgtagatggactgtggtattaACTGTGtagactgtggtatggactgtagctggactgtagatggactgtggtatcaACTGTGTAGACTGaagctggactgtggtatgaacaGTAGATGGaatgtagatggactgtggtatgaactgtgTAGACTGAAGCTGGACTGTGGTATCAACTGTAGAaggactgtggtatgaactgtgTAGACTGTGGCAtgaactgtagatggactgtggtatgggctaatgtatggactgtagatggactgcggtatggactgtagatggactaacgtatggactgtagatggactgctgtATGGACTGTCGATGGACtgcggtatggactgtagatggactgtggtatggactgtagatggacagTGGCATGGACTcaagatggactgtggtatggactgtagatggactgtagatggactgtggtattaACTGTGTAGACTGTAcctggactgtggtatggactgtagctggactgtggtatggactgtagatggactgtagatggactgtggtatggactgtagatggactgtggtatgggcTGTAGATTGACtgctgtatggactgtagatggactgccgTATGGACTGTGgaatggactgtagatggactgcggtatggactgtggtatggactgtagatggactgatgaatggactgtagatggactgtggtattaactgtgtagactgtagctggactgtggtatggactgtagctggactgtggtatgaactgtagatggactgcggcatggactgtagatggactgcggtatggactgtagatagactgtagatggactgtagatggactgtggtatggactgtagatggaatgtggtatggactgtagatggactgctgtatggactgtagatggactaacacatggactgtagatggactgcagTATGGACTGTGgaatggactgtagatggactgctgtatggactgtagatggactgctgtATGGACTATAGATGGACTGCgttatggactgtagatggactgcggtatggactgtagatggactgtggtatggtctgtagatggactgtggtatggactgtagatggactgctgtatggactgtagatggactgtggtatggtcTGTAGCTGGattgtggtatggactgtagctggattgtggtatggactgtagctggactgtagATGGaatgtagatggactgtggtatcaACTGTATAGACTGAAGCTGGACTGTTGTATGAACAGTAGATGGaatgtagatggactgtggtatgaactgtgTAGACTGAAGCTGGACTGTGGTAtcaactgtagatggactgtggtatgaactgtgTAGACTGTGGCAtgaactgtagatggactgtggtatgggataatgtatggactgtagatggactgcggtatggactgtagatggactaacgtatggactgtagatggactgcggtatggactgtagatggactgtggtatggactgtagatggac

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106600562

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2398067 True 4954 lncRNA 0.47 3 3861807 3873627

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC100653486 LOC106600564 coding upstream 46917 3797542 ~ 3814890 (+)
LOC110508367 LOC106600566 coding upstream 70208 3790194 ~ 3791599 (+)
LOC110508366 LOC106600565 coding upstream 75173 3776296 ~ 3786634 (+)
LOC110508363 LOC106600569 coding upstream 153155 3701897 ~ 3708652 (+)
aknad1 LOC106600569 coding upstream 158040 3696204 ~ 3703767 (+)
LOC118944845 NA coding downstream 96725 3970352 ~ 3972045 (+)
LOC110508370 LOC106600557 coding downstream 387080 4260707 ~ 4280126 (+)
LOC110508371 LOC106600556 coding downstream 415690 4289317 ~ 4338388 (+)
LOC110508372 LOC106600555 coding downstream 465527 4339154 ~ 4343438 (+)
LOC110509198 LOC106600553 coding downstream 499170 4372797 ~ 4378889 (+)
G2096448 NA non-coding upstream 24602 3836209 ~ 3837205 (+)
G2096431 NA non-coding upstream 25798 3835666 ~ 3836009 (+)
G2096426 NA non-coding upstream 26791 3834512 ~ 3835016 (+)
G2096430 NA non-coding upstream 29564 3831852 ~ 3832243 (+)
G2096396 NA non-coding upstream 59979 3758863 ~ 3801828 (+)
G2096491 NA non-coding downstream 74534 3948161 ~ 3948541 (+)
G2096492 NA non-coding downstream 76855 3950482 ~ 3950689 (+)
G2096496 NA non-coding downstream 82707 3956334 ~ 3956594 (+)
G2096499 NA non-coding downstream 85014 3958641 ~ 3960099 (+)
G2096546 NA non-coding downstream 216769 4090396 ~ 4090613 (+)
G2095895 LOC106600579 other upstream 520288 3341184 ~ 3341519 (+)
yeats2 yeats2 other upstream 954602 2900784 ~ 2969598 (+)
G2094884 NA other upstream 1206716 2653863 ~ 2655091 (+)
LOC110509192 LOC106600604 other upstream 1678189 2094076 ~ 2190557 (+)
G2093960 mpz other upstream 2167338 1684106 ~ 1696486 (+)
G2096475 NA other downstream 13753 3887380 ~ 3907871 (+)
G2096472 NA other downstream 25959 3899586 ~ 3917985 (+)
G2097031 NA other downstream 662449 4536076 ~ 4536894 (+)
slc17a9b LOC106600547 other downstream 837845 4682499 ~ 4714289 (+)
G2098625 NA other downstream 2094934 5968561 ~ 5998314 (+)

Expression


Co-expression Network