G2121436


Basic Information

Item Value
gene id G2121436
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048592.1
NCBI id CM023246.2
chromosome length 43716683
location 25209088 ~ 25212487 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2425625
gtgtgtgtacttactgCCCTGAGCTTGTTCCAAGTTCCCCATTTTTCTGAAGCCCACTGGATGCCCACTCACAGGATCTGTGTCAGTCTGTTACCTTTCAACGTTTTCTCCAGTAAAACAATGGTACCTACCTACACCGTATGCTGCTCAACCAGGTCTGTAGCTCCATAAACCATATCACATGAACTATCTGGCTCCGTAAACCACAAAACCGTGTAAAACTGGCTCAAACCTGCCATGTTACTCCTGAAAATGATGTCCAATGTAACTCAAGCATGTCTCCAAGAGAACCAATGAATTATAGTCCAGATCTGTAGTTGTTTGGAAGACTGTGTGTCATACACTGGCACTGTCTACTCCATTGGACCCTTCTATATATTCGATATTACAGTAATACATCCGCCTATTTCAATGTTACAGCTCTGTTACTATGATTGATGAAATACAGATAAAATGTGCAATACTTATACGAAACACAAATTCTAAAACTAAATGATGTAATGgaaaaatgcagagagagagagcccctcCACAGTGTATGAATGTATGGGTGCGGGCCTGTCTCtttccagacagacagaagggcaGACAGTAAACATTGTTATACAAGTAGTAGCGTAGTCTCTATCGAGTGATATTAGTGCCAACAGAAATGTAATCTGAATTCAATCATTTTAAATGTAATCAAATTTGTTGGACCTATTATGACTAAATACCAATTTTTCTGGATTGTGAAAGTACTGTGCTGATGACGATACCCAATTATATTGGGAACTCTGTAGTGAAGACTAATATTTTGGCCTTAAATGTTGTGAATGTAAAAGAAAAGAGACACTAATCAGGTTTCCATCCGAGCTTCTTATGGGAGTAAAGTAGGTCAGATAAAAAATGTCACGACAagcctgatggaaacaggaaattTCCAAATGTTGACACAACTAAATACGCCTGGCGTGGGAACTTTTTGTGTCAAACTAATTATggcggtggaaacgcctttatgcacaaatattgatataataaccatcatgtaTGTCTAAGTAAACTTGGAGTCGTGCAATGgaatgttgtgtggtcctcccactacgactcggaaaagcatgcagtttattagaacttcacagggtggtgaaagtgcacagtgatgagcttgatgctctttTCCAATAAATATTCAGCATCTTATTCTTGTGACTTGATTATCGATGACTGGCTGCCATTCGACAAATAAAAATAACCTCACTCTTTTGTCCCTAATAATCTCATGTGTAGACTATACCCGCACTTTATCTGCAAGCTGTTGTTTAGAGAGCAGGTGCCAAGCCCAGTGTGCACATTCACCATATAATGCTACGTTtattgtgacaaaaccatcagtacaGTTTAAAATGCGAtgcattttaaaatattttttatgtacactatgtcatcacgcacagccttttgtctacaacaagtcaatttgatggaaacactgGTGGGAAACTGTACAtctttttatgcagattttagaatatttgcatgaaaatctgtcactaATTGGATACAACTTTTAGCTAATGATGAAGAAAAAGGTACTGCAGGTGAACAGTGATTTGGGTTACATGATTCCTTGTGAATATGGACTGGACTATATTGTACATTAGTTTTATCGATAAGGCCAACATTTCCCAACTTTGATTAGGTATTTGTCAAGTTATTTTGGATACGCACTTCAAAGGTATGTCAGACATCCTTCCCCAAAAGGACCTTTCTATGGATTTAATTTCAGGAAGATCAAAAACATCATAAATATCTTTGGGTCATATGTATAGGCTGCCATATTGTATCTGTTGTCTGCAAATGAATTACTGTGTTTGATTTGTGCAATGTACAGTCTAGAAGAGGAACAACTTGGGTATTCAATATTTTGTCAATGGCTGTACATTTTGAAATGTATTGGCTTACATTTCTTGTATTTGGGATTGTAGgcgatttaaaaatatatatttttttaacatggATCAATAACACTAGTGGATATCCTTAGTCTCAACTGGAGTCTTCAGCTGTCCCAATTAAACATTTCATCACTTGATTTGTCAACAATTCTGGGCAAATAATATTGTGAAGTCCAAAGACAGTTTAGTCTGGGGAATTTGAATGATTTTATACTCGTTATCTGTGAACACAGCTCTGGTACACTCACAAATCCACTGATAGTATGAACAAAGTCAAAGAAAGTCCCCTTCTCAGAGGTTTGATATCGCTTGGAATATATCAGCATTCAAACACTCCCCTGTTTTGAGTCTAAAATACTGCTACTGTTTACGAATGGGGAACCCAGATGCAGGCTAGTTCCCTTCTTACATTTCCTGATATTTCCTTCTCTGGACATTTCATTGGTTCATTGTATTCAACTCCCAACCAGTCGATCCAGTCCGCTGCTCTGCTATTCCATACCAGCCTACAATTGGTGGGTTGCCTTGTTACACGGGTCAGAAGATTTCTACATGGTTCATAGGAATATACAAAGTGCTTTGTCCGAGTGTTTGTCTTTGAGGATACACGTATATACATAATGTGTCCTAGTAGTGACATCATCCACAAACTACTTTGGCATCCTTCGGTACATCAGTGTGGTGTACAGATGAATTTGACCACTCCTATTGTTTCTCGTACTGTAAATATGTTGGGAGGGGAAGGGTTAATATGATCAAAGCTTTTGAAAATACACCAGTTGTACAGGTGTAATACCTCTGTTGTTGACCAGTTTTTGGGGTCTTTATCATTCTCCCTTTGTGTGGGTTACTGGCCTTTTCACAAGTGTCTCGTTCCTTATTTATTTGTAATTTGGCCTTGTCAAGAAAATACAAGTTTGTGATTGGTATAAAAATGATCATATTTGTATGTGTTCCGTTTCATTCATAGTTATGGGGATTATATAGATTCTTGTGGGTGTCTTTTTGAATGATTCTGTACATGTATGTATAACACCTGTACATTCCATCACAGACAGTGACCCTCACAACGGTCCTAAGGTTAGGAggattaatgtagcaggttaggagaattaggttaaggtcaaaaaaaaagatCAACTTTTGATGTAAATTTGACAAGCTGGATCCCTATTAGCTATGACCAGCTTGAGTAGAATTGTCTTGAAGCTAGCGTTTCTATGGCAACGAAGCCCAGGAAGAAgtgtgttttaaaaatatatataaactagGGTACCGGGGAGGAATTCCTACACCGGATATCTTGTTACAGCTGTTAAGTCATTGATAATCTgccattttttttgtcatttcatTAAGTTATAAGCAGGGTCATAGCTATATTCAATAAAATTCACAAGTTGATTTAACC
>TU2425626
gtgtgtgtacttactgCCCTGAGCTTGTTCCAAGTTCCCCATTTTTCTGAAGCCCACTGGATGCCCACTCACAGGATCTGTGTCAGTCTGTTACCTTTCAACGTTTTCTCCAGTAAAACAATGGTACCTACCTACACCGTATGCTGCTCAACCAGGTCTGTAGCTCCATAAACCATATCACATGAACTATCTGGCTCCGTAAACCACAAAACCGTGTAAAACTGGCTCAAACCTGCCATGTTACTCCTGAAAATGATGTCCAATGTAACTCAAGCATGTCTCCAAGAGAACCAATGAATTATAGTCCAGATCTGTAGTTGTTTGGAAGACTGTGTGTCATACACTGGCACTGTCTACTCCATTGGACCCTTCTATATATTCGATATTACAGTAATACATCCGCCTATTTCAATGTTACAGCTCTGTTACTATGATTGATGAAATACAGATAAAATGTGCAATACTTATACGAAACACAAATTCTAAAACTAAATGATGTAATGgaaaaatgcagagagagagagcccctcCACAGTGTATGAATGTATGGGTGCGGGCCTGTCTCtttccagacagacagaagggcaGACAGTAAACATTGTTATACAAGTAGTAGCGTAGTCTCTATCGAGTGATATTAGTGCCAACAGAAATGTAATCTGAATTCAATCATTTTAAATGTAATCAAATTTGTTGGACCTATTATGACTAAATACCAATTTTTCTGGATTGTGAAAGTACTGTGCTGATGACGATACCCAATTATATTGGGAACTCTGTAGTGAAGACTAATATTTTGGCCTTAAATGTTGTGAATGTAAAAGAAAAGAGACACTAATCAGGTTTCCATCCGAGCTTCTTATGGGAGTAAAGTAGGTCAGATAAAAAATGTCACGACAagcctgatggaaacaggaaattTCCAAATGTTGACACAACTAAATACGCCTGGCGTGGGAACTTTTTGTGTCAAACTAATTATggcggtggaaacgcctttatgcacaaatattgatataataaccatcatgtaTGTCTAAGTAAACTTGGAGTCGTGCAATGgaatgttgtgtggtcctcccactacgactcggaaaagcatgcagtttattagaacttcacagggtggtgaaagtgcacagtgatgagcttgatgctctttTCCAATAAATATTCAGCATCTTATTCTTGTGACTTGATTATCGATGACTGGCTGCCATTCGACAAATAAAAATAACCTCACTCTTTTGTCCCTAATAATCTCATGTGTAGACTATACCCGCACTTTATCTGCAAGCTGTTGTTTAGAGAGCAGGTGCCAAGCCCAGTGTGCACATTCACCATATAATGCTACGTTtattgtgacaaaaccatcagtacaGTTTAAAATGCGAtgcattttaaaatattttttatgtacactatgtcatcacgcacagccttttgtctacaacaagtcaatttgatggaaacactgGTGGGAAACTGTACAtctttttatgcagattttagaatatttgcatgaaaatctgtcactaATTGGATACAACTTTTAGCTAATGATGAAGAAAAAGGTACTGCAGGTGAACAGTGATTTGGGTTACATGATTCCTTGTGAATATGGACTGGACTATATTGTACATTAGTTTTATCGATAAGGCCAACATTTCCCAACTTTGATTAGGTATTTGTCAAGTTATTTTGGATACGCACTTCAAAGGTATGTCAGACATCCTTCCCCAAAAGGACCTTTCTATGGATTTAATTTCAGGAAGATCAAAAACATCATAAATATCTTTGGGTCATATGTATAGGCTGCCATATTGTATCTGTTGTCTGCAAATGAATTACTGTGTTTGATTTGTGCAATGTACAGTCTAGAAGAGGAACAACTTGGGTATTCAATATTTTGTCAATGGCTGTACATTTTGAAATGTATTGGCTTACATTTCTTGTATTTGGGATTGTAGgcgatttaaaaatatatatttttttaacatggATCAATAACACTAGTGGATATCCTTAGTCTCAACTGGAGTCTTCAGCTGTCCCAATTAAACATTTCATCACTTGATTTGTCAACAATTCTGGGCAAATAATATTGTGAAGTCCAAAGACAGTTTAGTCTGGGGAATTTGAATGATTTTATACTCGTTATCTGTGAACACAGCTCTGGTACACTCACAAATCCACTGATAGTATGAACAAAGTCAAAGAAAGTCCCCTTCTCAGAGGTTTGATATCGCTTGGAATATATCAGCATTCAAACACTCCCCTGTTTTGAGTCTAAAATACTGCTACTGTTTACGAATGGGGAACCCAGATGCAGGCTAGTTCCCTTCTTACATTTCCTGATATTTCCTTCTCTGGACATTTCATTGGTTCATTGTATTCAACTCCCAACCAGTCGATCCAGTCCGCTGCTCTGCTATTCCATACCAGCCTACAATTGGTGGGTTGCCTTGTTACACGGGTCAGAAGATTTCTACATGGTTCATAGGAATATACAAAGTGCTTTGTCCGAGTGTTTGTCTTTGAGGATACACGTATATACATAATGTGTCCTAGTAGTGACATCATCCACAAACTACTTTGGCATCCTTCGGTACATCAGTGTGGTGTACAGATGAATTTGACCACTCCTATTGTTTCTCGTACTGTAAATATGTTGGGAGGGGAAGGGTTAATATGATCAAAGCTTTTGAAAATACACCAGTTGTACAGGTGTAATACCTCTGTTGTTGACCAGTTTTTGGGGTCTTTATCATTCTCCCTTTGTGTGGGTTACTGGCCTTTTCACAAGTGTCTCGTTCCTTATTTATTTGTAATTTGGCCTTGTCAAGAAAATACAAGTTTGTGATTGGTATAAAAATGATCATATTTGTATGTGTTCCGTTTCATTCATAGTTATGGGGATTATATAGATTCTTGTGGGTGTCTTTTTGAATGATTCTGTACATGTATGTATAACACCTGTACATTCCATCACAGACAGTGACCCTCACAACGGTCCTAAGGTTAGGAggattaatgtagcaggttaggagaattagctaaaatgcaaaaaaaaagatCAACTTTTGATGTAAATTTGACAAGCTGGATCCCTATTAGCTATGACCAGCTTGAGTAGAATTGTCTTGAAGCTAGCGTTTCTATGGCAACGAAGCCCAGGAAGAAgtgtgttttaaaaatatatataaactagGGTACCGGGGAGGAATTCCTACACCGGATATCTTGTTACAGCTGTTAAGTCATTGATAATCTgccattttttttgtcatttcatTAAGTTATAAGCAGGGTCATAGCTATATTCAATAAAATTCACAAGTTGATTTAACC

Function

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2425625 False 3351 lncRNA 0.38 2 25209088 25212487
TU2425626 True 3351 lncRNA 0.38 2 25209088 25212487

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110508783 LOC106599501 coding downstream 531936 24664869 ~ 24677152 (-)
LOC110508781 LOC105017795 coding downstream 551221 24628922 ~ 24657867 (-)
LOC110508780 NA coding downstream 581938 24623953 ~ 24627150 (-)
LOC118944874 NA coding downstream 661692 24545663 ~ 24547396 (-)
LOC118944850 NA coding downstream 718762 24487395 ~ 24490326 (-)
LOC110508788 LOC106599520 coding upstream 2855 25215342 ~ 25232530 (-)
LOC110508789 LOC106599527 coding upstream 131963 25344450 ~ 25412332 (-)
LOC110508791 LOC106568850 coding upstream 469831 25677135 ~ 26069268 (-)
LOC110508193 LOC106599530 coding upstream 917940 26130427 ~ 26266904 (-)
LOC110508194 LOC106599532 coding upstream 1083287 26295774 ~ 26558418 (-)
G2121438 NA non-coding downstream 5771 25201914 ~ 25203317 (-)
G2121441 NA non-coding downstream 51355 25156177 ~ 25157733 (-)
G2121417 NA non-coding downstream 91356 25117509 ~ 25117732 (-)
G2121395 LOC106599513 non-coding downstream 100888 25104054 ~ 25108200 (-)
G2121361 NA non-coding downstream 195078 25004416 ~ 25014010 (-)
G2121549 NA non-coding upstream 116955 25329442 ~ 25330859 (-)
G2121580 NA non-coding upstream 185125 25397612 ~ 25397848 (-)
G2121599 NA non-coding upstream 209641 25422128 ~ 25422360 (-)
G2121610 NA non-coding upstream 229606 25442093 ~ 25442306 (-)
G2121641 NA non-coding upstream 267064 25479551 ~ 25479841 (-)
G2121444 LOC106599515 other downstream 60568 25144062 ~ 25148520 (-)
G2120836 NA other downstream 474101 24730674 ~ 24734987 (-)
LOC110508185 LOC106569033 other downstream 1879473 23317575 ~ 23353162 (-)
G2118200 brinp2 other downstream 2601282 22594533 ~ 22607806 (-)
G2122515 NA other upstream 734246 25946733 ~ 25950453 (-)
G2125203 LOC106599130 other upstream 3332454 28544941 ~ 28551514 (-)
G2125253 NA other upstream 3414568 28627055 ~ 28685735 (-)
G2125270 agla other upstream 3450221 28662708 ~ 28663426 (-)

Expression


Co-expression Network