G2125203 (LOC106599130)


Basic Information

Item Value
gene id G2125203
gene name LOC106599130
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048592.1
NCBI id CM023246.2
chromosome length 43716683
location 28544941 ~ 28551514 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2429842
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>TU2429843
TCGACCTCATAGAATGGTGAAATACAGAGTGACTTCTGACGGAGACGTCTGTTTCGTTAGCAACCACGCTATCCACCAATCACCACGTCTATTCTGAATGCACACAGGCCAATCTTACAGATGTATAATGAAGCCAACTGACCTAGCAACCATGGAAATATAATGACTAGATTATATTTCTAtaaattctatttctatgctctCAAGTCTATACAAATACATCCTCTGCCTAAACGTCAAACATCTTCTTCTGCCAAACCTGATTTCTTTCTGTAGATATGTTGTCCTACCTACTCTACACTGTAACAGCATTGTCTGCATGGCAAAGTTACAAAGATTGTATTTACAGTGATAGAAAGAATGAAGAGTTAATcaattggttgattgattgatgaattgAGTAGGTATAAATCAAGGTACCAGCCATAACTTTCAAAAGGTGTCATATACAGAAAATAAGCCTTTAGATACAGTACATATAAAATGACCATGCAGATATGACCACAGTTTAAAGCCATCATCGAAGGTACAAGTATACAGGAAAATATACCAATTTTTCCCTTCAGTTGTCGCTGCTAATATACCCTTTGAGAAGTAAAAAATATGTGTAATATTTATATAATATCAATTCAGTTTCaatggaaaaaaaagaaaacctTGATTATTGATAGAAATGTTCAACAATATCTAAAATGTATACATCCAGTCTTACTTTTGTATTATTGTGTACAAACCAGGAGTTGGAACCAGctcagggaacagaaccaaaaactggaaataaacaacatttttcaaggaacagaatcagaaccggGAATGAAAGTGATTTATACTGTTCCGGAACATAACTCTTATTTTAAAAGGATGGGAACCATTTAATAACGTTATTTTATGCTCCAGGCATGTTTTTTTCTGTCCCACAAAAAAATGCTACAAAGTGCCTATacaaagccctcactctgtcactcagaaacacattccagtgtctgcctgacTGCCAGCTGAAAgtcttaaattattatttttttactttgtggtatccaattagtagttacagtcttgtctcatcgctgcaactcttgTACGGACTCgaaagaggcgaaggtcgagagccgtgcgtcctccgaaacacaacaaagccgcactgcttcttgacacaatgcccacttaacccggaagccagccgcaccaatgtgtcggaggaaacaccgtacacctggtgactgtgtcagcgtgcactgcgcccggcccgccacaggagttgctagtgcgtgatgggacaaggatatcccggccaaacccttccctaacccggacgacgctgggccaattgtgcgccgccctatgggtctggagcctggactcaaactcagaatctctagtggcacagctagcactgcagtgccttagaccaccatGCCATCGGGAGACACAGATGAAAATCTTtgcctgtgtgtgtacgtgtgtaggctacctgcccctcccaTCTGAAGCATAGGCTACTGCAGCCTACTTACATTACTAGCGTGATTCATAAATTAGGGAGAAACATTTTTAATTGGAGAAGAATGGATTCACTATTTCAATGCTTGTTAAGGATACTATAGTAATtacgtttcacattggatttattaactacaaaaaggtagGACGTGTTTGTTATTTATTATTCTGgtgccgctctgcacacacaagcttacaagctagctctggtccaacgttaAACCAACTCtcggaagttcaaagacattcaatgTTCCTCCATAGAAGCCCCTCCTACAATTCTGTAGGCCTAATTGAGATCATGCATGTCTTAACAAGATGCCCAGTGTTgttctctccccACCCGCAAAATTTCTGTCACATCTCACAACCTACAGTTGTCTGTCCAATGTAAACACCTATagctccatagcaagctgctctatccacTGATTGATTAAgtcatttaaatatatatatattttaaaaggtttaaaaaggaacagaaacgATATTAACCATTTTTGGGGTTCGAACCGTTTCAGAACTTTATTTAGCTGGTCGGAACAGTATAAaggaacaacaaaaaaagaatggTTGGTACTGTTCAGAACGAAACGATTGGAAAAGAATTTCAGTTCCAACCTCTGGTACAAACACAAACAAGCTCAATACATGAATTATATTGGTAATCCAAATGCAACTGGCATATTATGACCACTGTAAAAACGAGTGTAAACACTATTGTAGCTATCTCAGGTGTCATGAGTAAAGCTAGTGTTCTATGCACATAGCACTGTATATCAGGGATCTCAAACTGACAGGCCTCATTAAAGACAGAATGTGGAACTGGGTGAAATGTCTTTGAGACCCCTGATGTATATGAACAGTACGTTCTTGGCAGTTTTATAAAGGTAtcagaggctggtgggaggagctatatgaggacgggctcattgtaatggctggaatgaaaaAAATGGTTTCCATATGCTTccgtatgtttgatgtgtttgataccattccatttattctattccagtcattacaatgagcacatcctcctatagctcctcccaccagcttccTCTGCAGCATAGTATACTAtacaggtcgcaattgtaaattagaacttgttctcaacttgcctgcctggttaaataaaggtgaaataaataaataaatatgtactGTAAAAGCCACACTTTCATTCATGTATTGTTGATTGGCCCTACCTTTGCACAACAAACGGGATAAAAATCATTGAAAGGTTTTCATTGAACAATTATATTGTTCAATGGCAGCATATAACACACATAGAGTAATGTTAGAATTACAGTGCCACTAATCAATGGTAGTGTTTGTAATGTTATTTTTGCACTTACATAGTTTGGATACTGAGTATGACTCACTTGTTTACTGTTCTcttgtgggagggagagggatgctATTGCCATTATACAACCTCTCCTCAGTCCTGAATCGTGCATGGTTCATTATCGCCCAAGGAACACTAATGTATGATTGATTTTAATCTAACAGCATAACCAAAGTTCCCAGCACAGGCTGTGCTGCCACATTGTCCAATCGGGAAAATCAAACTGGACAATTAAATCAATTATTGTGCACATATCAATGTACCAGGAAGAGCAGCCTCTACCGAGAGTGGTTTCCCTTTTATGTCACTCATCAATAGATACATTTACTTAAAACATATTTGAGTAGCATTAAAAACTTGTACAGCTGTTAAACATTTtgcagaaaaaaacaaacattttcttaAACTACCATACAGGTTGCTAATAGGAAAAAGGTCACTGTATGTATCAAAAAACAGCGAATACTTGTTAGTATACTTCGTCAAAGGCAATACAGGATGCAAAGTGTAAAGTTCCTCTTGAATTTCCAGTCTTTAAGCAAAACTAATTTGATTAAGGTACTGTATCCACTGCTCCTGGTAAGTAATTATCTTACATAGTTAATCCACTGCTCCTAGAAATATATTGTCTTACATACTGTATCCACTGCCCCTATTAACATACTTCATTTGCTGCCCTTGTAAGCTAAGAAAAGCATGTTATACTGTTCGAGGGATACAATGTGTGGCTAAAGCACAGGGAAAGACTGGTGTGTTCACAGCGATAATTAGGGTTGCAAAATGATGTTCATTtccccaaaattcccaggttttacagaaatcccagttggaagaACCCTGGAGTCGTGAGGGaattcaaccaggatttctggacaACCAGGAAATTTGTGGAAAGTTAACGGAATTTTGCAACCCATGGATAATATTTGGTGATTTCTTAAAACATTGCTCTGTTGTAAATCACCTGCCAAACAAATTCATATCCCGCAAAAGttctaaaaacaacaacattgaataAACCCATATTTGTTAAAATAGACTATCAATAATTAGTAATAAGCCAATGAAGACATCTGAATATTGTTGCAGATCAATCGGGGGAACTATAAATATGTACATagcaaaaaatataaaaatgtattttcacaATTGTCATGGTTCGTCGTCTTATGAAAAGCCCCTCCAGTGTTGCTATGCAGTGCAACACCCAATCATGGTCACATTACACAAGGACATTTATATGTTGCTGAGAAAGCGCACAGTACATCAATGGAAAAGGCCTACAAAACATCATGTCCATCAACTTAATACATAACCTGCATGGTTCATTGCCATCAAAGCCTCTTGCAATTTGATAACAAATAGTATCAAATTCGAAGTTAAAACCACTATAGCCATTGTATTAAAAGAGTTAGTACTTGTGCTTGTCAAATGGAAGTTTATGTAATGAAATAAGGTTTGAAAGGTGTGCGCAAAATGACTTTGTGGCGATTATTCCAGCATCTCCTGCATTGTTTCATTTTCAAATCAAAAAAGAACCATGGTGCTTGGCTGGTGCGTAAAAACCACGAATTCAGACAAACAACGAGGTGAAATGGGTCTGCACTCAAAAATCTGTCACATAAAGCTTActtcattaaaatatatatatttttactgcaTTTctcaaagaacacacacatacatttaatCCGGTCCTATCAAACCAAGTCTAACAACAAACTgctgaaaacaaaaaaaaaaaacagatttttgCAGAATGGAAAAACACTGTAGTGGCCTTCCTGTACTAGACACACTGAGCTAGCTAATGAATTATGACCTTCAGAATGGCACTGGAAAAGGTAAGCCAGCCCAGTTAACACCACTGAATCCATGATGGGTTTGATAATATACAGTCGTAGCTGAATGTGTTCAATGGTCCTATTGTGGGTTCCAGACTAGACCCAGTGTAGAAGGCCACTCATGGGGGGACAGATAGGCCACCACATGGGCGGTAAGGGGGAATGGTAAGGGTAAGGGATGACTGGGGCAGCTGTTCACTCTCTATAGGCCAGTCCCAGGGTGGGGGGCGGTGTGGGGGAGGTCCCTTTGAAATAGTTCCTGGAGTTGTCTGGACTCTGACCTCTATCCGGGAGCA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Function

NR:

description
phospholipid phosphatase-related protein type 4-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2429842 False 6520 TUCP 0.45 3 28544941 28551514
TU2429843 True 6520 TUCP 0.45 3 28544941 28551514

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
plppr5a LOC106599133 coding downstream 38002 28463481 ~ 28506939 (-)
LOC110508849 NA coding downstream 141048 28398505 ~ 28403893 (-)
LOC110508200 NA coding downstream 177732 28193876 ~ 28367209 (-)
LOC118944862 LOC106599141 coding downstream 476483 28044850 ~ 28068458 (-)
LOC110508843 LOC106599203 coding downstream 542743 27999061 ~ 28002198 (-)
LOC110508854 LOC106599121 coding upstream 81201 28632715 ~ 28639924 (-)
LOC110508857 LOC106599111 coding upstream 154574 28706088 ~ 28753683 (-)
dusp12 dusp12 coding upstream 206064 28757578 ~ 28760180 (-)
LOC110508860 LOC106599100 coding upstream 266090 28817604 ~ 28840725 (-)
LOC110508863 LOC106599199 coding upstream 309211 28860725 ~ 28862370 (-)
G2125197 NA non-coding downstream 4567 28538254 ~ 28540374 (-)
G2125143 NA non-coding downstream 87318 28457381 ~ 28457623 (-)
G2125130 NA non-coding downstream 104869 28439793 ~ 28440072 (-)
G2124908 NA non-coding downstream 123729 28421007 ~ 28421212 (-)
G2124904 NA non-coding downstream 125680 28418918 ~ 28419261 (-)
G2125259 LOC106599119 non-coding upstream 88690 28640204 ~ 28641164 (-)
G2125272 LOC106599117 non-coding upstream 115027 28666541 ~ 28667665 (-)
G2125314 NA non-coding upstream 188690 28740204 ~ 28740958 (-)
G2125328 NA non-coding upstream 214482 28765996 ~ 28766210 (-)
G2125336 NA non-coding upstream 217065 28768579 ~ 28768817 (-)
LOC110508791 LOC106568850 other downstream 2475732 25677135 ~ 26069268 (-)
G2122515 NA other downstream 2594488 25946733 ~ 25950453 (-)
G2121457 NA other downstream 3270315 25198248 ~ 25274626 (-)
G2121444 LOC106599515 other downstream 3396421 25144062 ~ 25148520 (-)
G2120836 NA other downstream 3809954 24730674 ~ 24734987 (-)
G2125253 NA other upstream 75541 28627055 ~ 28685735 (-)
G2125270 agla other upstream 111194 28662708 ~ 28663426 (-)
G2125290 NA other upstream 140625 28692139 ~ 28692470 (-)
G2125723 NA other upstream 333954 28885468 ~ 28885854 (-)
G2125813 NA other upstream 526525 29078039 ~ 29078744 (-)

Expression


Co-expression Network