G2127817 (gbg12)


Basic Information

Item Value
gene id G2127817
gene name gbg12
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048592.1
NCBI id CM023246.2
chromosome length 43716683
location 30995158 ~ 31136091 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2432830
TTCGTCACGAAGCGGACGAGGGAGTGTAGCCTAGTCATACGGGCAAGTAGGTGGAGAAAATAAAATAATCAACGATATTTACGATAAGCGACAGCCAACACCGTGAGAAAGTGAAAGTGGCACCAGTTGGCAGTCCCAAAGACCGTCGGTTGATCTGCTTTTCATAGCTTTCAACTGTTATTGAGTGAGGTCTCCTCCTAGTTGGTGACGGATACAGTAGGCGACACGGGGAGACCAGCTTGTATTGCCCTCGCCAGATTTCATAAGATTAGATTTCAAAATATTTGACGAGTGGTGTGGAGGCCAAGATGTCATCGAAGATGCCAAGCTCTAACAACATAACTCAGGCCAGAAGGACAGTACAACAGCTAAAGATAGAGGCCAGTATTGAGAGGATAAAGGTATCCAAGGCCTCAGCGGACCTCATGCACTACTGTGGCGAACATGCCAAGTACGACCCTCTGCTCATGGGCATCCCTGCCTCAGAGAACCCCTTCAAGGACAAAAAGCCTTGCGCTATATTGTAATGACCCCTTTATGTATCTGTTGGCTTTTTAATATTCCTGTATGTCTTTTTTTTCTACTCATCCACCCGTCATGCCTTAAAGCCTATAACCTTACCCTTTAATGAAAATGTTGTATTTTATCACTCACGTTGAACATATTTACAGACATAACATACAATGCATTGATACAGTACATCGGTCAAATATACCTTGGGACACTGACTGTTAATGTGTGTCTGATTTAGCTCAGTGGATTTAGCCGATGTTTCCGACCATCCCTTTAACGAGTCTGTTTTAATCGTATCTTCTGTCATTTGTATTATAATGACCTAATTTAATATATTTCAGGCTTTCGAGTCATGGTTGGGacatgtggctgtattgtcttctTCCCATTGACTCATCATTGACCCGTGCAGCGTTCACGTGCTAGTTGGAACTAGAAAACTCAGACATGTttgacttgctaactggttgaacaGGGCAtgtgtataactacaaccagttagcaaaTCAAACATGTCAGAGTaacctagttccgactagcatgtGAACGCAGCTTCATGCTGTTTATTAATAACTTACTGGTTCAGCAGGATGGCATCTGGACTGTCAGTGAGCAATGAAGGAAGTAGACCCAGGGACAAATATTTTCTAAAATAGACATCATCAGAGCCCTCAACCTTCCATTAATGTAAAGAGTATAAGTTTTTGATTAGTGCTGAGGATATTTTAACTCACTGCCAATTTTCGGATGGGAAACTGCAGTGTACAGCTAAGACAGGTAATTCACAACCTCAGTATACAGCACTCCACCCAGCCATTTAACCCAGGTGTTACATAACAGAACACTGTGAGCCAAGTCACCTTAACATATTTACGATAGTGATCATGTAATCAATGTATAGGTTGGTATTTTAAAGAGGGGGTTCAGGTACAAGTATTCTGTTGGGAGAGACCATAGGAGGTGCACCAGCTTGGCACATGGGTTGTTATTAATGGTGTAATAAATTATTTTCACTCCCAACTATGTGCACTATACCCTGTATTTGAGTAGACTGGTCTGATAGACTAgaagtaacatagtaaacgtacaTCCGAGACACtcaaattacactgaacaaaaatataaatgcaacatgtgaagggctggtcccatgtttcatgagccggAAAAAAAATCCCAGAGATATTTCCCTACGCCCAAAAAATGAATTTCTCTTAAATTACGTGCAAAAAATTGTTTACAcccttgttagtgagcatgtatcctttgtcaagataatcaatctacttgacaggtgtggcatttcaagaagctcattaaactgcatgatcattacacaggtgcaccttgtgctggggacaatcaaaggccactctaaaatgtgcagtttggtcacGCAACGCAATGGCACaattctcaagttttgagggagcgtgcaattgacatgctgactgcaggaatgtccaccagagctgttacctaccataagccacctcccacatccttttagagaatttggcagtacgtccaaccggtctcacaaccggagaccacttgtaaccacaccagcccaggacctccacatctggtttcttcatctgcgggattggctgggcctggctccccagtgggtcgGCCTGACTTcgaagtgggtgggcctatgccctctcaGGCCCACCCATTGCCTCGCCCttgcccagtcatatgaaatccatagattatggcttAATGAATGTATTCATATTGACTGATTTAtttgtatgaactgtaactcaacaaaatcttagaaatggttgcatgttgcatttatattttatttcattatAGTATATGACATGTTAcctttggtatggttacataagatagAAAGTTagttaaggcaaaaacaaaaggaggttggttggttgggatgggatgggcgtATAATGCGAATGTCTAGCAGCACAAAGGTTGCATgcttgaatctcatcacggacaaattAAGCATTTTAGCAACTtggcaactacttactacttttttttAAGCTATTttacaactacttagcatgttaaccctaacccttttagctggCCCttcccccaaccttaacccttttagcccAACTCCTAACCAGAACCCCTAAGCCCtagagctaacgttagccagctagctaatgttagccacctaacCAACGTtaaccacaacaaattggaattcgtaacatatcatcaAAAAActgatgatggacatccacaaattaacacatatcatacgaaacgtaacatatcatacgaaatggagtGTCTCAATTTACAAACAGAATAATactaaatgctctgagaccacgtTGATTTGAAGCTGACCCCAATGTCCTGTGATAGTACTAAGTATGGTATTTGGGGGggcaggaccaagtttgggaaactctGTCCTATTGAACAGTAAAAAATAGAATGTCCCGTATGCCCTGTCGGTTAGCTGTTGGGAGCATGTCTCGATAAAACGAACCAGCTGTATCGATGTGGTTAGCACAGATAGGCTGGAAAGTATAATTATGTTTGCATTCACAAAGCCTTACAAGTGTTTGCATTGTGGTgtgaagattattatttttttatttgttaaatgaAATGGATCTTTCTGTGCTGATTTCCTGTGATTTCTAACTGAATTGTGCCATCGTCTTGTCACTAGCAGAAGAGAAAAGAACATGTCTGATTGTATACACCTGGTGCTACTGTTTGTAATGTTTGTGTTATCCTCCCTCCAAAAGGTACTTCATTCATCATAAAGGTCTTGAAATCAGAGACAGGGAGACCCAGTAACCCATTATGAATTATTGAGCGATGACAATTGTATCTCGACGACTTTTCTCTCTGACAAGTGTATCTCTCTAATATGCTAAATCTGGCTACTGTTACTTTGTGTGACATCACCAGACAATTCTGATTCAACCAGCATACCAGCAATGGCCTTTATATACCTTTGTGAGACTCGTACGTGACCTTTCCCTGACCCTCTGTGAAGACAGTGTGAACCTGGTGGATTAAAGACATCTGTATGTGGTTTTGTTCATTATATCAAGTGATGGagcctttgtttctctctctgctgagtACAGTCTTTCCTGTTGTTATTAAACATAGATTTATAATTGCACaaaaaaaaaaatcagttgtAATGAATTCTTGTAGAAAATAGACTTCATGACACtgttatgaccatcataatcatataagccagataggcctatcatgTACATGACCTTATGTCAGTAgtcagtcaaaaag
>TU2432829
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Function

NR:

description
guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2432830 False 3783 lncRNA 0.41 5 30995158 31136091
TU2432829 True 3777 lncRNA 0.42 4 31084190 31136091

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110508937 NA coding downstream 14706 30978719 ~ 30980452 (-)
ptger4c LOC106599187 coding downstream 87183 30905879 ~ 30907975 (-)
LOC110508928 mrpl34 coding downstream 288567 30705085 ~ 30706591 (-)
LOC110508927 LOC106598960 coding downstream 290381 30700542 ~ 30704777 (-)
LOC110508217 LOC106598972 coding downstream 345323 30629942 ~ 30649835 (-)
LOC110508941 gp177 coding upstream 1995 31138086 ~ 31169294 (-)
LOC110508942 LOC106598932 coding upstream 37836 31173927 ~ 31214079 (-)
LOC118944807 LOC106598929 coding upstream 117842 31253933 ~ 31254937 (-)
LOC110508943 LOC106598918 coding upstream 122978 31259069 ~ 31280002 (-)
LOC110508945 LOC106598921 coding upstream 149055 31246275 ~ 31305211 (-)
G2127673 NA non-coding downstream 9044 30985073 ~ 30986114 (-)
G2127637 NA non-coding downstream 63692 30924247 ~ 30931466 (-)
G2127615 NA non-coding downstream 110373 30884465 ~ 30884785 (-)
G2127614 NA non-coding downstream 111747 30883183 ~ 30883411 (-)
G2127609 NA non-coding downstream 120147 30874419 ~ 30875011 (-)
G2128197 NA non-coding upstream 82971 31219062 ~ 31219909 (-)
G2128215 LOC100380853 non-coding upstream 106076 31242167 ~ 31242441 (-)
G2128200 NA non-coding upstream 109031 31245122 ~ 31283855 (-)
G2127455 NA other downstream 439971 30553589 ~ 30555187 (-)
G2127177 NA other downstream 560304 30434435 ~ 30434854 (-)
LOC110508917 LOC106598978 other downstream 593351 30399711 ~ 30401807 (-)
LOC118944842 NA other downstream 1871416 29118684 ~ 29123806 (-)
G2128216 NA other upstream 108000 31244091 ~ 31244692 (-)
G2128242 LOC106584167 other upstream 183192 31319283 ~ 31323364 (-)
LOC110508968 LOC106598866 other upstream 575517 31708667 ~ 31761665 (-)
G2128568 NA other upstream 746624 31882715 ~ 31883140 (-)
LOC110508982 NA other upstream 886967 32023057 ~ 32029225 (-)

Expression


Co-expression Network