G2135679


Basic Information

Item Value
gene id G2135679
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048592.1
NCBI id CM023246.2
chromosome length 43716683
location 40112584 ~ 40115950 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2442188
TGGAAGGAGTAGGGTGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAAGGAGTAGGGGGTCTCAGCAGGGTGGATGTTGGAGGTGGAAGGAGTAGGGGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGGGGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAAGGAGTAGGGGGTCTCAGCAGGGTGGATGTTGGAGGTGGAAGGAGTAGGGTGTCTCAGCAGGGTGGATGTTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGGGGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAAGGAGTAGGGGGTCTCAGCAGGGTGGATGTTGGAGGTGGAAGGAGTAGGGTGTCTCAGCAGGGTGGATGTTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGGGGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAAGGGGTAGGGGGATCTCAGCAGggtggaggtggatggtgtaggGTGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtaggggggtctcagcagggtggatggtggatggtgtaggggggtctcagcagggtggaggtggaaggtgtaggGTGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGTGGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGTAGGGTGGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAAGGGGTAGGGGGGGTCTCAGCAGGGAAGATGGTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGTGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGTGGTCTCAGCagggtggatggtggatgttgtAGGGTGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGTGGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAGGTAGAAGGGGTAGGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggaggtggaaggggTAGGGTGTCTCAGCAGGGTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggTGGAAGGGGTAGGGTGTCTcagcagggtggagggaggaggtggaaggggTAGGGTGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGTGTCTcagcagggtggagggaggaggtggaaggggTAGGGTGTCTcagcagggtggagggaggaggtggaaggggTAGGGTGTCTcagcagggtggagggaggatggtagAAGGGGTAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaggtggaaggggtagggggtctcagcagggaggagggaggatggtagaAGGGGTAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggctggtggaggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggTGGAAGGGGTAGGGGGTCTCAGCAGGGTGGAGGGAGGCTGGTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggtagAAGGGGTAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggctggtggaggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggtagAAGGGGTAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggctggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggTGGAGGTAGAAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGGTCTCAGCAAGGTGGATGGTGGAGgtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGAGTCTcagcagggtggagggaggatggTGGAAGGGGTAGGGAGGTCTcagcagggtggagggaggatggtggaggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggTGGAGGTGGAAGGGGGGTCTCAGCAACAGCGCATGCGTGGCGGGTTGAGCTCAGGAGGAACGTCTGGTTCAGGCTGCAGAGACAGGA
>TU2442190
TGGAAGGAGTAGGGTGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAAGGAGTAGGGGGTCTCAGCAGGGTGGATGTTGGAGGTGGAAGGAGTAGGGGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGGGGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAAGGAGTAGGGGGTCTCAGCAGGGTGGATGTTGGAGGTGGAAGGAGTAGGGTGTCTCAGCAGGGTGGATGTTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGGGGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAAGGAGTAGGGGGTCTCAGCAGGGTGGATGTTGGAGGTGGAAGGAGTAgggggtctcagcagggtggatggtggatggtgtaggggggtctcagcagggtggaggtggaaggtgtaggGTGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGTGGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGTAGGGTGGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAAGGGGTAGGGGGGGTCTCAGCAGGGAAGATGGTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGTGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGTGGTCTCAGCagggtggatggtggatgttgtAGGGTGGTCTCAGcagggtggatggtggatggtgtagGGTGGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAGGTAGAAGGGGTAGGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggaggtggaaggggTAGGGTGTCTCAGCAGGGTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggTGGAAGGGGTAGGGTGTCTcagcagggtggagggaggaggtggaaggggTAGGGTGTCTCAGCAGGGTGGATGGTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGTGTCTcagcagggtggagggaggaggtggaaggggTAGGGTGTCTcagcagggtggagggaggaggtggaaggggTAGGGTGTCTcagcagggtggagggaggatggtagAAGGGGTAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggtctcagcagggaggagggaggatggtagaAGGGGTAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggctggtggaggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggTGGAAGGGGTAGGGGGTCTCAGCAGGGTGGAGGGAGGCTGGTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggtagAAGGGGTAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggctggtggaggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggtagAAGGGGTAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggctggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggTGGAGGTAGAAGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGGTCTCAGCAAGGTGGATGGTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGGGTCTcagcagggtggagggaggatggtggaggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggTGGAGGTGGAAGGGGTAGGGGGAGTCTcagcagggtggagggaggatggTGGAAGGGGTAGGGAGGTCTcagcagggtggagggaggatggtggaggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtagggggggtctcagcagggtggagggaggatggtggaaggggtaggggggtctcagcagggtggagggaggatggTGGAGGTGGAAGGGGGGTCTCAGCAACAGCGCATGCGTGGCGGGTTGAGCTCAGGAGGAACGTCTGGTTCAGGCTGCAGAGACAGGATACTGTTGGAAAGCTCCCTACTGGGAATCTCCAGAGGCATCTGAtgagacaggaagacagaacaCAGAACAGGAAGTTAAcagacagtagaaacagaacgTCTTTATTACAGGCTACAGCTACATGTTATTACAGGCTACAGCTACATGTTATCACAGGCTACAGCTACATGGTATTACAGGCTACAGCTACATGGTATTACAGGCTACAGTAACACACAAGACAATATTGGGAATTCTAGGAAAACATTTTAGGAAATACTCCACAGGCATTTGGTGAGAAAGGAAGAAGACCGGAAGTAGACAGGAAGTAGACAGGAAGAAGACAGGAAGAAGACAGGAAGTAGACAGGAAGTAGACATGAGGAAGACAGGGAGTAGACAGG

Function

NR:

description
PREDICTED: leucine-rich repeat extensin-like protein 1 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2442188 False 2804 TUCP 0.65 3 40112584 40115566
TU2442190 True 3010 TUCP 0.62 5 40112584 40115950

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110509144 LOC106596660 coding upstream 155882 39911999 ~ 39956702 (+)
LOC110509147 NA coding upstream 252958 39829285 ~ 39859853 (+)
LOC118944812 LOC106596674 coding upstream 526820 39577120 ~ 39585764 (+)
LOC110508250 apcdd1 coding upstream 543665 39535516 ~ 39568919 (+)
LOC110508249 LOC106596749 coding upstream 617699 39492643 ~ 39494885 (+)
napgb LOC106596619 coding downstream 27113 40143063 ~ 40156247 (+)
LOC110508252 LOC105030507 coding downstream 307622 40423572 ~ 40431086 (+)
LOC110508257 LOC106596460 coding downstream 489574 40605524 ~ 40651737 (+)
cc2d1b LOC106591284 coding downstream 541527 40657477 ~ 40683270 (+)
txndc12 txndc12 coding downstream 641910 40757860 ~ 40782243 (+)
G2135677 NA non-coding upstream 142 40111403 ~ 40112442 (+)
G2135675 NA non-coding upstream 2756 40104182 ~ 40109828 (+)
G2135681 NA non-coding upstream 25132 40086147 ~ 40087452 (+)
G2135659 NA non-coding upstream 63723 40048616 ~ 40048861 (+)
G2135658 NA non-coding upstream 64942 40047406 ~ 40047642 (+)
G2135695 NA non-coding downstream 16008 40131958 ~ 40137262 (+)
G2135721 NA non-coding downstream 72679 40188629 ~ 40190220 (+)
G2135725 NA non-coding downstream 76399 40192349 ~ 40194441 (+)
G2136326 NA non-coding downstream 118299 40234249 ~ 40234688 (+)
G2135433 NA other upstream 684491 39426847 ~ 39428093 (+)
LOC118944840 LOC106596771 other upstream 1127049 38789495 ~ 39333323 (+)
G2135186 NA other upstream 1264267 38847480 ~ 38848317 (+)
LOC110508247 LOC106596897 other upstream 1585658 38292386 ~ 38526926 (+)
G2134434 NA other upstream 1968765 38123396 ~ 38143819 (+)
G2136555 NA other downstream 567360 40683310 ~ 40684329 (+)
G2136593 dnajb4 other downstream 689724 40785256 ~ 40867680 (+)
G2136801 NA other downstream 1091563 41207513 ~ 41208036 (+)
G2136831 LOC106569792 other downstream 1161913 41277863 ~ 41278442 (+)
G2137028 NA other downstream 1632674 41748624 ~ 41749007 (+)

Expression


Co-expression Network