G2136275


Basic Information

Item Value
gene id G2136275
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048592.1
NCBI id CM023246.2
chromosome length 43716683
location 40155195 ~ 40156240 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2443038
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>TU2443045
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>TU2443046
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>TU2443049
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2443038 False 854 lncRNA 0.42 2 40155195 40156240
TU2443039 False 806 lncRNA 0.42 2 40155195 40156240
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TU2443044 False 854 lncRNA 0.42 2 40155195 40156240
TU2443045 False 758 lncRNA 0.41 3 40155195 40156240
TU2443046 False 854 lncRNA 0.42 2 40155195 40156240
TU2443047 False 950 lncRNA 0.43 3 40155195 40156240
TU2443048 False 854 lncRNA 0.42 4 40155195 40156240
TU2443049 True 806 lncRNA 0.42 3 40155195 40156240

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110509140 LOC106596615 coding downstream 27994 40115401 ~ 40127201 (-)
LOC110508256 LOC106596607 coding downstream 52047 39973367 ~ 40103148 (-)
ndufv2 ndufv2 coding downstream 285259 39843311 ~ 39869936 (-)
LOC110509145 ankrd12 coding downstream 325988 39778552 ~ 39829207 (-)
LOC110509148 LOC106596679 coding downstream 391970 39719697 ~ 39763225 (-)
LOC110508253 LOC106591876 coding upstream 12171 40168411 ~ 40317511 (-)
LOC110508251 gnal coding upstream 296076 40452316 ~ 40587932 (-)
LOC118944871 NA coding upstream 441020 40597260 ~ 40599320 (-)
LOC118944865 NA coding upstream 448976 40605216 ~ 40608134 (-)
zfyve9a LOC106930947 coding upstream 528151 40684391 ~ 40740806 (-)
G2136274 NA non-coding downstream 264 40153605 ~ 40154931 (-)
G2136276 NA non-coding downstream 14463 40138267 ~ 40140732 (-)
G2136262 NA non-coding downstream 45394 40104646 ~ 40109801 (-)
G2136259 NA non-coding downstream 70981 40082993 ~ 40084214 (-)
G2136255 NA non-coding downstream 80487 40074372 ~ 40074708 (-)
G2136277 NA non-coding upstream 35754 40191994 ~ 40194404 (-)
G2136311 NA non-coding upstream 44687 40200927 ~ 40201199 (-)
G2136325 NA non-coding upstream 77521 40233761 ~ 40234070 (-)
G2136327 NA non-coding upstream 78152 40234392 ~ 40234810 (-)
G2136243 NA other downstream 33296 40051639 ~ 40121899 (-)
G2136189 NA other downstream 209361 39943153 ~ 39945834 (-)
G2135837 NA other downstream 1149145 39005461 ~ 39006050 (-)
G2137086 NA other upstream 259063 40415303 ~ 40415540 (-)
G2137111 NA other upstream 315848 40472088 ~ 40475701 (-)
G2137419 NA other upstream 1104560 41260800 ~ 41261271 (-)
LOC110509166 LOC106596257 other upstream 1474421 41630582 ~ 41641166 (-)
G2137555 NA other upstream 1575474 41731714 ~ 41736389 (-)

Expression


Co-expression Network