LOC118945304


Basic Information

Item Value
gene id LOC118945304
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048593.1
NCBI id CM023247.2
chromosome length 47748341
location 47071685 ~ 47075462 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005040424.1
CTACACCTCTAATCCGAACTAATAATCCTGATATTATTGATCTAACCCCGATTAGTCCATTACTAGCCTAAAGGTACTAACATCTAACTGTTAGTCACTGGGTACTATCCTGGCCGCTGGTCTGACCTGGTCACCTATTACAGTAGAAGGTCTTAATTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTATAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtaggtCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtagatGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGTCTATTCCAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtaggtCTTAATTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGTCTATTCCAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTTcagtctattacagtag
>XR_005040423.1
CTACACCTCTAATCCGAACTAATAATCCTGATATTATTGATCTAACCCCGATTAGTCCATTACTAGCCTAAAGGTACTAACATCTAACTGTTAGTCACTGGGTACTATCCTGGCCGCTGGTCTGACCTGGTCACCTATTACAGTAGAAGGTCTTAATTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTATAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtaggtCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtagatGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGTCTATTCCAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtaggtCTTAATTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGTCTATTCCAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCCATTACAGTAGAAGGTC
>XR_005040425.1
CTACACCTCTAATCCGAACTAATAATCCTGATATTATTGATCTAACCCCGATTAGTCCATTACTAGCCTAAAGGTACTAACATCTAACTGTTAGTCACTGGGTACTATCCTGGCCGCTGGTCTGACCTGGTCACCTATTACAGTAGAAGGTCTTAATTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTATAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtaggtCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtagatGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGTCTATTCCAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGTCTATTCCAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCCATTACAGTAGAAGGTC
>XR_005040426.1
CTACACCTCTAATCCGAACTAATAATCCTGATATTATTGATCTAACCCCGATTAGTCCATTACTAGCCTAAAGGTACTAACATCTAACTGTTAGTCACTGGGTACTATCCTGGCCGCTGGTCTGACCTGGTCACCTATTACAGTAGAAGGTCTTAATTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTATAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGgtCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtagatGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGTCTATTCCAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtaggtCTTAATTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCTATTACAGTAGACGGTCTTAGTTAGTGGTTACAGCCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAATGGTTAGTCTATTACAGTAGAAGGTCTTAGTTAGTggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggtacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTTAGTTAATGGTTACAGTCTATTCCAGTAGAAGGTCTTAGTTAATggttacagtctattacagtagaagGTCTGGTCTTAGTTAATGGTTACAGCCCATTACAGTAGAAGGTC

Function

NR:

description
PREDICTED: MAP7 domain-containing protein 1-like isoform X5

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005040424.1 False 1841 mRNA 0.36 4 47071685 47075462
XR_005040423.1 False 1852 mRNA 0.36 4 47071715 47075462
XR_005040425.1 False 1743 mRNA 0.36 4 47071715 47075462
XR_005040426.1 True 1819 mRNA 0.36 5 47071715 47075462

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118945689 NA coding downstream 718 47070903 ~ 47070967 (-)
rskrb LOC106563969 coding downstream 11250 47025620 ~ 47060435 (-)
LOC118945349 NA coding downstream 52998 47016181 ~ 47021968 (-)
aldocb aldoc coding downstream 56348 46984254 ~ 47015337 (-)
pigs LOC106592729 coding downstream 99359 46957945 ~ 46972326 (-)
ddias NA coding upstream 16311 47091773 ~ 47100242 (-)
birc2 LOC106563947 coding upstream 112087 47187549 ~ 47224194 (-)
bud13 bud13 coding upstream 249946 47325408 ~ 47331629 (-)
btg4 btg4 coding upstream 261700 47337162 ~ 47340652 (-)
fdxacb1 LOC106594937 coding upstream 320226 47395688 ~ 47409633 (-)
G2189488 NA non-coding downstream 1248 47070145 ~ 47070437 (-)
G2189474 NA non-coding downstream 32172 47039036 ~ 47039513 (-)
G2189469 NA non-coding downstream 36617 47031272 ~ 47035068 (-)
G2189462 NA non-coding downstream 60592 47010627 ~ 47011093 (-)
G2189490 NA non-coding upstream 4606 47080068 ~ 47080388 (-)
G2189492 NA non-coding upstream 7282 47082744 ~ 47083570 (-)
G2189760 NA non-coding upstream 36964 47112426 ~ 47114713 (-)
G2189777 NA non-coding upstream 63827 47139289 ~ 47139712 (-)
G2189779 NA non-coding upstream 64706 47140168 ~ 47142278 (-)
G2189204 NA other downstream 301724 46769683 ~ 46769961 (-)
G2189115 NA other downstream 435517 46634238 ~ 46636168 (-)
G2188868 chordc1 other downstream 913879 46143319 ~ 46157806 (-)
G2188877 NA other downstream 986901 46081386 ~ 46084784 (-)
G2188420 NA other downstream 1267498 45802955 ~ 45804187 (-)
G2189814 NA other upstream 167587 47243049 ~ 47270482 (-)
G2189794 NA other upstream 210522 47285984 ~ 47287003 (-)
G2189898 NA other upstream 344472 47419934 ~ 47428596 (-)
G2189978 NA other upstream 527689 47603151 ~ 47604511 (-)

Expression


Co-expression Network