G2170458 (LOC106563185)



Basic Information


Item Value
gene id G2170458
gene name LOC106563185
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048593.1
NCBI id CM023247.2
chromosome length 47748341
location 27322105 ~ 27324765 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU2480664
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>TU2480665
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>TU2480666
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>TU2480668
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>TU2480669
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Function


NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2480664 False 2623 lncRNA 0.44 2 27322105 27324765
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TU2480668 False 2635 lncRNA 0.44 2 27322105 27324765
TU2480669 True 2625 lncRNA 0.44 2 27322105 27324765

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
sftpba LOC106563192 coding upstream 65326 27238683 ~ 27256779 (+)
LOC110509897 LOC106563193 coding upstream 145171 27160500 ~ 27176934 (+)
LOC110509895 fam136a coding upstream 174401 27145344 ~ 27147704 (+)
LOC110509893 LOC106563198 coding upstream 189861 27113486 ~ 27132244 (+)
LOC110509891 drg1 coding upstream 249118 27056581 ~ 27072987 (+)
LOC100136172 LOC100136172 coding downstream 170489 27495254 ~ 27499399 (+)
LOC118945286 NA coding downstream 261459 27586224 ~ 27586975 (+)
prp14 prp14 coding downstream 316213 27640978 ~ 27643345 (+)
LOC110509916 LOC106563177 coding downstream 383818 27708583 ~ 27758941 (+)
LOC110509917 npm coding downstream 438770 27763535 ~ 27768291 (+)
G2170405 NA non-coding upstream 126099 27194656 ~ 27196006 (+)
G2170403 NA non-coding upstream 131723 27190067 ~ 27190382 (+)
G2170346 NA non-coding upstream 135205 27182090 ~ 27186900 (+)
G2170373 NA non-coding upstream 237328 27082144 ~ 27084777 (+)
G2170292 NA non-coding upstream 349536 26972308 ~ 26972569 (+)
G2170511 NA non-coding downstream 101619 27426384 ~ 27426620 (+)
G2170512 NA non-coding downstream 102273 27427038 ~ 27427561 (+)
G2170513 NA non-coding downstream 106093 27430858 ~ 27433701 (+)
G2170514 LOC106563181 non-coding downstream 110613 27435378 ~ 27435826 (+)
G2170527 NA non-coding downstream 121903 27446668 ~ 27478209 (+)
LOC110509877 LOC106563217 other upstream 789325 26504919 ~ 26532797 (+)
LOC110509876 LOC106563358 other upstream 857544 26463263 ~ 26464615 (+)
LOC110509866 LOC106563223 other upstream 2119464 24944825 ~ 25202836 (+)
LOC110509859 LOC106563234 other upstream 2789951 24500361 ~ 24532163 (+)
LOC110509837 LOC106563250 other upstream 3530441 23785060 ~ 23793640 (+)
gigyf1b LOC105024601 other downstream 978440 28277874 ~ 28313151 (+)
LOC110509373 LOC106563396 other downstream 1354083 28678848 ~ 28681351 (+)
G2173098 NA other downstream 2234805 29559570 ~ 29559959 (+)
G2173114 NA other downstream 2260829 29585594 ~ 29587472 (+)
LOC110509970 LOC106563483 other downstream 2327804 29652518 ~ 29662236 (+)

Expression



Co-expression Network