G2177991 (cfb)


Basic Information

Item Value
gene id G2177991
gene name cfb
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048593.1
NCBI id CM023247.2
chromosome length 47748341
location 34092047 ~ 34216247 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2489476
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>TU2489482
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>TU2489475
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>TU2489478
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>TU2489479
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Function

symbol description
cfb Predicted to enable serine-type endopeptidase activity. Acts upstream of or within response to bacterium. Predicted to be located in extracellular region. Is expressed in liver. Human ortholog(s) of this gene implicated in several diseases, including atypical hemolytic-uremic syndrome; autoimmune disease (multiple); eye disease (multiple); glomerulonephritis (multiple); and sickle cell anemia. Orthologous to human CFB (complement factor B).

NR:

description
complement factor B isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU2489482 False 3354 lncRNA 0.37 8 34129059 34216247
TU2489475 False 3573 lncRNA 0.41 2 34143714 34147319
TU2489478 False 6886 lncRNA 0.38 8 34143714 34216247
TU2489479 True 6583 lncRNA 0.37 6 34143714 34216247

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
pygma LOC106563660 coding downstream 440920 33638137 ~ 33651127 (-)
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G2177695 NA other downstream 579721 33511296 ~ 33512326 (-)
G2176363 NA other downstream 1447475 32643402 ~ 32644572 (-)
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LOC110510065 LOC106603070 other downstream 1806564 32282188 ~ 32287263 (-)
G2175969 LOC100194703 other downstream 1825958 32263283 ~ 32266089 (-)
G2178372 NA other upstream 586944 34792330 ~ 34809382 (-)
G2179862 NA other upstream 1745737 35961984 ~ 35962832 (-)
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G2178058 NA non-coding upstream 47147 34194466 ~ 34195193 (-)

Expression


Co-expression Network