G2177537


Basic Information

Item Value
gene id G2177537
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048593.1
NCBI id CM023247.2
chromosome length 47748341
location 34655443 ~ 34657869 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2488980
CTGTCCTCTCTTTACTGTCCTCTCTACACTGTCCTCTCTTTACTGTCCTCTCTACACTGTCCTCTCTTTACTGTCCTCTCCCCACTGTCCTCTCTACACTGTCCTCTCTTTACTGTCCTCTCTTTACTGTCCTCTCTACACTGTCCTCTCTTTACTGTCCTCTCTACACTGTCCTCTCTTTTACTGTCCTCTCTACACTGTCCTCTCTACACTGTCCTCTCTTTACTGTCTACTTCTTGCTGTCTTCTCTTTACTGTCTACTTCTTGCTGTCTTCTCTCCTCACTGTCCTCTcctcactgtcctctcctctcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctcctctcctcaccgtcctctctccactcctaactgtcctctctcctcactgtccactctcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgTCATCTctccactccacactgtcctctctccactccacattgtcctctctccactccccaccgtcctctctcctctcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctctcctctctccactcctctcctctcctctctccactcctctcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctcctctcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctcctacctgtccactctccactcctcactgtctcttctcctctctccactcctcacactcctctctccactcctcactctcctctctccactcctcactgtcctctctcctcactgtcctctctccactccccaccgtcctctctccactcctcatcgtcctctctcctcactatcctctcttcactccccactgtcctctctcctcactgtcctctctcctctcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctcttcactccccactgtcctctctcctcactgtcctctctcctctcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcaccgtcctctctcctctcctctctccactcctcactgtcctctctcctcactgtccactctccactcctcactgtcctctctccactcctcaccgtcctctctcctctcctctctccactcctcactgtcctctctcctcactgtcctctctcctcactgtcctctctcctacctgtccactctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgtctcctctcctctctccactcctcactctcctctatctccattcctcactctcctctctccactcctcactgtcctctctcctcactgtcctctctccactccccaccgtcctctctccactcctcatcatcctctctcctctcctctctccactcctcactgtcctctcttcactccccactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactgtcctctctccactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgtctcctctctcctctcctcactgtcctctctcctctcctcactgtcctctctcctctcctcactgtcctctctcctctcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctcctctcctcactgtcctctctcctctcctcactgtcctctctcctctcctcactgtcctctctcctctcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgTCCACTCCTCACTGTCCACTCCTCACTGTCCTctcctcactgtcctctctcttcactgtcctctctcttcactgtcctctctcttcactgtcctctctccactcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctcactgtcctctctccactcctctctccactcctcactgTCCTCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2488980 True 2116 lncRNA 0.56 4 34655443 34657869

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118945290 NA coding upstream 17435 34635244 ~ 34638008 (+)
slc7a3a LOC106563685 coding upstream 44153 34598826 ~ 34611290 (+)
LOC110510150 LOC106563687 coding upstream 59390 34591821 ~ 34596053 (+)
LOC100136033 LOC100136033 coding upstream 68847 34581752 ~ 34586596 (+)
cd248b LOC106563689 coding upstream 110683 34541820 ~ 34544760 (+)
LOC110510155 LOC106563682 coding downstream 45456 34703325 ~ 34715546 (+)
LOC110510157 LOC106563680 coding downstream 91001 34748870 ~ 34761158 (+)
LOC110510158 LOC106563717 coding downstream 105813 34763682 ~ 34782858 (+)
LOC110510159 LOC106563679 coding downstream 126450 34784319 ~ 34825545 (+)
si:ch73-362m14.2 LOC106563676 coding downstream 157837 34815706 ~ 34822942 (+)
G2177518 NA non-coding upstream 41145 34612829 ~ 34614298 (+)
G2177476 NA non-coding upstream 74391 34580644 ~ 34581052 (+)
G2177470 LOC106563688 non-coding upstream 90313 34552309 ~ 34565130 (+)
G2177471 NA non-coding upstream 108857 34546072 ~ 34546586 (+)
G2177515 NA non-coding upstream 115686 34539270 ~ 34539757 (+)
G2177532 NA non-coding downstream 4404 34662273 ~ 34662564 (+)
G2177548 NA non-coding downstream 17932 34675801 ~ 34676298 (+)
G2177606 NA non-coding downstream 104928 34762797 ~ 34763001 (+)
G2177614 NA non-coding downstream 111932 34769801 ~ 34770015 (+)
G2177616 NA non-coding downstream 114961 34772830 ~ 34773119 (+)
G2177424 NA other upstream 194674 34359624 ~ 34460769 (+)
LOC110510132 rin1 other upstream 423260 34227307 ~ 34236487 (+)
LOC110510125 LOC106563697 other upstream 520044 34105921 ~ 34135553 (+)
cxxc5a LOC106563628 other upstream 1419908 33212994 ~ 33235535 (+)
LOC110509425 LOC106563572 other upstream 2529365 32115629 ~ 32150579 (+)
ndufa2 ndua2 other downstream 847979 35505848 ~ 35507048 (+)
G2179418 NA other downstream 1193785 35851654 ~ 35856462 (+)
G2179454 LOC106602907 other downstream 1254621 35912490 ~ 35925031 (+)
G2180218 LOC106563757 other downstream 2020702 36678571 ~ 36680297 (+)

Expression


Co-expression Network