cdkn1bb (LOC106584490)


Basic Information

Item Value
gene id cdkn1bb
gene name LOC106584490
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050570.1
NCBI id CM025857.1
chromosome length 46327593
location 14862163 ~ 14868180 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021598926.2
AGCTCGGACCATATCACTTATATGCACTGTTTGTGTACTGGAGGTAGGACAGCAAGCTGGGAGACTTAGGTGAAGAGAGCTGGATATTGGAAATAGACCTgcattgtttcaatatatcccTGCTGATATCTAGGAGAGGATTTAGTGCACTATATGTGTGTGGATTCAATGATGCtgtaatatataacatatatttgGTGAAAGGCTTTTGTCTTGTTAGTTGTATGTTACGTACTGTGTATGTAAACGGTTTTATTTTTGTGATCGTTAGATATTAGATAACCGATTTGCCTAATACCTAATTTCACAACAAGGGGTCAGTGCAGTCTTCCCTTTAAATCAGAACTGAGTAAAAGCTCCTTCAGACACCCTGTACCAAAGCTTGATTCATAAGACCCTAGTTACATCCAGGAATTAAATTTAAATTGCAAAATATCTTACAGCTAAAATAGATGAATATTTTGACATTTTAAAACGGGCAAAAGCAATAGGTAATTAAAAACATGTGGACAAGATGTGTAGTGTTgtcacatttataaaaaatgatTCACTCTTACTGTAGTCGTTCTATTGCAAATGGCCAATGAGTTATAATTTAAGTAGTTATTAATTGATGTTTGATAATAAATTGTAAATTGTCTAATTGCGTTATCCTGCAGAAAATATTGTTTTCCCAGTGAGAAATGCTTGCCACTACTCTTAATACCATCCCTCCTTTTGCTGGGGTGTACACTGGTGACCTTGACTGAGCTCAGATAAGTCAATATTCACATCTGTATCATAGAGAGAAAAAACTGGTCACCTCCATGCAAAATAATGAAAATGTTAAGATTTTATTAGCCTTTTAAATGGTTGACAGATTCATGACAATGATAACCTACTCCAACGACAAAATGCTTCACACTGGCTTGTGTATTTTCAAATGTTTCAAATCATTAAGGTGGTATTACAATTCCACTTTTATTGAAAAACGACTataattttcaaataaaattagatttccCTCTCTATATTTATTGTTCTATTTTGGTGCAAAAAAACTATGACATGAAGATCGAGACCACTGATATTAAAATATTTTCTCAACATAAACAAATGAATAATGCATACACTAAGTTTCCTTATAATGGccctttattttatttacatCCATAGCTAAAATGGTAGATACCTATAGTGATTATGGCTATAGCCGTTACAAAGTAACATGTATAGAAATGTGACAATGTTGCAAAGCCTTTGTAACGTGCATGATATGATCGCCTTAAGAGAATTGGGCGGGCTTACGTTTTTTTAACCAATGAATTCCCTTCTTCGTTTTAAATAGTTCTCTGTGTCAATCAGTTTTTTCCCCAGTCAGCCTCCCCTCAATCGCCATATTGGGTACTGAAAAGGTTTGTCTGTTATTTCTTCTCTCTTACTACGAGAATAAATtgacaggagtggcttcagttaCTGCACATTGTTTTGATGATCTGACTACTTTAGCTCGCATTGCCATATTGGAAATTACCGTTTCTATCCAGACCTATGCATGGCATAAAAGTGTTGATCATTCGTTTTACGCTTGTTTTGGATCGCGGTGAGAAAGGAGGAAATACGAATTTTTAAGTGTTCTATTTGGACGTTAATTGATTCTCCGAAAATGTCAGATGTTCGACTTTCAAATGGGAGCCCGACGTTGGAAAGGACGGATGCTCGGTTGGCGGATCACCCCAAACCGTCAGCCTGCAGAATAATTTTCGGCTCGCCGGATCGCGAAGAGTTAAGGCGGGATTTAAAGGGACATTTGCAAGAGATGGAAGCGGCGGCCTCAGCGAAGTGGAACTTCGATTTTTCAAGCCACACACCTCTATCGAACGGGAGATTCAAATGGGAATTAATGGATTGTAAAGACATTCCAAATTTCTACACCAGAACGCAACGATCAGTGAAAGACGTTTGCCCCTCTGGGAATAACACTATGGATCTAAATGGGAATCATAGTTGTGTGATGGTGACTCCACGGCAGCCCTCCGACAACACGGAGAGGTCAGAGAGCCAAATGGAGAGTAAAGAGCAGTGCACCGGGCGGAGAAAAAGACCAGCCTGCCATGAATACCCCTCGTCCCAAAATAAAAGGTCACACAGTAGTTCGAATGAAGTTACTCCTTGCCCAGGCTTAGAATACACACCCAGGAAAGCCAGTCCCAGGACTCAAACGTGAAGATGACAAAGAGCTGAAAATGTATTTCCCCTTTTTGTCATGGAAACCTAAGTGTTCGGTGATTTTGAAGAGGAACTACAAAGAAAAGGAAACATATCAATTCTCCCTAAGGATGGGGACGCTGTGCAAGCACTGAATATAAACACTAAAGTTCTGGCACTCATAAAGTTACTGCCTCTAAAAGCAGTCGATGTAGCAGTGTGCAATTAGGTTTTATTTCCTTTTttgctcttttttttcttttctttttttaactacctgtgtatatatttattttcatatGTAGCACATAAAACATATTATGATTGGGGAGGGGAAAAAAACGATGTAAAAGGCATGAATTTGACTTGAAGAATTGCGGTGTAGTTTTGTTTCCTAAATGCTGTTTATAAATCCTGATCCATTTAAAAAATGATTGGATTAAATAATTGTTCCTCATCGAAGTATCCTCATAGGTCATCTGTATGTAGGGAGAGATTGATGGTACATAATGTGTAGCCTTGTATTTTGGGTCATTTAAGTGTCACACAACGTGGGTTCTCAGCCACCCCACGAAAACAATGCCTCAAATAATGATACATTTCTGTTATGACTAAAAAAGTAATATGTGAAGTCAGCcaatatttattgtattttgttgAAGATCTGTAGTCCTATGTCGGTCACTTAAATTCtggaatcttttttttttttaaatttttttacaaGTCTTCCTCTTCACCATTTAAAAAACAAAGTGTAGCTAATTTATTTTTCTGAAGTGGTATAGGGTACTAATTTGCTGAAGGATAAAATATCTGTTAACTGTACTGGTAGTATTAATCAACTTCATACTCGTGTTTAACGGttcttaatatttttttaaacaattaggCCTTTTTATGTTTGAAATGTCCTACAATACCAAATACATGGTTGCTTCAATACGTCTGTCGACGCTTTCACCATCAGGTTGCCTTGGCATTGTACTCCTGTTTGATACAGAAAGATAATTTAATTTGTTAATCTCCCCCTTCTCCCAGACATTGTTAGTGCAGATCATGCAAATGTAGTTTCTAAAATAACTTTAATTTCGCCCAGTTTCAATCAGCCTTTGTTCAGAGGCTAAGAATTGTCTCAAAGTAGTCACTGCCCGTGTAAATCTATTAAGTGTACATAACTTTGTAAAAACACTGAGAAATTATACTAACTTATTTATGTCAAGCTTTTTTATGTAGAATAAAATGGGGTTTTGATCAAGGTTATCCAAAGTGGcatttacatatatttttttgtaagcaTATTTTTGGTAGTTTTTATTTTATCGAAAAAGGTTGCAACCTGAGCCTGATTTAAAatattttatgtgcatttttCAATGTGTGATTAAGATGTCTTGCAATCAATTAAAACAGAAGATAAATCGTTATGTGATTTGTTGGTCATGTTTGCACTGTTGAAAGGAACCTCTTCAGCCTGCACACggtcacactctttctctcagCAAGTATACAGCATAACGATTTTAATGTATTTCGATTCAGCTAATACATAATCCATATCCGTGGCCTTCATAACTTGATGTTTCATACTATAAATTGCACAGAACCTGCATGTGCTCTCATGGGGCGGGAGGAATCGTATATGAGGTATGTTCCTATATAGCCCACTGGTGAATCACAAGTAAAAATGCCTCTCAGGACTCCAGGCAAAACGGCCTTAAATTTCAGTTTAATAGATTGATGAGATTGTCATACCTCGGTTCTCTTCATACCCACTGCTTTTAGGTTGGGAGTTTATACATTATCATCCTGGAATAAAAGCATGAAGAGATTTAACTTTAAAAACAGTTATTGTAGTTCTAGTGCTTTTCACAGCAGTTAGGAGTAGATACAGTATTTCAGTAATTGATGTCATTTTTTTTATATCAATGTGGTGTATCCTCTTCGGCTCGCGGACAAACTGGAACTAACCCGTGCGCATTCGGTACCATTTGGCACATTACGCATGTTTCAAGCTTGAAGTAGCACGTAATAGGGTCCGGTAAATACAAACGATGTTATTGCTTCTATGGTTGCAAAATCAGTCCATTTTAAAATAGTTTAGCCTGTGTTAATCCACTATAGCACTGTTGACCAAATATGCCGCCGTCTACGCAGTGGCACTCCCAATATGATGAAATCGTGAAGTATTTTGAAAAATGCCTGGTGATTGACGTTTGGCTCCTCCAATCCGGTTATGTCTAAGTAAAGCACACCACTGTTGCAGCCAGTTACATTTGTCTTATGGAAGGTTTGAACTGCAATTGTTTCTAGCGGTGAAAAAAAACTCCCCACAGGTCCACAGTTGAAATTATATAAGGTTAGTCACTGCATGAATGTTGTTATATTTGGTCACAGAGAATGCGCTAGTGTAGCCTACATCCAACAAATACTGTAATTGCATGCATATAGATGATTTAACTGTAGTTTGAATTAATTATAGAAAAAAGGATGTAGAAATATATCCCTGATACTGTAATGAGCATTTTTAATAAAACAACTCTAT

Function

NR:

description
cyclin-dependent kinase inhibitor 1B-like

GO:

id name namespace
GO:0006469 negative regulation of protein kinase activity biological_process

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021598926.2 True 4732 mRNA 0.37 3 14862163 14868180

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110521396 yars2 coding upstream 5 14855349 ~ 14862158 (+)
LOC110521393 LOC106584489 coding upstream 14979 14780910 ~ 14848042 (+)
LOC118945780 NA coding upstream 89442 14761128 ~ 14772721 (+)
LOC110521391 LOC106584496 coding upstream 434644 14383407 ~ 14427519 (+)
LOC110521390 LOC106584497 coding upstream 480729 14370026 ~ 14381434 (+)
LOC110521404 LOC106560988 coding downstream 298097 15166277 ~ 15181233 (+)
LOC118945892 NA coding downstream 316984 15185164 ~ 15185354 (+)
LOC110521401 LOC106584463 coding downstream 337601 15205781 ~ 15215520 (+)
LOC110521400 LOC106584464 coding downstream 358744 15226924 ~ 15236089 (+)
LOC110521405 NA coding downstream 400546 15268726 ~ 15271364 (+)
G2203759 NA non-coding upstream 4823 14857135 ~ 14857340 (+)
G2203695 NA non-coding upstream 11351 14848301 ~ 14850812 (+)
G2203758 NA non-coding upstream 17618 14844337 ~ 14844545 (+)
G2203713 NA non-coding upstream 17880 14843665 ~ 14844283 (+)
G2203762 NA non-coding downstream 1888 14870068 ~ 14870286 (+)
G2203770 NA non-coding downstream 12066 14880246 ~ 14880464 (+)
G2203925 NA non-coding downstream 298473 15166653 ~ 15211610 (+)
G2203977 NA non-coding downstream 409074 15277254 ~ 15278241 (+)
G2203653 NA other upstream 295060 14559447 ~ 14567103 (+)
tnnt3a LOC100136357 other upstream 1399976 13435735 ~ 13462187 (+)
LOC110521355 LOC106584515 other upstream 1567003 13292190 ~ 13301806 (+)
G2202196 NA other upstream 1660672 13201138 ~ 13201491 (+)
LOC110521323 LOC106561036 other upstream 3065228 11683849 ~ 11796935 (+)
G2203973 NA other downstream 403865 15272045 ~ 15273733 (+)
G2205546 NA other downstream 1361991 16230171 ~ 16232396 (+)
G2206179 NA other downstream 2295457 17163637 ~ 17164159 (+)
G2206268 LOC106584433 other downstream 2307237 17175417 ~ 17175872 (+)
G2206271 NA other downstream 2311221 17179401 ~ 17179695 (+)

Expression


Co-expression Network