LOC110521871 (LOC106583949)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110521871
gene name LOC106583949
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_050570.1
NCBI id CM025857.1
chromosome length 46327593
location 43838520 ~ 43845724 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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>XM_036968952.1
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>XM_021599802.2
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Function


NR:

description
apoptosis regulator BAX-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021599802.2 True 3651 mRNA 0.38 6 43838526 43845724

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110521008 LOC100136747 coding upstream 229829 43596311 ~ 43608691 (+)
LOC110521861 LOC100136747 coding upstream 247252 43581526 ~ 43591268 (+)
LOC110515334 LOC100136747 coding upstream 262073 43566590 ~ 43576447 (+)
LOC110519394 LOC100136747 coding upstream 276995 43551650 ~ 43561525 (+)
LOC118945797 NA coding downstream 59782 43905506 ~ 43910872 (+)
LOC110521011 LOC106583946 coding downstream 216329 44062053 ~ 44100935 (+)
LOC110521874 LOC106583945 coding downstream 268043 44113767 ~ 44124283 (+)
LOC110521876 LOC106583944 coding downstream 278683 44124407 ~ 44145448 (+)
LOC110521877 LOC106583943 coding downstream 300321 44146045 ~ 44162689 (+)
G2238748 NA non-coding upstream 94779 43715267 ~ 43743741 (+)
G2238687 NA non-coding upstream 245843 43577301 ~ 43592677 (+)
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G2238664 NA non-coding upstream 341810 43496463 ~ 43496710 (+)
G2238147 NA non-coding upstream 475670 43306410 ~ 43362850 (+)
G2239203 NA non-coding downstream 159191 44004915 ~ 44005214 (+)
G2239209 NA non-coding downstream 166048 44011772 ~ 44012006 (+)
G2239235 NA non-coding downstream 181653 44027377 ~ 44027711 (+)
G2239247 NA non-coding downstream 187113 44032837 ~ 44033097 (+)
G2239274 NA non-coding downstream 209538 44055262 ~ 44055700 (+)
G2238671 LOC100136747 other upstream 215217 43608581 ~ 43623303 (+)
G2238623 adgrl4 other upstream 372691 43440853 ~ 43465829 (+)
G2237341 NA other upstream 1108069 42729852 ~ 42730451 (+)
LOC110521840 LOC106583968 other upstream 1285334 42548328 ~ 42554269 (+)
G2236045 NA other upstream 2452527 41385660 ~ 41385993 (+)
G2239435 LOC106583900 other downstream 554161 44399885 ~ 44427686 (+)
LOC110521895 LOC103040367 other downstream 710470 44555495 ~ 44563618 (+)
G2239510 NA other downstream 729132 44574856 ~ 44575278 (+)
G2239933 NA other downstream 1007977 44853478 ~ 44860893 (+)
G2240165 NA other downstream 1119046 44964770 ~ 44965537 (+)

Expression



Co-expression Network