G2192186


Basic Information

Item Value
gene id G2192186
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050570.1
NCBI id CM025857.1
chromosome length 46327593
location 3325286 ~ 3332308 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2507522
GCCATGCCGTGCCCTTGTGGGTCTGATGAATTGTTGCTCAATGTGACTGTTGAATACCTGACGGCAGCATCGTACGCCTGATGGGGTCATCCTGATGGGGTCATCCTGATGGGGTCATCCTGAACCATACTGTGCTGGCTCTGATTTTTATATTTTCACATTGCCCGTTTAGCAACTATGCTGGATGTGGAACCAGGAGAACACAGTAGAGCTTGGCTCAGATTGACCCCGTGGAATGGACCATGGTGAGGTTGGTTTCTATTCCTGAAGTCACCGCTTCTATTATGCCATCCTAAAGTATTAGTCCCCTCTCTTcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaatttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctttccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctttccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtccctTCTCTTcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcctcccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccgtctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtccctcTCTTCACttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtctcctctcttcccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtataagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgcaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctcccttcctttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagacccctctcttcccttcctgtgtaagttctacTAGTCCCCTCTCTTatcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttccctttctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaatttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaatttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctttccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaatttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctttccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtccctTCTCTTcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcctcccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccgtctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtccctcTCTTCACttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtctcctcccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctcttTCCCCTTCCTGTGTTCACGGTTAgtatttctttcctttttattgTTGGTGGAGTCATTGTATATGATATTGCTTTAGTAATTCTATGATTCATGCTATTTAAAAGACACTTGCTGCTTGATATGCATCAGTGTTCTGTGTTTCTTTCTTCTGTCTGTTTTGACTATTGAACGATGTCAATATCACCACAGAGGCTTTCTGACTGTCCCTTTGGGTCTTGCTCTACTTGGCTCTCAAACTGCAGGTggccttctccctacagttttCAGTGCTCAGCGCTGCCCGACGAATGGCTCACGTGCACTACACAACACTGTGGTTTTAATGTTTAGAAACGTCGGTCATTGTTTGCGATACTG
>TU2507524
GCCATGCCGTGCCCTTGTGGGTCTGATGAATTGTTGCTCAATGTGACTGTTGAATACCTGACGGCAGCATCGTACGCCTGATGGGGTCATCCTGATGGGGTCATCCTGATGGGGTCATCCTGAACCATACTGTGCTGGCTCTGATTTTTATATTTTCACATTGCCCGTTTAGCAACTATGCTGGATGTGGAACCAGGAGAACACAGTAGAGCTTGGCTCAGATTGACCCCGTGGAATGGACCATGGTGAGGTTGGTTTCTATTCCTGAAGTCACCGCTTCTATTATGCCATCCTAAAGTATTAGTCCCCTCTCTTcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaatttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctttccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctttccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtccctTCTCTTcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcctcccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccgtctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtccctcTCTTCACttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtctcctctcttcccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtataagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgcaagttctggTAGTCCCCTCTCTTatcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttccctttctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaatttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaatttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctttccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaatttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctttccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtccctTCTCTTcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtataagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgcaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctcccttcctttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaatttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctttccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcctcccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccgtctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcctcccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccgtctcttctcttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtccctcTCTTCACttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttctcttcacttcctgtgtaagttctggtagtctcctctcttcccttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctcttcccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctctctccccttcctgtgtaagttctggtagtcccctcttTCCCCTTCCTGTGTTCACGGTTAgtatttctttcctttttattgTTGGTGGAGTCATTGTATATGATATTGCTTTAGTAATTCTATGATTCATGCTATTTAAAAGACACTTGCTGCTTGATATGCATCAGTGTTCTGTGTTTCTTTCTTCTGTCTGTTTTGACTATTGAACGATGTCAATATCACCACAGAGGCTTTCTGACTGTCCCTTTGGGTCTTGCTCTACTTGGCTCTCAAACTGCAGGTggccttctccctacagttttCAGTGCTCAGCGCTGCCCGACGAATGGCTCACGTGCACTACACAACACTGTGGTTTTAATGTTTAGAAACGTCGGTCATTGTTTGCGATACTG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2507522 False 4004 lncRNA 0.49 2 3325286 3332308
TU2507524 True 5084 lncRNA 0.50 3 3325286 3332308

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110521158 LOC106584817 coding upstream 252 3276441 ~ 3325034 (+)
LOC118945764 NA coding upstream 54035 3270517 ~ 3271251 (+)
LOC110522690 skor1 coding upstream 54778 3256395 ~ 3270508 (+)
iqch LOC106584827 coding upstream 272678 2941093 ~ 3052608 (+)
smad3b LOC107755098 coding upstream 409312 2892934 ~ 2915974 (+)
tle3a LOC104946490 coding downstream 133988 3466296 ~ 3565245 (+)
ddb2 ddb2 coding downstream 356300 3688608 ~ 3726600 (+)
LOC110521165 fintrim coding downstream 452190 3784498 ~ 3796399 (+)
LOC118945791 LOC106584811 coding downstream 481067 3813375 ~ 3818776 (+)
LOC110521164 LOC106584811 coding downstream 495326 3827634 ~ 3831299 (+)
G2192205 NA non-coding upstream 8365 3316582 ~ 3316921 (+)
G2192203 NA non-coding upstream 16696 3308246 ~ 3308590 (+)
G2192166 NA non-coding upstream 76446 3241085 ~ 3248840 (+)
G2192161 NA non-coding upstream 117179 3203118 ~ 3208107 (+)
G2192245 NA non-coding downstream 132615 3464923 ~ 3465776 (+)
G2192258 NA non-coding downstream 137239 3469547 ~ 3470226 (+)
G2192259 NA non-coding downstream 138642 3470950 ~ 3471954 (+)
G2192292 NA non-coding downstream 199350 3531658 ~ 3532127 (+)
G2192294 NA non-coding downstream 202851 3535159 ~ 3535974 (+)
G2192059 NA other upstream 400821 2922901 ~ 2924465 (+)
G2191994 NA other upstream 562314 2760260 ~ 2762972 (+)
G2191616 NA other upstream 1077784 2247064 ~ 2247502 (+)
G2192425 LOC106584810 other downstream 577796 3910104 ~ 3910366 (+)
LOC110521161 LOC106584807 other downstream 602719 3931206 ~ 3937155 (+)
LOC118945757 LOC106584793 other downstream 1234443 4566366 ~ 4698448 (+)
G2193497 NA other downstream 1445392 4777700 ~ 4779264 (+)

Expression


Co-expression Network