G2236956


Basic Information

Item Value
gene id G2236956
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050570.1
NCBI id CM025857.1
chromosome length 46327593
location 42093309 ~ 42101005 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2557348
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>TU2557349
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2557348 False 7068 lncRNA 0.41 6 42093309 42101005
TU2557349 True 7068 lncRNA 0.41 6 42093309 42101005

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110521005 LOC106560551 coding upstream 39640 42012575 ~ 42053669 (+)
LOC110520957 LOC106583970 coding upstream 614888 41477485 ~ 41478421 (+)
LOC110521832 LOC106583970 coding upstream 625789 41458881 ~ 41467520 (+)
LOC110521828 LOC106584006 coding upstream 935308 41101017 ~ 41158001 (+)
pik3r3b LOC106584012 coding upstream 1624730 40143590 ~ 40468579 (+)
LOC110521838 LOC106583933 coding downstream 225254 42326259 ~ 42506540 (+)
LOC110521840 LOC106583968 coding downstream 447323 42548328 ~ 42554269 (+)
LOC110521842 LOC105011996 coding downstream 555151 42656156 ~ 42664378 (+)
LOC110521843 pde6d coding downstream 584808 42685813 ~ 42692514 (+)
LOC110521844 phb2 coding downstream 592860 42693865 ~ 42705266 (+)
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G2236851 NA non-coding upstream 111674 41979899 ~ 41981635 (+)
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G2236793 NA non-coding upstream 155153 41937936 ~ 41938156 (+)
G2237062 NA non-coding downstream 137274 42238279 ~ 42238581 (+)
G2237063 NA non-coding downstream 137651 42238656 ~ 42238866 (+)
G2237064 NA non-coding downstream 137963 42238968 ~ 42239260 (+)
G2237067 NA non-coding downstream 140751 42241756 ~ 42242013 (+)
G2237073 NA non-coding downstream 147380 42248385 ~ 42248590 (+)
G2236045 NA other upstream 707316 41385660 ~ 41385993 (+)
LOC110521817 LOC106584021 other upstream 2285259 39800038 ~ 39812756 (+)
LOC110521001 LOC106584026 other upstream 2916616 39117484 ~ 39202411 (+)
G2237341 NA other downstream 628847 42729852 ~ 42730451 (+)
G2238623 adgrl4 other downstream 1339848 43440853 ~ 43465829 (+)
G2238671 LOC100136747 other downstream 1507576 43608581 ~ 43623303 (+)
G2239435 LOC106583900 other downstream 2298880 44399885 ~ 44427686 (+)

Expression


Co-expression Network