LOC110504358 (LOC106604155)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110504358
gene name LOC106604155
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050571.1
NCBI id CM025858.1
chromosome length 44108611
location 5488729 ~ 5526792 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036969869.1
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>TU2568454
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Function

GO:

id name namespace
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036969869.1 False 7370 mRNA 0.42 8 5488729 5526785
XM_036969870.1 False 6927 mRNA 0.42 8 5488729 5526792
TU2568453 False 3088 lncRNA 0.41 1 5489087 5492174
TU2568454 True 1996 lncRNA 0.38 1 5489087 5491082

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118945992 NA coding downstream 700409 4787439 ~ 4788320 (-)
LOC110504469 LOC106612313 coding downstream 894424 4589433 ~ 4594305 (-)
LOC110513918 syub coding downstream 1198238 4236169 ~ 4290491 (-)
LOC110504518 LOC106612310 coding downstream 1288786 4130654 ~ 4199943 (-)
higd2a LOC106612309 coding downstream 1388013 4098767 ~ 4100716 (-)
LOC110504491 LOC106604157 coding upstream 6067 5532859 ~ 5604780 (-)
LOC110504359 LOC106612272 coding upstream 180626 5707418 ~ 5731006 (-)
LOC118946011 NA coding upstream 212502 5739294 ~ 5740052 (-)
LOC110504499 LOC106604166 coding upstream 589322 6116114 ~ 6422429 (-)
LOC110504506 LOC106612265 coding upstream 1601077 7127869 ~ 7201500 (-)
G2245962 NA non-coding downstream 6587 5481918 ~ 5482142 (-)
G2245831 NA non-coding downstream 121361 5366988 ~ 5367368 (-)
G2245797 NA non-coding downstream 149386 5339116 ~ 5339343 (-)
G2245794 NA non-coding downstream 161378 5327137 ~ 5327351 (-)
G2245783 NA non-coding downstream 170493 5317980 ~ 5318236 (-)
G2246033 NA non-coding upstream 4108 5530900 ~ 5532619 (-)
G2246053 NA non-coding upstream 13545 5540337 ~ 5540754 (-)
G2246054 NA non-coding upstream 13991 5540783 ~ 5541526 (-)
G2246056 NA non-coding upstream 23925 5550717 ~ 5551917 (-)
G2246058 NA non-coding upstream 26889 5553681 ~ 5553897 (-)
G2245152 ctnna1 other downstream 866739 4535841 ~ 4621990 (-)
G2244811 NA other downstream 1375728 4111702 ~ 4113001 (-)
G2243801 NA other downstream 2551187 2936604 ~ 2937542 (-)
G2243777 NA other downstream 2601270 2885291 ~ 2887459 (-)
G2246314 NA other upstream 321327 5848119 ~ 5852599 (-)
G2247416 NA other upstream 1343795 6870587 ~ 6871100 (-)
G2247565 NA other upstream 1411831 6938623 ~ 7024539 (-)
G2247813 NA other upstream 1728552 7255344 ~ 7255940 (-)
G2248522 NA other upstream 2514084 8040876 ~ 8041480 (-)
G2246038 NA non-coding upstream 11241 5503415 ~ 5503748 (-)

Expression


Co-expression Network