G2288283


Basic Information

Item Value
gene id G2288283
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050572.1
NCBI id CM025859.1
chromosome length 41837469
location 1788267 ~ 1829444 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

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RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2616711 False 1233 lncRNA 0.40 6 1788267 1829444
TU2616716 False 1083 lncRNA 0.41 4 1788267 1829444
TU2616717 False 1333 lncRNA 0.41 5 1788267 1829444
TU2616720 False 1283 lncRNA 0.41 4 1788267 1829444
TU2616712 False 978 lncRNA 0.39 5 1789988 1829444
TU2616714 False 1128 lncRNA 0.39 6 1789988 1829444
TU2616715 False 1128 lncRNA 0.39 5 1789988 1829444
TU2616718 False 1228 lncRNA 0.39 5 1789988 1829444
TU2616719 False 917 lncRNA 0.39 3 1789988 1829444
TU2616721 False 1328 lncRNA 0.39 5 1789988 1829444
TU2616722 False 1017 lncRNA 0.39 4 1789988 1829444
TU2616713 False 1886 lncRNA 0.41 3 1826650 1829444
TU2616724 False 2047 lncRNA 0.41 4 1826715 1829444
TU2616725 True 2530 lncRNA 0.40 2 1826715 1829444

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110511936 spire1 coding upstream 148694 1600350 ~ 1639573 (+)
ncaldb LOC105006551 coding upstream 426969 1280933 ~ 1361298 (+)
LOC110487806 LOC106570773 coding upstream 826151 936322 ~ 962116 (+)
rims2b LOC106570772 coding upstream 888330 738621 ~ 899937 (+)
rnmt rnmt coding upstream 1171840 596762 ~ 616427 (+)
lratd2a LOC106589121 coding downstream 20016 1849460 ~ 1851250 (+)
LOC118946536 NA coding downstream 63146 1892590 ~ 1893952 (+)
triqk triqk coding downstream 379575 2209019 ~ 2255119 (+)
cbfa2t2 runx1t1 coding downstream 695615 2525059 ~ 2686032 (+)
pip4p2 LOC106570754 coding downstream 937241 2766685 ~ 2800192 (+)
G2288293 NA non-coding upstream 4762 1782743 ~ 1783505 (+)
G2288311 NA non-coding upstream 42608 1745303 ~ 1745659 (+)
G2288305 NA non-coding upstream 55600 1731372 ~ 1732667 (+)
G2288268 NA non-coding upstream 89663 1698395 ~ 1698604 (+)
G2288250 NA non-coding upstream 95628 1692390 ~ 1692639 (+)
G2288334 NA non-coding downstream 13898 1843342 ~ 1848514 (+)
G2288335 NA non-coding downstream 14275 1843719 ~ 1845066 (+)
G2288336 NA non-coding downstream 17368 1846812 ~ 1848257 (+)
G2288340 NA non-coding downstream 27884 1857328 ~ 1878374 (+)
G2288344 NA non-coding downstream 33848 1863292 ~ 1867092 (+)
G2287973 NA other upstream 514097 1273374 ~ 1274170 (+)
G2287470 NA other upstream 1300606 486793 ~ 487661 (+)
rpl30 LOC106589133 other upstream 1547627 233676 ~ 240640 (+)
G2288669 NA other downstream 492430 2321874 ~ 2324182 (+)
G2288814 NA other downstream 551003 2380447 ~ 2381395 (+)
G2289325 NA other downstream 1230998 3060442 ~ 3060779 (+)
G2290395 NA other downstream 2619445 4448889 ~ 4449571 (+)

Expression


Co-expression Network