G2289049


Basic Information

Item Value
gene id G2289049
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050572.1
NCBI id CM025859.1
chromosome length 41837469
location 2893647 ~ 2902038 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2617722
atgatggttccactgtctattactgtcagttatatacaacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatacacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatatacaacaacatgatgatgatggttctactgtgtattactgtcagttatatacaacaacatgatgatggttccactgtctattactgtcagttatatacaacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatacacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatatacaacaacatgatgatgatggttctactgtgtattactgtcagttatatacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatatacaacatgatgatggttccactgtgtatta
>TU2617723
atgatggttccactgtctattactgtcagttatatacaacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatacacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatatacaacaacatgatgatgatggttctactgtgtattactgtcagttatatacaacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatacacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatatacaacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatatacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatataccacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatatacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatatacaacaacatgatgatggttccactatgtattactgtcagttatatacaacatgatgatggttccactatgtattactgtcagttatatacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatatacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatatacaacaacatgatggttccactgtgtattactgtcagttatatacaacatgatgatggttccactgtgtattactgtcagttatatacaacatgatgatggttc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2617722 False 430 lncRNA 0.35 4 2893647 2902038
TU2617723 True 719 lncRNA 0.35 3 2893647 2901044

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110487826 znf519 coding upstream 6863 2883928 ~ 2886784 (+)
LOC110487823 LOC106570755 coding upstream 48081 2816476 ~ 2845566 (+)
pip4p2 LOC106570754 coding upstream 93455 2766685 ~ 2800192 (+)
cbfa2t2 runx1t1 coding upstream 207615 2525059 ~ 2686032 (+)
triqk triqk coding upstream 638528 2209019 ~ 2255119 (+)
angpt2b LOC106570762 coding downstream 28106 2930144 ~ 2992088 (+)
LOC118946537 NA coding downstream 258180 3160218 ~ 3181800 (+)
pef1 pef1 coding downstream 2100940 5002978 ~ 5011804 (+)
smim12 smim12 coding downstream 2112511 5014549 ~ 5018314 (+)
dlgap3 dlgap3 coding downstream 2393771 5113201 ~ 5412625 (+)
G2289032 NA non-coding upstream 14504 2877793 ~ 2879143 (+)
G2289026 NA non-coding upstream 53929 2839117 ~ 2839718 (+)
G2289040 NA non-coding upstream 58227 2834779 ~ 2835420 (+)
G2289029 NA non-coding upstream 71494 2821890 ~ 2822153 (+)
G2289010 NA non-coding upstream 104419 2788802 ~ 2789228 (+)
G2289054 NA non-coding downstream 6949 2908987 ~ 2910020 (+)
G2289249 NA non-coding downstream 25543 2927581 ~ 2927929 (+)
G2289256 NA non-coding downstream 29120 2931158 ~ 2931368 (+)
G2289257 NA non-coding downstream 29339 2931377 ~ 2931593 (+)
G2289260 NA non-coding downstream 38365 2940403 ~ 2940634 (+)
G2288814 NA other upstream 512252 2380447 ~ 2381395 (+)
G2288669 NA other upstream 569465 2321874 ~ 2324182 (+)
G2287973 NA other upstream 1619477 1273374 ~ 1274170 (+)
G2287470 NA other upstream 2405986 486793 ~ 487661 (+)
G2289325 NA other downstream 158404 3060442 ~ 3060779 (+)
G2290395 NA other downstream 1546851 4448889 ~ 4449571 (+)
G2290455 NA other downstream 1644866 4546904 ~ 4548844 (+)

Expression


Co-expression Network