G2289575


Basic Information

Item Value
gene id G2289575
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050572.1
NCBI id CM025859.1
chromosome length 41837469
location 3503554 ~ 3515983 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2618353
tggtggtctatatctgacatggtacaggtggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctggcatggtacagGtagtctatatctgacatggtacaggtggtggtctatatctgacatggtacaggtggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatagtacaggtggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatc
>TU2618349
GtgcaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtttaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtggtctatatctgacatggtacaaGtagtctatatctgacatggtacaggtggtggtctatatctgacatggtacaggtggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatagtacaggtggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatctgacatggtacaggtggtggtctatatctgacatggtacaggtggtctatatc

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106590678

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2618353 False 532 lncRNA 0.45 2 3503554 3515983
TU2618349 True 511 lncRNA 0.44 3 3509590 3515983

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118946537 NA coding upstream 321754 3160218 ~ 3181800 (+)
angpt2b LOC106570762 coding upstream 511466 2930144 ~ 2992088 (+)
LOC110487826 znf519 coding upstream 616770 2883928 ~ 2886784 (+)
LOC110487823 LOC106570755 coding upstream 657988 2816476 ~ 2845566 (+)
pip4p2 LOC106570754 coding upstream 703362 2766685 ~ 2800192 (+)
pef1 pef1 coding downstream 1486995 5002978 ~ 5011804 (+)
smim12 smim12 coding downstream 1498566 5014549 ~ 5018314 (+)
dlgap3 dlgap3 coding downstream 1779826 5113201 ~ 5412625 (+)
LOC110513117 LOC106589108 coding downstream 1993018 5509001 ~ 5525069 (+)
LOC110489357 slc6a19 coding downstream 2076129 5592112 ~ 5615373 (+)
G2289564 NA non-coding upstream 18683 3483859 ~ 3484871 (+)
G2289548 NA non-coding upstream 55232 3447080 ~ 3448322 (+)
G2289546 NA non-coding upstream 60089 3442871 ~ 3443465 (+)
G2289539 NA non-coding upstream 84620 3417919 ~ 3418934 (+)
G2289538 NA non-coding upstream 85937 3417417 ~ 3417617 (+)
G2289607 NA non-coding downstream 65573 3581556 ~ 3581902 (+)
G2289635 NA non-coding downstream 119715 3635698 ~ 3636126 (+)
G2289644 NA non-coding downstream 146426 3662409 ~ 3662853 (+)
G2289663 NA non-coding downstream 196348 3712331 ~ 3758731 (+)
G2289671 NA non-coding downstream 213057 3729040 ~ 3730528 (+)
G2289325 NA other upstream 442775 3060442 ~ 3060779 (+)
G2288814 NA other upstream 1122159 2380447 ~ 2381395 (+)
G2288669 NA other upstream 1179372 2321874 ~ 2324182 (+)
triqk triqk other upstream 1248481 2209019 ~ 2255119 (+)
G2287973 NA other upstream 2229384 1273374 ~ 1274170 (+)
G2290395 NA other downstream 932906 4448889 ~ 4449571 (+)
G2290455 NA other downstream 1030921 4546904 ~ 4548844 (+)
G2291194 NA other downstream 1900849 5416832 ~ 5418238 (+)

Expression


Co-expression Network