G2292604


Basic Information

Item Value
gene id G2292604
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050572.1
NCBI id CM025859.1
chromosome length 41837469
location 7116778 ~ 7118313 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2622096
GTCTAATGaatccactgtctaatgtatccactgtctaactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgaaTCCACTGTCTAATGaatccactgtctaatgtatccactgtctaactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgaaTCCACTGTCTAATGAAtccactgtctaactgtctaatgtatccactgtctaatgtacCTACtttctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgtacCTACtttctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaactgtctaatgtatccactgccTAATGTATCagctgtctaatgtatccactgtctaactgtctaatgtatccactgtctaatgtatctactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctactgtatccactgtctaactgtctaatgtatccactgtctaatgatccactgtctaactgtctaacgtatctactgtctgatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtcttaTGGAtcaactgtctaactgtctaacgtatctactgtctgatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaactctctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaactgtctagtgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaactgtatagtgtatccactgtctaactgtctaatgtatccactgtctaatgtatctactgtctaatgtatccactgtctaatgtatctactgtctaatgtatctactgtctaatgtatctactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaactgtctaatgtatccactgtctaactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccatcCATGTCTGTATCCAccgtctaatgtatccactgtctaatgtatccaatGTCTAATGaatccactgtctaatgtatccactgtctaatagtctaatgtatccactgtctaatgtatcagctgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatatACCTACtttctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgccTAATGTATCagctgtctaatgtatccactgtctaatgtatccgcTGTCTAATGTATCTACTGTCTAATGTATCTaatgtctaatgtatccactgtctaatgtacCTACtttctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgtacCTACtttctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaatgtatccactgtctaactgtctaatgt

Function

NR:

description
PREDICTED: ice nucleation protein-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2622096 True 1496 lncRNA 0.37 2 7116778 7118313

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110487852 LOC106570703 coding upstream 72019 7016230 ~ 7044759 (+)
LOC110487851 LOC106570704 coding upstream 174422 6916989 ~ 6943817 (+)
LOC118946508 NA coding upstream 180284 6935352 ~ 6936494 (+)
LOC110489360 LOC105005722 coding upstream 249255 6803033 ~ 6867523 (+)
LOC110487847 LOC106570705 coding upstream 439804 6651464 ~ 6676974 (+)
LOC110487858 LOC106589075 coding downstream 409050 7527363 ~ 7563955 (+)
LOC110487859 LOC106570693 coding downstream 453537 7571850 ~ 7590800 (+)
LOC110489363 LOC106589070 coding downstream 683578 7801891 ~ 7846316 (+)
LOC118946479 NA coding downstream 760826 7878210 ~ 7881862 (+)
e2f3 LOC106570699 coding downstream 779348 7897661 ~ 7920212 (+)
G2292603 NA non-coding upstream 184 7116323 ~ 7116594 (+)
G2292445 NA non-coding upstream 4117 7109557 ~ 7112661 (+)
G2292385 NA non-coding upstream 125731 6990633 ~ 6991047 (+)
G2292380 NA non-coding upstream 146716 6969793 ~ 6970062 (+)
G2292376 NA non-coding upstream 152245 6964324 ~ 6964533 (+)
G2292639 NA non-coding downstream 41375 7159688 ~ 7160039 (+)
G2292650 NA non-coding downstream 51671 7169984 ~ 7170212 (+)
G2292660 NA non-coding downstream 61494 7179807 ~ 7180290 (+)
G2292662 NA non-coding downstream 63986 7182299 ~ 7182679 (+)
G2292664 NA non-coding downstream 68720 7187033 ~ 7187293 (+)
G2292347 NA other upstream 233612 6882377 ~ 6883166 (+)
G2291541 NA other upstream 800081 6308136 ~ 6316697 (+)
G2291498 NA other upstream 955059 6161078 ~ 6161719 (+)
G2291490 NA other upstream 968532 6147824 ~ 6148246 (+)
wipf3 NA other upstream 1367320 5724270 ~ 5749736 (+)
G2292666 NA other downstream 71939 7190252 ~ 7190850 (+)
G2293172 NA other downstream 728366 7846541 ~ 7847462 (+)
G2293430 NA other downstream 957374 8075687 ~ 8078381 (+)
G2293464 NA other downstream 987315 8105628 ~ 8106009 (+)

Expression


Co-expression Network