G2294764


Basic Information

Item Value
gene id G2294764
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050572.1
NCBI id CM025859.1
chromosome length 41837469
location 9801864 ~ 9803898 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2624776
AATGATATGTTGAGTGATGTGATTGATGTATATTTAGTCAATGATATGTTGAGTGATGTGAGTGATGTATATTTAGTCAATGAAGCGCAGGTgatatgtatgtttgtgtgtgtatgtctgtgttcgAGTGTGTGAacacgtgcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcttaataGTGTGAGCGCATGCCTGCGTGTGTTGAGAGCACAGCGCCACAGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGACTGATGTGATATAGAAACATCGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACAGACGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAGACATCGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAGACATCGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAAACATCGATCGTAGTTAATACCACAGACTGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAAACATCGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAAACATCGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAAACATCGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGACTGATGTGATATAGAAACATTGATCGTAGTTAATACCACAGACTGATGTGATATAGAG
>TU2624777
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>TU2624779
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>TU2624780
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Function

NR:

description
PREDICTED: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2624776 False 1145 lncRNA 0.36 2 9801864 9803898
TU2624777 False 423 lncRNA 0.39 2 9801864 9803898
TU2624779 False 943 lncRNA 0.37 3 9801864 9803898
TU2624780 True 1527 lncRNA 0.36 3 9801864 9803898

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110487884 LOC106570642 coding upstream 177169 9622027 ~ 9624695 (+)
cck-t cck-t coding upstream 228084 9568052 ~ 9573780 (+)
LOC110489367 LOC106570646 coding upstream 269202 9489794 ~ 9532662 (+)
LOC110487883 LOC106570652 coding upstream 372176 9410313 ~ 9429688 (+)
LOC110487882 LOC106570647 coding upstream 415520 9382727 ~ 9386344 (+)
LOC110487893 LOC106570636 coding downstream 245298 10049196 ~ 10064026 (+)
LOC118946535 NA coding downstream 287405 10091303 ~ 10092528 (+)
LOC118946540 NA coding downstream 518135 10318805 ~ 10323588 (+)
LOC110513484 LOC106570612 coding downstream 600474 10404372 ~ 10427604 (+)
si:ch211-199g17.9 syce1 coding downstream 633779 10437677 ~ 10441669 (+)
G2294758 NA non-coding upstream 664 9800482 ~ 9801200 (+)
G2294780 NA non-coding upstream 5921 9795623 ~ 9795943 (+)
G2294778 NA non-coding upstream 8014 9792361 ~ 9793850 (+)
G2294776 NA non-coding upstream 14367 9787286 ~ 9787497 (+)
G2294775 NA non-coding upstream 14727 9786920 ~ 9787137 (+)
G2294763 NA non-coding downstream 5033 9808931 ~ 9809553 (+)
G2294840 NA non-coding downstream 71063 9874961 ~ 9875194 (+)
G2294769 NA non-coding downstream 72717 9876615 ~ 9877272 (+)
G2294757 NA non-coding downstream 74922 9878820 ~ 9879387 (+)
G2294856 NA non-coding downstream 125066 9928964 ~ 9929854 (+)
G2294452 LOC106570648 other upstream 464109 9335335 ~ 9337755 (+)
G2294081 NA other upstream 698678 9094792 ~ 9103186 (+)
G2293943 LOC106570655 other upstream 954612 8844013 ~ 8847252 (+)
G2293942 NA other upstream 1006362 8791101 ~ 8876464 (+)
G2293829 NA other upstream 1290123 8510872 ~ 8511770 (+)
G2294925 NA other downstream 326218 10130116 ~ 10131651 (+)
LOC110487904 snrpd1 other downstream 711056 10509464 ~ 10521398 (+)
G2296150 LOC106570575 other downstream 1481595 11285493 ~ 11290303 (+)
G2296278 NA other downstream 1759649 11563547 ~ 11564590 (+)

Expression


Co-expression Network