G2300716


Basic Information

Item Value
gene id G2300716
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050572.1
NCBI id CM025859.1
chromosome length 41837469
location 16425942 ~ 16429571 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2631929
GGATATGGGTCCTACCTCTGATCtgtttgaggtatagagtagattgggtggtattatctgtttgaggtatagagtagcttggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagcttggatggtattatctgtttgagGTATAGAGAAGCTTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTATAGAGTAGattggatggtattatctgtttgaggtataaagtagattggatggtattatctgtttgaggtaTAGAGAAGCTTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTATAGAGTAGattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagcttggatggtattatctgtttgaggtgtagagtagattggatggtattatctgtttgaggtgtagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagaatagattggatggtattatctgtttgaggtatagaatagattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagaatagattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagaatagattggatggtattatctgtttgaggtgtagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagcttggatggtattatctgtttgaggtatagagtagATTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTGTAGAGTAGattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagcttggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattgggtggtataataggtttgaggtatagagtagcttggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtgtagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagcttgggtggtataataggtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtgtagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattgggtggtataataggtttgaggtatagagtagcttggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtgtagagtagattggatggtataataggtttgaggtatagagtagcttggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagcttgggtggtataataggtttgaggtatagagtagcttggatggtattatctgtttgaggtaTAAAGTAGATTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTATAGAGTAGCTTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTATAGAGTAGCttggatggtattatctgtttgaggtaTAAAGTAGATTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTATAGAGTAGCttggatggtattatctgtttgaggtatagagtagTTTGGTGGTATAATAGGTTTGAGgtatagagtagCTTGGATGGTATAATAGGTTTGAGGTATAGAGTAGattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtGTAGAGTAGTTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTATAGAGTAGCTTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTTTAGAGTAGCTTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTATAGAGTAGCTTGGGtggtattatctgtttgaggtatagagtagCTTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTATAGAGTAGTTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTATAGAGTAGCTTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTATAGAGTAGCTTCGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTATAGAGTAGattggatggtattatctgtttgaggtatagagtagCTTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTTTAGAGTAGCTTGGGtggtattatctgtttgaggtatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtTTAGAGTAGCTTGGGTGGTATAATAGGTTTGAGGTTTAGAGTAGattggatggtattatctgtttgagttatagagtagattggatggtattatctgtttgaggtatagaatagattggatggtattatctgtttg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2631929 True 2371 lncRNA 0.36 7 16425942 16429571

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110488013 LOC106570470 coding upstream 74899 16228573 ~ 16351043 (+)
dss1 NA coding upstream 213105 16203473 ~ 16252597 (+)
LOC118946491 NA coding upstream 262515 16146868 ~ 16163427 (+)
LOC110488010 LOC106570474 coding upstream 282156 16141291 ~ 16143786 (+)
LOC110488007 chrc1 coding upstream 327888 16093098 ~ 16098054 (+)
LOC110488016 LOC106570467 coding downstream 33992 16463563 ~ 16487955 (+)
LOC110488017 LOC106570464 coding downstream 174028 16603599 ~ 16639641 (+)
LOC110488019 LOC106570458 coding downstream 355762 16785333 ~ 16788539 (+)
LOC110488022 tfpi2 coding downstream 401137 16827065 ~ 16834652 (+)
calcr LOC106588943 coding downstream 417163 16846734 ~ 16955570 (+)
G2300692 NA non-coding upstream 37017 16387767 ~ 16388925 (+)
G2300684 LOC100380667 non-coding upstream 51616 16365399 ~ 16374326 (+)
G2300686 NA non-coding upstream 54788 16370789 ~ 16371154 (+)
G2300670 NA non-coding upstream 78840 16330720 ~ 16347102 (+)
G2300671 NA non-coding upstream 83151 16336504 ~ 16342791 (+)
G2300727 NA non-coding downstream 24551 16454122 ~ 16455724 (+)
G2300701 NA non-coding downstream 36025 16465596 ~ 16466173 (+)
G2300738 NA non-coding downstream 37693 16467264 ~ 16467787 (+)
G2300739 NA non-coding downstream 38426 16467997 ~ 16468196 (+)
G2300740 NA non-coding downstream 45055 16474626 ~ 16474836 (+)
G2300406 NA other upstream 543781 15880681 ~ 15882161 (+)
G2300167 NA other upstream 1008435 15417226 ~ 15417507 (+)
LOC110487981 LOC106570537 other upstream 1267401 15131738 ~ 15188805 (+)
G2299643 trmt13 other upstream 1398810 15023633 ~ 15028263 (+)
G2301452 NA other downstream 94939 16524510 ~ 16525394 (+)
G2301522 LOC106570460 other downstream 240036 16669607 ~ 16693934 (+)

Expression


Co-expression Network