G2304575


Basic Information

Item Value
gene id G2304575
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050572.1
NCBI id CM025859.1
chromosome length 41837469
location 19784584 ~ 19788459 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2636330
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>TU2636332
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>TU2636333
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>TU2636334
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>TU2636335
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>TU2636337
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Function

NR:

description
PREDICTED: 60S acidic ribosomal protein P1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2636330 False 2944 lncRNA 0.41 3 19784584 19788459
TU2636332 False 519 lncRNA 0.50 4 19784584 19788459
TU2636333 False 2953 lncRNA 0.41 3 19784584 19788459
TU2636334 False 448 lncRNA 0.47 4 19784584 19788459
TU2636335 False 2945 lncRNA 0.40 3 19784584 19788459
TU2636337 True 446 lncRNA 0.47 4 19784584 19788459

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ptk2aa LOC106570401 coding upstream 145 19607978 ~ 19784439 (+)
LOC118946534 NA coding upstream 4271 19777269 ~ 19780313 (+)
dennd3a dennd3 coding upstream 181760 19553190 ~ 19602824 (+)
LOC110488054 LOC106570404 coding upstream 245576 19467830 ~ 19539008 (+)
trpn1 LOC106570405 coding upstream 355067 19384584 ~ 19429517 (+)
LOC118946489 NA coding downstream 205683 19994142 ~ 20001374 (+)
LOC118946542 NA coding downstream 926610 20715069 ~ 20719092 (+)
ccdc127b ccdc127 coding downstream 1414633 21203092 ~ 21205705 (+)
LOC110488068 cfap69 coding downstream 1434462 21222921 ~ 21231008 (+)
LOC110488070 NA coding downstream 1444884 21233278 ~ 21238489 (+)
G2304585 NA non-coding upstream 26380 19668174 ~ 19758204 (+)
G2304651 NA non-coding upstream 29898 19754157 ~ 19754686 (+)
G2304491 NA non-coding upstream 329133 19454741 ~ 19455451 (+)
G2304434 NA non-coding upstream 439769 19335218 ~ 19344815 (+)
G2304658 NA non-coding downstream 4811 19793270 ~ 19793691 (+)
G2304659 NA non-coding downstream 5454 19793913 ~ 19795081 (+)
G2304703 NA non-coding downstream 94726 19883185 ~ 19924959 (+)
G2304816 NA non-coding downstream 272208 20060667 ~ 20061476 (+)
G2305932 NA non-coding downstream 751650 20540109 ~ 20540334 (+)
dgat1a LOC106570407 other upstream 424795 19354178 ~ 19379095 (+)
LOC110488049 recql4 other upstream 768991 18998633 ~ 19016439 (+)
G2303854 hsf1b other upstream 1001557 18777345 ~ 18783027 (+)
G2301841 NA other upstream 2591467 17186565 ~ 17193117 (+)
LOC110488022 tfpi2 other upstream 2950199 16827065 ~ 16834652 (+)
G2304678 NA other downstream 39758 19828217 ~ 19829961 (+)
G2305956 NA other downstream 764874 20553333 ~ 20553684 (+)
G2306173 LOC106570399 other downstream 1024730 20813189 ~ 20814298 (+)
LOC110488072 LOC106570395 other downstream 1518973 21307432 ~ 21311878 (+)
G2306688 NA other downstream 1532164 21320623 ~ 21323896 (+)

Expression


Co-expression Network