G2310300


Basic Information

Item Value
gene id G2310300
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050572.1
NCBI id CM025859.1
chromosome length 41837469
location 23654990 ~ 23657127 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2642687
gtcctctgtaactcaattagtagagcatggtcctctgtagataATTTAGTAAAACATGgacctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtcactcagttagtagaacatggtcctctgtaactcggtcagtagagcatggtcccctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtgctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaactcggttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtcctccgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtaactaaGTTAGTAGAgcgtggtcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctctgtaactcagttagtagaacatgatcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctcgtTAACTCAATTAGTAGAACATGgacctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagtttgtagaacatggtcctctgtaactcggtcagtagagcatggtcccctgtagctcagttagtagaacatggtcctctataactcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaacacagttagtagaacatggtactctgcaactcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagatcaTTTAGTAAAACATGgacctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctccgtaactcagttagtagaacatggtcctctgttaCTCAATttgtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtatctcagttagtagaacatggtcctctatgAATCAGtgagtagagcatggtcctctgtagttcagttagtagaacgtggTCCTCGGTAGATCacttagtaggacatggtcctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagagcatggcgcttgtaacGCCTGGATAGTGGGATATATTCCGGAGACCACACATACATAAAACATTTATGCACTCATGTCtgtatgtcacgtcctgaccttagttcctttgttat
>TU2642688
gtcctctgtaactcaattagtagagcatggtcctctgtagataATTTAGTAAAACATGgacctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtcactcagttagtagaacatggtcctctgtaactcggtcagtagagcatggtcccctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtgctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaactcggttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtcctccgtaactcagttagtagaacatggtcctctgttaCTCAATttgtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtatctcaattagtagagcatggtcctctgtagatcaTTTAGTAAAACATGgacctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctctgtaacacagttagtagaacatggtactctgcaactcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagatcaTTTAGTAAAACATGgacctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctccgtaactcagttagtagaacatggtcctctgttaCTCAATttgtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtatctcagttagtagaacatggtcctctatgAATCAGtgagtagagcatggtcctctgtagttcagttagtagaacgtggTCCTCGGTAGATCacttagtaggacatggtcctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagagcatggcgcttgtaacGCCTGGATAGTGGGATATATTCCGGAGACCACACATACATAAAACATTTATGCACTCATGTCtgtatgtcacgtcctgaccttagttcctttgttat
>TU2642690
gtcctctgtaactcaattagtagagcatggtcctctgtagataATTTAGTAAAACATGgacctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtcactcagttagtagaacatggtcctctgtaactcggtcagtagagcatggtcccctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtgctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaactcggttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtcctccgtaactcagttagtagaacatggtcctctgttaCTCAATttgtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtatctcaattagtagagcatggtcctctgtagatcaTTTAGTAAAACATGgacctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttattagaacatggtcctctgtaacacagttagtagaacatggtactctgcaactcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagagcatggcgcttgtaacGCCTGGATAGTGGGATATATTCCGGAGACCACACATACATAAAACATTTATGCACTCATGTCtgtatgtcacgtcctgaccttagttcctttgttat
>TU2642697
gtcctctgtaactcaattagtagagcatggtcctctgtagataATTTAGTAAAACATGgacctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtcactcagttagtagaacatggtcctctgtaactcggtcagtagagcatggtcccctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtgctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaactcggttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtcctctgtaactaaGTTAGTAGAgcgtggtcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctctgtaactcagttagtagaacatgatcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctcgtTAACTCAATTAGTAGAACATGgacctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtatctcaattagtagagcatggtcctctgtagatcaTTTAGTAAAACATGgacctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttattagaacatggtcctctgtaacacagttagtagaacatggtactctgcaactcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagatcagttagtagaacatggtcctctgtaactcagttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagaacatggtcctctgtagctcagttagtagagcatggtcctctgtagctcagttagtagagcatggcgcttgtaacGCCTGGATAGTGGGATATATTCCGGAGACCACACATACATAAAACATTTATGCACTCATGTCtgtatgtcacgtcctgaccttagttcctttgttat

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2642687 False 1442 lncRNA 0.44 4 23654990 23657127
TU2642688 False 1326 lncRNA 0.44 5 23654990 23657127
TU2642690 False 1065 lncRNA 0.43 4 23654990 23657127
TU2642697 True 1152 lncRNA 0.43 5 23654990 23657127
Loading

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110488129 LOC106570314 coding downstream 394017 23249638 ~ 23260973 (-)
LOC110488128 LOC106570315 coding downstream 412362 23227922 ~ 23242628 (-)
LOC110488126 arl4a coding downstream 429189 23222514 ~ 23225801 (-)
LOC110488123 LOC106570320 coding downstream 593562 23044620 ~ 23061428 (-)
LOC110488121 LOC106570321 coding downstream 625409 23017629 ~ 23029581 (-)
LOC110488132 LOC106570309 coding upstream 265602 23922729 ~ 23957990 (-)
umad1 LOC106588684 coding upstream 307672 23962314 ~ 23979279 (-)
LOC110488136 LOC106570288 coding upstream 374238 24031365 ~ 24042992 (-)
LOC110488134 LOC106570288 coding upstream 402280 24059407 ~ 24065425 (-)
asns LOC106570297 coding upstream 505092 24162219 ~ 24176944 (-)
G2310186 NA non-coding downstream 185181 23467295 ~ 23469809 (-)
G2310138 NA non-coding downstream 262718 23391903 ~ 23392272 (-)
G2310108 NA non-coding downstream 303757 23351002 ~ 23351233 (-)
G2310106 NA non-coding downstream 312587 23342194 ~ 23342403 (-)
G2310104 NA non-coding downstream 314459 23340319 ~ 23340531 (-)
G2310397 LOC106570311 non-coding upstream 123697 23780824 ~ 23781489 (-)
G2310404 NA non-coding upstream 137792 23794919 ~ 23796675 (-)
G2310416 NA non-coding upstream 155247 23812374 ~ 23815000 (-)
G2310460 NA non-coding upstream 224932 23882059 ~ 23883454 (-)
G2310500 NA non-coding upstream 315623 23972750 ~ 23974329 (-)
LOC118946453 NA other downstream 670856 22979779 ~ 22984566 (-)
ndufs6 LOC106570329 other downstream 769068 22883692 ~ 22886170 (-)
LOC110489405 LOC106570343 other downstream 1235652 22416566 ~ 22498043 (-)
LOC110488089 LOC106570363 other downstream 2065433 21566593 ~ 21613473 (-)
lsm10 lsm10 other downstream 2141527 21511423 ~ 21513463 (-)
G2310381 LOC106570311 other upstream 103388 23760515 ~ 23761351 (-)
G2310415 NA other upstream 159170 23816297 ~ 23818006 (-)
G2311141 NA other upstream 1505565 25162692 ~ 25163130 (-)
G2312079 LOC106582599 other upstream 2311856 25968983 ~ 25969361 (-)

Expression

G2310300 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 15.
End of interactive chart.

G2310300 Expression in each Bioproject

Bar chart with 13 bars.
G2310300 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 300.
End of interactive chart.

Co-expression Network