G2316421


Basic Information

Item Value
gene id G2316421
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050572.1
NCBI id CM025859.1
chromosome length 41837469
location 29922384 ~ 29931480 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2649449
acgaccactacaactccagaacctgttacgtcaaccactgcagctcctgctacaacaactacaacttcagctcctacgacaaccacaacagcaacaccttCAAAAACTATAGCTCCCACGACAacagcagctcctacaacaactttagcatctacttcaaccacagaagctgcccctacgacagccgctgcagccctaactacaacaactgctgctcctacgaccactacaactccagaacctactacgacaaccactgcagctcctgctacaacaactacaactttagctcctacgacaaccacaacagcaacacctacaacaactgtagctcccacgacaacagcagctcctacaacaactttagcatctacttcaaccacagaagctgcccctacgacagccgctgcagccctaactacaacaactgctgctcctacgaccactgcaacgccacaacctactacgacaaccagtgcagctcctactacaacaactgctgttcttacgaccacagtgactgcagcaccttctacaacaacaacaacaacttcagctcctacgacaaccacaacaacagtacCTACTACAACTCCTGCAGTTTCTACAACTGTAGCTACCACGACCACTCCACCTGCTGTACTTGCTACaacaatcacaactacagctcctacgtcaaccacagcagctgcctctatgacaaccatagaagctctaactacaacaactgctgctccaacgaccactacaactccagaacctattacaacaacaactgcagctcctgcaatAACAAATGCTATTCTTACAACCACTGCGACTGCAGCACTTTCTAcatcaactacaacttcagcgcctacgacaaccacaacagcaacacctacaacaactgtagctcccacgacaactgcagcgcCTACAACAACTTTAGCCTCTACTTCAACCACAGAAGCTGCCCCTATGACAACAGCttctgctcctacgaccactacaactccagaacctactacgacaaccagtgcagctcttattacaacaactgctgttctaactACTACAacgactgcagcaccttctacaacaactacaacttca
>TU2649444
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>TU2649446
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>TU2649450
ctacaacgactgctgctccaacgaccactacaactccagaacctgttacgtcaaccactgcagctcctgctacaacaactacaacttcagctcctacgacaaccacaacagcaacacctacaacaactatagctcccacgacaacagcagctcctacaacaactttagcatctacttcaaccacagaagctgcccctacgacagccgctgcagccctaactacaacaactgctgctcctacgaccactgcaacgccacaacctactacgacaaccagtgcagctcctactacaacaactgctgttctcacgaccacagtgactgcagcaccttctacaacaacaacaacaacttcagctcctacgacaaccacaacaacagtacCTACTACAACTCCTGCAGTTTCTACAACTGTAGCTACCACGACCACTCCACCTGCTGTACTTGCTACaacaatcacaactacagctcctacgTCAACAtcagcagctgcctctacgacaaccatagaagctctaactacaacaactgctgctccaacgaccactacaactccagaacctattacaacaacaactgcagctcctgcaatAACAAATGCTATTCTTACAACCACTGCGACTGCAGCACTTTCTAcatcaactacaacttcagcgcctacgacaaccacaacagcaacacctacaacaactgtagctcccacgacaactgcagcgcCTACAACAACTTTAGCCTctacaacaactatagctcccacgacaacagcagctcctacaacaactttagcatctacttcaaccacagaagctgcccctacgacagccgctgcagccctaagtacaacaactgctgctcctacagccactacaactccagaacctactacgacaaccagtgcagctcctgctacaacaactacaacttcagcccctacgacaaccacaacagcaactcctacaacaactgtagctcccacgaccacCACAC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2649449 False 1095 TUCP 0.48 4 29922384 29930951
TU2649444 False 896 lncRNA 0.48 2 29923972 29930951
TU2649446 False 896 lncRNA 0.48 2 29923972 29930951
TU2649450 True 987 lncRNA 0.49 3 29923972 29931480

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110488250 NA coding upstream 132411 29790669 ~ 29791561 (+)
LOC110489422 dus3l coding upstream 178387 29730204 ~ 29745585 (+)
LOC110488243 ifi44 coding upstream 243777 29672909 ~ 29680195 (+)
LOC110489421 NA coding upstream 266901 29655911 ~ 29657071 (+)
LOC110488242 LOC106570209 coding upstream 403298 29514675 ~ 29520674 (+)
LOC118946465 NA coding downstream 90575 30022055 ~ 30027657 (+)
LOC118946498 NA coding downstream 100127 30031607 ~ 30032059 (+)
LOC118946528 NA coding downstream 145670 30077150 ~ 30077764 (+)
LOC118946499 NA coding downstream 168221 30099701 ~ 30100390 (+)
LOC110489425 LOC106569855 coding downstream 176736 29817983 ~ 30125310 (+)
G2316352 NA non-coding upstream 86827 29814712 ~ 29837145 (+)
G2316349 NA non-coding upstream 106407 29807661 ~ 29817565 (+)
G2316350 NA non-coding upstream 108131 29812947 ~ 29815841 (+)
G2316343 NA non-coding upstream 161595 29761730 ~ 29762377 (+)
G2316355 NA non-coding upstream 180684 29743037 ~ 29743288 (+)
G2316422 NA non-coding downstream 3290 29934770 ~ 29997309 (+)
G2316423 NA non-coding downstream 14087 29945567 ~ 29947714 (+)
G2316478 NA non-coding downstream 120580 30052060 ~ 30055050 (+)
G2316479 NA non-coding downstream 133410 30064890 ~ 30068961 (+)
G2316748 NA non-coding downstream 211347 30142827 ~ 30143131 (+)
G2314987 NA other upstream 1220548 28698740 ~ 28703424 (+)
G2314887 NA other upstream 1360377 28520255 ~ 28563595 (+)
kcng2 LOC106570224 other upstream 1876638 28016566 ~ 28047334 (+)
G2313197 NA other upstream 2430237 27493099 ~ 27493735 (+)
LOC118946485 LOC106570234 other upstream 2721161 27197844 ~ 27202811 (+)
tmem79a LOC106569868 other downstream 886548 30817937 ~ 30822555 (+)
G2317455 NA other downstream 902250 30833730 ~ 30835101 (+)
G2317562 LOC100196669 other downstream 1166139 31097619 ~ 31127687 (+)
G2317685 LOC106569887 other downstream 1290637 31222117 ~ 31223562 (+)
LOC110488286 chtop other downstream 1403339 31334757 ~ 31340531 (+)

Expression


Co-expression Network