XLOC_004207 (zgc:153665)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_004207
gene name zgc:153665
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 30626768 ~ 30636163 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00008061
GTCAGCTCTTTAATAAAGCTCATCTTCATTTCTTGAGCATTCGTTCTACCTGTGCTGAAAGGACACACATATGGCAACCAACACAGGCCAGATGGGTTTCTTACCAAGCGGAGGGGCAATTTTCTGCACCATTCCTGACATCCTCTACCTTCCAGAGCTCatcTTTGGCGGCCTGACGTTGTCACTGGTGGCATCTACGTACCTCATACCTTACAACCCTCAGGCTTACGTGATTTCTGTGACAATATTTTGCTTCATCGTTAGTTTCTTCTGGTTGATGGTGTTTGCCTGTGGCTCTCATCGAAACAAAAGCTCCTGGGCAAGCGCAGATGTAGCATACCATGGATTTGCCACAGTCCTCTATCTCAGCGCATCTGTGCTTTTAGCTTTGGTAACCATTGGGATTGCTCAAATACAAACCGAAACCACACTTATTTACCAGCTGGACGTTGCTGCAGTGgtgttttcCTTCCTGACCACTTTGCTGTATTTCATCCACACCATTTTCTCAGCCATCAGATGGAAGTCTTTCTAAAAACATCTGCACTCTGACCTCACAACTGACCTTTTAAGCATGATATCttcaaaaagcaaagcaaaagacATTCAAGTGATAATAGTGTAAAATGCCTGTTTGCTCTTCACCTTTTAAGTGCATATACTATgaattttctaaaacattttctgctggtatttgttttgtaaattgttCTCACCTAAAgtataaattattacaaatatgaCTTGTATAATAAAGGAAACAATTAATAATCTCTTTGGTGTGGTGCTTCATTATAAACAAGAAAATCCTCctttattgttaaataaatgatTGTTGATTTTTACAACATTCTACTTGATTAATGTACCGCCATATCAGTCGTTATAACCATTCGTAAACAAGTGTTTGTCACGTAAATGTCtagaaaatactataaataaagcAGATGGGTGTGTCCTTATGGAATCCATCAGATCTGTCAAGATGAACAGGTCTGTCTAGCATTTTTGTCAGCTCTTTAATAGAACTTGTCTTTTGAATTCCTTAAACATTTGTTATACGTGTACTAAAAGGACACACATATGGCAACCAACACTGGCCCATTGGGTCACTTACCAAGCGGAGGGGCAATTTTCTGCATCATTCCTGACATCCTCTTCCTTCCAGAGCTTGTGAGttgatttaatttgttaaatGCTTTATGCAGGCTATGCTCCTAACTTagtttgtcaaagcagcttaacatagacatTCTGGTACATTGAAAATGTGTCACTCTAGTTTtgagagttgaagttcagtttagttcagttcagtgtgctttaatttTCACTGCAGAAAGTCCAAATACTGAAGAGAAATCTATTGATGCACACATCCCAACCAAGCAAGACAGTGGTGCCAATTGAATTTAAGTTTAGTGCAGAATCTAATATCTGttctaataactttttaaaggagaTTTTGTGGTTTTATAATGATGAtaagaatgtaaaaataaaatgttaatccaAAGCGTACACTATTAAAGTCagcttatttaaagtaattttctTAAAAACTATTGATtaggtaaataaatacatacttaAAAAGTGCTAATCTgtcatttttaaaagtgaaaaaccAACTAAAAGTCACTGTAAAATGTtagatttgtattgtattttataattaaaatgattgtataatattttacataaaaaattcaaattaaaataaaaggttaaactgaaagaaaatgataacataaaataaaagcacacacaTCTATAATCACCAAAAGTGTCCAATAGATCAGGTATTACTAATACATTTGAGAAGCTTTCATTTTCTATTTCATCTATTTTGCGTCATATTTCCATTTGTCCAATTCAGATGTTTACAAAAAACAGAGGTTTCCATCATAATTTTCATTATGTACATTAGCCTACATTTTCTTGATCAGTAACTTCAAGAACGTTATTTATTATGTTCATTTCTCAGATCTTTGGCGGTCTGACGTTGTCACTGGTGGCATCTACGTACCTCATACCTTACAACCCTCAGGCGTACGTGATTTCTGTGACAATAGCCTGCTTCCTCACTACTTTCCTGTGGTTGATGGTGTTTGTCTGTGGGTATCATCATAACAGAAAATCCTGGGCAACCGCAGTGAGTTAATAATCTCTTTACATCTTCACTTTTTTAATcgtttcttttgtgtttgatcttatatgttttgttaattttctcTCTGCAGGATGTAGCATACCATGGATGTGCCACAGTCCTCTATCTCAGCGCATCTGTGCTTTTAGCTTTGGTAACCATTGGGTGGAGTCAGCCAGATAACATGTTTTTCCTTATTTACCAGCTGGACATTGCTGCTGTGGTGAGTTTGTGTAGTCTCTTTTTAAATCGGTTTTAcctgttaaataaaaaacaattaagtaacgGTGAAATATTTGAACACGaatgaaaaagcattaatttaCAAAATCTTAAAAATTTACTGCACGTTTTAAACGTTGAAGTCTAAAGTATGTTGACTCTCTGTGTGTCTTTAATTTCAGGTTTTTTCCTTCCTGACCactttactgtatttcacccacaCCATTTTCTCAGCCTTGCGATGGAAGACCTACTAAAAGTagctttttaacttattttgcaaACCAAATGACTGCTCAACTGGCCTTTAAAGCATGATGTTTGCAAAAAGTATACTGAAAAATGCATTTAGTTCATCAGCAGTTATTCATGTGATAAATTTATGTAAAGTTTATAACAGTTAAGTTTTTTCCCTCTTCCttttcatcatattttttttgtaaattgttctTATCTCAAgtaatgttttttacatttatgacttaattaataaacaaaataataaactatCTTTTTGGTGTGGCGCttaattatataaacatatatttctttatttttaaatgaaaggttagcaagatttttttttaaactaacttGCTATTTACAAGATTCTGCTTTTACAATACCACCATAAAACTACTTTTTACTGGGAAAAAAAGACagacaaaagcaaaaaataaataaataaataaaaatgcaaatgtgaCACCCTGAGGGCGTCGTGGTTGATACCATAAGCTATTTTTGGAGCACTCTTTAGCATGAAGTTATGCggttgctcaaaaaaaaaaacgaaacatttgctgtttgttcaaactattttttatttgtatttgttcaaaccacttatttaaaataagctaaaacaacacactTATTGAGGgtttattgggacaacttaatttttttatgttttctccacttaaatttgtaaaaacttaagttaatttaattccttcattttTTAGTGCTGTGGTTTGGTGGCTTACACGTCAAAAAGACCTTAAAATATTGTTTCAAGGgcagcatgatggctcagtggttatcacaaACATCTTACAGCAAAAAATTTCACTTGTTTAAGTcccagccagttggcatttcaatgCGGAGTTTGcctttgttttatgttaaatccacttaaatttgtaaaccattaagttaacttaagcgttttgtgttggttcaactacctggttaggggatttgtagttcagcATACTTTGTGTGGGACTGAATTAAGATTgtgaaatgttgacaataaaagtaatcttatgtgtttaaagttaatagaaagacttgttagagtttaatcttcactgtagtttgaagatttagaagattttcatgtaatgctttgagaTTTGAGATTACAACCTTGCTGAAGCACCCATGCTGGGTGCATCatgggtgttggcagcttaattagcaaaaatgcagtttgttacTTTGCTCATAAAAatgagttctgagatcagtctgaatcaactgtatatgtaactcatgaaatatgcttaaaaatggctcttttagttcatttaggataactaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacgaagagaCTTCGAAATGTACGACATATAATAGACACACATgacctttgagtttaagttaaataaaaatacaaatgtacttaaacttttatttgataaaatcatgttggaccaacttgattgcatttaattgtgtaaacagttttttttttttttttaagttggtggtaaacaaatttattggatggaaatcttgccctcaattaaatttagttcatccaattgtttttttttttttttttttttttgagtgtatatgtgaactggatgaactaaattggcattGTTTTTTCAAATGGGAGTGTGTTACCCAGTTCTGGGATGCCgctggaaaggtatccgctgtgtaaaacatgctgaaaaaaaaaaaaaaaacgtttattctgctgtggcgactcctgttAAATCAGGGACTaacccaaaggaaaatgaatgaacgattgCCTCTGCATTAAATGTCCTCCAGGTCGACTAGGTAAATTGCAAATTTTTCCTCAACAATCAGCTTAATTTGCAGCTTTGCCTTAGAAGATCACAACAAATTCAGTCATTTTTAGCACTGCAGGTTTCCACCAACTCCATTTGTCTGTTCTTTGTGGTCTTGGTTAGTGGTCATCAGTGATTAGGCTGTGGGTATTTCTTCATGTCTAAGATTAAGTTGTTGTCAGTGTGTTATCGCTGTGTTATTAGATCATTGCTGGAACCACTCCAGAGTCTAGAGCCCAATTTACACCTGGTCTTAACATTACATTCATTGATCTGATCACAAGTGTTCTGAAGAGATTCATTATAGTTTCCACCTGGAATTAACCTGCGTTCAGATGCATGTCTTGTTGTCACTCCTGTTGTGGTTTCATTAAAACCCTTCCATCTTAGTTCATCTCATTCCAAAACAGTTTTGCAAGAGTGCTCATTGCAACACAAGGATACTACTAAATGACTGCTCTCACGTTACTCACAGTGGAC
>TCONS_00008062
AAACATTTGTTATACGTGTACTAAAAGGACACACATATGGCAACCAACACTGGCCCATTGGGTCACTTACCAAGCGGAGGGGCAATTTTCTGCATCATTCCTGACATCCTCTTCCTTCCAGAGCTTATCTTTGGCGGTCTGACGTTGTCACTGGTGGCATCTACGTACCTCATACCTTACAACCCTCAGGCGTACGTGATTTCTGTGACAATAGCCTGCTTCCTCACTACTTTCCTGTGGTTGATGGTGTTTGTCTGTGGGTATCATCATAACAGAAAATCCTGGGCAACCGCAGATGTAGCATACCATGGATGTGCCACAGTCCTCTATCTCAGCGCATCTGTGCTTTTAGCTTTGGTAACCATTGGGTGGAGTCAGCCAGATAACATGTTTTTCCTTATTTACCAGCTGGACATTGCTGCTGTGGTTTTTTCCTTCCTGACCactttactgtatttcacccacaCCATTTTCTCAGCCTTGCGATGGAAGACCTACTAAAAGTagctttttaacttattttgcaaACCAAATGACTGCTCAACTGGCCTTTAAAGCATGATGTTTGCAAAAAGTATACTGAAAAATGCATTTAGTTCATCAGCAGTTATTCATGTGATAAATTTATGTAAAGTTTATAACAGTTAAGTTTTTTCCCTCTTCCttttcatcatattttttttgtaaattgttctTATCTCAAgtaatgttttttacatttatgacttaattaataaacaaaataataaacta
>TCONS_00008063
aaACAACGTTTGTAACGTTAGTAAGTTTTATGATTGAGTGCCGAAAACGTTCGGACAAAATAAGCGAAAAAGCTCTTGCAAAAAGTGGTAAAGCAGAGCAAGTACGTTTCGTGACTGAAAAATCTGCAGAACCTCAACTGTCAGCTCTTTAATAAAGCTCATCTTCATTTCTTGAGCATTCGTTCTACCTGTGCTGAAAGGACACACATATGGCAACCAACACAGGCCAGATGGGTTTCTTACCAAGCGGAGGGGCAATTTTCTGCACCATTCCTGACATCCTCTACCTTCCAGAGCTCatcTTTGGCGGCCTGACGTTGTCACTGGTGGCATCTACGTACCTCATACCTTACAACCCTCAGGCTTACGTGATTTCTGTGACAATATTTTGCTTCATCGTTAGTTTCTTCTGGTTGATGGTGTTTGCCTGTGGCTCTCATCGAAACAAAAGCTCCTGGGCAAGCGCAGATGTAGCATACCATGGATTTGCCACAGTCCTCTATCTCAGCGCATCTGTGCTTTTAGCTTTGGTAACCATTGGGATTGCTCAAATACAAACCGAAACCACACTTATTTACCAGCTGGACGTTGCTGCAGTGgtgttttcCTTCCTGACCACTTTGCTGTATTTCATCCACACCATTTTCTCAGCCATCAGATGGAAGTCTTTCTAAAAACATCTGCACTCTGACCTCACAACTGACCTTTTAAGCATGATATCttcaaaaagcaaagcaaaagacATTCAAGTGATAATAGTGTAAAATGCCTGTTTGCTCTTCACCTTTTAAGTGCATATACTATgaattttctaaaacattttctgctggtatttgttttgtaaattgttCTCACCTAAAgtataaattattacaaatatgaCTTGTATAATAAAGGAAACAATTAATAA

Function

GO:

id name namespace
GO:0042552 myelination biological_process
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0019911 structural constituent of myelin sheath molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-070424-9 Predicted to be a structural constituent of myelin sheath. Predicted to be involved in myelination. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Human ortholog(s) of this gene implicated in metachromatic leukodystrophy. Orthologous to human MAL (mal, T cell differentiation protein).
ZDB-GENE-061027-365 Predicted to be a structural constituent of myelin sheath. Predicted to be involved in myelination. Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane.

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000043442 ENSDARG00000070401

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00008061 False 4908 mRNA 0.34 4 30626768 30634286
TCONS_00008062 False 753 mRNA 0.39 4 30628793 30630628
TCONS_00008063 True 910 mRNA 0.40 5 30630905 30636163

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_004206 slc8a1a coding downstream 14602 30535943 ~ 30612166 (-)
XLOC_004205 map4k3a coding downstream 117917 30365668 ~ 30508851 (-)
XLOC_004204 pecr coding downstream 261921 30355442 ~ 30364847 (-)
XLOC_004203 tmem169a coding downstream 274435 30348273 ~ 30352333 (-)
XLOC_004202 cflara coding downstream 285337 30332959 ~ 30341431 (-)
XLOC_004208 ier2b coding upstream 402246 31038409 ~ 31039533 (-)
XLOC_004209 si:cabz01069582.1 coding upstream 508557 31144720 ~ 31146808 (-)
XLOC_004210 si:dkey-238i5.3 coding upstream 532534 31168697 ~ 31172276 (-)
XLOC_004211 NA coding upstream 564056 31200219 ~ 31202839 (-)
XLOC_004212 NA coding upstream 568762 31204925 ~ 31211308 (-)
XLOC_004063 CR854846.1 misc downstream 14499090 16127382 ~ 16127678 (-)
XLOC_004019 CR450764.8 misc downstream 17935077 12691395 ~ 12691691 (-)
XLOC_004015 CR450764.4 misc downstream 18005001 12621518 ~ 12621767 (-)
XLOC_004013 CABZ01022569.1 misc downstream 18035472 12590999 ~ 12591296 (-)
XLOC_004008 BX000700.19 misc downstream 18113506 12512966 ~ 12513262 (-)
XLOC_004200 CR318645.1 non-coding downstream 525511 30101142 ~ 30101257 (-)
XLOC_004198 CU652893.1 non-coding downstream 664867 29961114 ~ 29961901 (-)
XLOC_004193 NA non-coding downstream 889521 29734578 ~ 29737247 (-)
XLOC_004190 NA non-coding downstream 1081779 29537982 ~ 29544989 (-)
XLOC_004188 NA non-coding downstream 1306849 29099927 ~ 29319919 (-)
XLOC_004216 NA non-coding upstream 1514055 32150218 ~ 32157526 (-)
XLOC_004217 NA non-coding upstream 1729749 32365912 ~ 32391388 (-)
XLOC_004218 NA non-coding upstream 1821153 32457316 ~ 32563722 (-)

Expression


Co-expression Network