G2332063


Basic Information

Item Value
gene id G2332063
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NW_023493659.1
NCBI id JAAXML020000263.1
chromosome length 2745910
location 211123 ~ 226248 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2667425
TGTGTTGTAAGAGTGTATTCAAAGAaaattcacagaggttattatcatggtatcattcacagaggttcagcagtatgttatattatcatggtgtcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcac
>TU2667426
TGTGTTGTAAGAGTGTATTCAAAGAaaattcacagaggttcaacagtatattatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcagaggttcagcagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcagcagtatgttatattatcatggtgtcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtgtcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtgtcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacaggggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcagcagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtgtcattcacaggggttcaacagtatgttatattatcatggtgtcattcacaggggttcaacagtatgttatattatcatggtgtcattcacaggggttcaacagtatgttatattatcatggtgtcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacaggggttcagcagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcagcagtatgttatattatcatggtgtcattcacagaggttcagcagtatgttatat
>TU2667427
gtatcattcacagaggttcaacagtatattatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatattatattatcatggtgtcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtgtcattcacagaggttcaacagtatattatattatcatggtatcattcacagaggttcagcagtatattatattatcatggtg
>TU2667430
gtatcattcacagaggttcaacagtatattatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatattatattatcatggtgtcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtgtcattcacagaggttcaacagtatattatattatcatggtatcattcacagaggttcagcagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtgtcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcagcagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcagcagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtgtcattcacaggggttcaacagtatgttatattatcatggtgtcattcacaggggttcaacagtatgttatattatcatggtgtcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacaggggttcagcagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcaacagtatgttatattatcatggtatcattcacagaggttcagcagtatgttatattatcatggtgtcattcacagaggttcagcagtatgttatat

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2667425 False 220 lncRNA 0.32 2 211123 218234
TU2667426 False 915 TUCP 0.34 4 211123 226248
TU2667427 False 249 lncRNA 0.32 3 216621 225889
TU2667430 True 772 TUCP 0.33 4 216621 226248

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118947009 NA coding upstream 163332 45040 ~ 47791 (+)
LOC110516484 spock3 coding upstream 166175 21703 ~ 44948 (+)
LOC118946999 med28 coding downstream 89347 315236 ~ 320283 (+)
LOC110519477 LOC105007586 coding downstream 151777 377666 ~ 410533 (+)
LOC110515074 NA coding downstream 189620 415509 ~ 469541 (+)
LOC118947011 uchl1 coding downstream 316601 542490 ~ 553415 (+)
LOC110517278 LOC106596232 coding downstream 329619 555508 ~ 648529 (+)
G2332061 NA non-coding upstream 95 205639 ~ 211028 (+)
G2332057 NA non-coding upstream 29440 180444 ~ 181683 (+)
G2332039 NA non-coding upstream 66825 142694 ~ 144298 (+)
G2332030 LOC106592645 non-coding upstream 87004 123270 ~ 124119 (+)
G2332028 NA non-coding upstream 89848 118960 ~ 121275 (+)
G2332071 LOC106592880 non-coding downstream 10144 236033 ~ 284904 (+)
G2332078 NA non-coding downstream 46177 272066 ~ 272799 (+)
G2332074 NA non-coding downstream 70274 296163 ~ 297636 (+)
G2332079 NA non-coding downstream 85685 311574 ~ 312064 (+)
G2332097 NA non-coding downstream 86815 312704 ~ 313204 (+)
G2332067 NA other downstream 2905 228794 ~ 230848 (+)
G2332406 NA other downstream 967132 1193021 ~ 1193350 (+)
G2332408 NA other downstream 971527 1197416 ~ 1198795 (+)

Expression


Co-expression Network