G2337538



Basic Information


Item Value
gene id G2337538
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NW_023493663.1
NCBI id JAAXML020000320.1
chromosome length 1654043
location 551667 ~ 553181 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU2675414
GTGTATTATTGGTGTAATGTGTGTATTATTGGTGTATTGTGCGTGTTATTGGTGTTttattggtgtattgtgtgttattggtgtattgtgtgtgttattggtgtGTTAGTGGTGTATTGGTGTATTATTGGTGCATTGTTGGTGTATTGGTGAAttattggtgtattgtgtgtgttattggtgtattGGTGAATTATTGTTGTATTATTGGTGTGTTATTGGTCTATTAgtggtgtattgtgtgttattggtgtattATTGGTGTActattggtgtattgtgtgtgttattggtgtattattggtgtgttattggtgtattgtgtgtgttattggtgtattgtgtgtattgtgtgttattgatgtgttattggtgtattgtgtgttattggtgtgttattggtgtattgtgtgtgttattggtgtattgtgtgtgttattggtgtattgtgtgtgttattggtgtgttgtgtgtgttattggtgtattgtgtgtgttattggtgtattgtgtgtattgtgtgttattgttgtgttattgtgtattattggtgtattattggtgtattattggtgtattttgtgtattattgatgtgttattggtgtattgtgtgtgttattggtgtattattggtgtattgtgtgtgttattggtgtattgtgtattattggtgtattattggtgtgttattggtgtattgtgtgtgttatttgtgtattgtgtgttttaTTGGTGTATTAtcggtgtattgtgtgtgttattggtgtattgtgtgtgttattggtgttattggtgtactgtgtgtattattggtgtattgtgtgtattattggtgtattgtgtgtgttattggtgtattgtgtgtattattgGTGTATTGTGCGTTattggtgtatagtgtgtattattggtgtattgtgtgtattattggtgtattggtgtgttattggtgtattgtgtgtgttattgGTGTATTGTGCGTTattggtgtatagtgtgtattattggtgtattgtgtgtattattggtgtattattggtgtattgtgtgtgttattggtgtattgtgtgtgttattggtgtTATTGGTGTACTGTGTGTATTATTGGTGTATTGT

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2675414 True 1117 TUCP 0.33 3 551667 553181

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110514366 drg2 coding upstream 83525 439669 ~ 468142 (+)
LOC110517035 LOC106593794 coding upstream 147060 373646 ~ 404607 (+)
LOC118947111 LOC106592188 coding upstream 186372 357340 ~ 365295 (+)
LOC110516851 LOC103393300 coding upstream 197093 303920 ~ 354574 (+)
LOC110513171 LOC106592102 coding upstream 266114 244305 ~ 285553 (+)
LOC118947105 NA coding downstream 89694 642875 ~ 712223 (+)
LOC110513986 LOC106595859 coding downstream 159325 712506 ~ 758405 (+)
LOC110516979 llgl1 coding downstream 218028 771209 ~ 871700 (+)
LOC118947106 NA coding downstream 229808 782989 ~ 785506 (+)
LOC110512918 LOC106602080 coding downstream 431107 984288 ~ 1012248 (+)
G2337558 NA non-coding upstream 4991 546428 ~ 546676 (+)
G2337550 NA non-coding upstream 31655 519194 ~ 520012 (+)
G2337542 NA non-coding upstream 78649 472752 ~ 473018 (+)
G2337530 NA non-coding upstream 97455 453742 ~ 454212 (+)
G2337531 NA non-coding upstream 102330 448446 ~ 449337 (+)
G2337560 NA non-coding downstream 10606 563787 ~ 564728 (+)
G2337566 NA non-coding downstream 20708 573889 ~ 578335 (+)
G2337570 NA non-coding downstream 29611 582792 ~ 583238 (+)
G2337578 NA non-coding downstream 102117 655298 ~ 658097 (+)
G2337580 NA non-coding downstream 105936 659117 ~ 659740 (+)
LOC110513632 LOC106593935 other upstream 366219 165852 ~ 201735 (+)
G2338043 NA other downstream 487779 1040960 ~ 1041498 (+)
G2338054 NA other downstream 517461 1070642 ~ 1083082 (+)
LOC110516613 tnrc18 other downstream 719961 1236948 ~ 1350911 (+)

Expression



Co-expression Network