G2338054


Basic Information

Item Value
gene id G2338054
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NW_023493663.1
NCBI id JAAXML020000320.1
chromosome length 1654043
location 1070642 ~ 1083082 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2676214
ctctgtgctccgggtcctctctctatgctcaggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgctctggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgctccggctcctctctctatagcccggctcctctctctatgccccggctcctctctctatagcccggctcctctctctatgccccggctcctctctctgtgctccgggtcctctctctatgctcaggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgccccggctcctctctatacgagtctgctcctctctctatgctcctcgctctatgccccggctcctctctctatgctcctctctctatgctcctcgctctatgccccggctactctctctatgctccggctcctctctctatgccccggctcctctcTCTATGCTCCGGCTACTCTCTCTGTGCCCCAgctcctcgctctatgccccggctcctttctccatgctcctctctctatgccccggctcctctctccatgctcc
>TU2676215
ctctgtgctccgggtcctctctctatgctcaggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgctctggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgctccggctcctctctctatagcccggctcctctctctatgccccggctcctctctctatagcccggctcctctctctatgccccggctcctctctctgtgctccgggtcctctctctatgctcaggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgctccggctcctccctctatagcccggctcctccctctatagcccggctcctccctctatagcccggctcctccctctatagcccggctcctccctctataacccggctcctccctctatgctcctctctctatgccccggctcctctctctatgccccggctcctctctctatgctccggctcctctctctatgccccggctcctctctctatgcctcggctcctctctctatgccccggctcctctctctatgccccggctacTCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2676214 False 607 TUCP 0.60 3 1070642 1083082
TU2676215 True 594 TUCP 0.61 2 1070642 1075570

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118947115 NA coding upstream 39292 1029815 ~ 1031671 (+)
LOC118947114 NA coding upstream 42455 1026254 ~ 1028187 (+)
LOC110512918 LOC106602080 coding upstream 58396 984288 ~ 1012248 (+)
LOC110516979 llgl1 coding upstream 198942 771209 ~ 871700 (+)
LOC110512931 cpsf4 coding downstream 57173 1140255 ~ 1172005 (+)
LOC118947107 NA coding downstream 90742 1172354 ~ 1174397 (+)
LOC118947109 slc29a4 coding downstream 117447 1200529 ~ 1226091 (+)
LOC110516613 tnrc18 coding downstream 153866 1236948 ~ 1350911 (+)
LOC110518248 fscn1 coding downstream 317831 1373105 ~ 1428734 (+)
G2338040 NA non-coding upstream 27677 1042089 ~ 1042965 (+)
G2338039 NA non-coding upstream 36742 1033408 ~ 1033900 (+)
G2337916 NA non-coding upstream 51603 1018552 ~ 1019039 (+)
G2338063 NA non-coding downstream 12395 1095477 ~ 1097419 (+)
G2338067 NA non-coding downstream 21713 1104795 ~ 1105227 (+)
G2338091 NA non-coding downstream 35270 1118352 ~ 1121192 (+)
G2338095 NA non-coding downstream 43324 1126406 ~ 1126646 (+)
G2338096 NA non-coding downstream 44677 1127759 ~ 1128721 (+)
G2338043 NA other upstream 29144 1040960 ~ 1041498 (+)
G2337538 NA other upstream 517461 551667 ~ 553181 (+)
LOC118947111 LOC106592188 other upstream 710201 357340 ~ 365295 (+)
G2338165 LOC106591863 other downstream 415596 1498678 ~ 1500451 (+)
G2338389 NA other downstream 512224 1595306 ~ 1599823 (+)

Expression


Co-expression Network