G2338426


Basic Information

Item Value
gene id G2338426
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NW_023493664.1
NCBI id JAAXML020000507.1
chromosome length 1504970
location 26748 ~ 35120 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2676827
actatatcaactatattatgacagaccagctagatctacaatctctatgatattacgacagaccagctagagaaactgtctctattaaattacaacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtctctattatattataacagaccagctagatctaaaaTCTCTatgatattacgacagaccagctagagaaactgtctctattaaattacaacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctggatctactgtatctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattacattatgacagaccagctggatctactgtgtctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattaaaatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctgttatattatgaccagccagacatactgtctctattataatatgacagaccagctagatttacaaTCTCTATGATATTACGATAGACCATCTAGAgaaactgtctctattaaattacaacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattatattatgacagaccagctagatctactgttactactatattatgacagaccagctagatctactatatcaactatattatgacagaccagctagatctacaatctCTATGATATTACGATAGACCATCTAGAgaaactgtctctattaaattacaacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattatattatgacagaccagctagatctactgttactactatattatgacagaccagctagatctactatatcaactatattatgacagaccagctagatctacaatctctatgatattacgacagaccagctagagaaactgtctctattaaattacaacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtctctattatattataacagaccagctagatctaaaaTCTCTatgatattacgacagaccagctagagaaactgtctctattaaattatgacagaccagctggatctactgtatctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctggatctactgtgtctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattaaaatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctggatctactgtgtctattataatatgac
>TU2676816
gtctcaattatattatgacagagcagctagatatattgtatctatgatattacgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattaaaatatgacagaccagctagatctactgtctctatgatattacgacagaccagctagatctactgtctattacattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattacattatgacagaccagctggatctactgtctctattatattatgacagaccagctggatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatcgactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgaccagccagacatactgtctcgattataatatgacagaccagctagatctgctgtctctattatattataacagaccagctagagaaactgtctctattaaatcacaacagaccagctagatctactgtctctattttaatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattaaaatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatatactgtcactactatattatgacagacctgcaagatctactatatctactatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagagcagctagatatactgtctctattataatatgacagaccagctagatctgctgtctctattaaagtatgacagaccagctagatctactgtctctgttatattatgaccagccagacatactgtctctattataatatgacagaccagctagatttacaaTCTCTATGATATTACGATAGACCATCTAGAgaaactgtctctattaaattacaacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattatattatgacagaccagctagatctactgttactactatattatgacagaccagctagatctactatatcaactatattatgacagaccagctagatctacaatctctatgatattacgacagaccagctagagaaactgtctctattaaattacaacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtctctattatattataacagaccagctagatctaaaaTCTCTatgatattacgacagaccagctagagaaactgtctctattaaattacaacagaccagctggatctactgtctctattaaaatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacaggccagctggatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattcttttATGAcataccagctagatctactgtctctattaaaatatgacagaccagctagatctgctgtctctaatatattatgacagaccagctggatctactgtctctatattatgacagaccagctagatctactgtcactactatattatgacagacctgcaatatctactatatctactatattatgacagaccaactacatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2676827 False 1498 lncRNA 0.35 3 26748 34241
TU2676816 True 1833 lncRNA 0.36 5 31812 35120

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118947117 NA coding upstream 12503 47623 ~ 51453 (-)
LOC110511686 LOC106591320 coding upstream 18025 52434 ~ 118089 (-)
prpsap2 LOC103393631 coding upstream 212231 247351 ~ 293320 (-)
LOC110511701 traf7 coding upstream 411380 446215 ~ 512472 (-)
LOC110517482 fscn1 coding upstream 745646 780766 ~ 808870 (-)
G2338431 NA non-coding upstream 7308 42428 ~ 43093 (-)
G2338585 NA non-coding upstream 21202 56322 ~ 56588 (-)
G2338586 NA non-coding upstream 21568 56688 ~ 57377 (-)
G2338601 NA non-coding upstream 66294 101414 ~ 102762 (-)
G2338590 NA other upstream 149257 184377 ~ 186655 (-)
G2338672 NA other upstream 343059 378179 ~ 378883 (-)

Expression


Co-expression Network